More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU3112 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU3112  cell division protein FtsK, putative  100 
 
 
745 aa  1499    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.711537  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4056  cell divisionFtsK/SpoIIIE  72.88 
 
 
774 aa  1053    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4392  cell divisionFtsK/SpoIIIE  74.36 
 
 
757 aa  1084    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0647  FtsK-like cell division protein  58.18 
 
 
751 aa  814    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.212332  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0367  DNA translocase FtsK  85.77 
 
 
760 aa  1235    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.219387  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3598  cell divisionFtsK/SpoIIIE  62.82 
 
 
814 aa  947    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0308557  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3475  cell divisionFtsK/SpoIIIE  67.54 
 
 
780 aa  937    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.149378  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3970  cell divisionFtsK/SpoIIIE  72.22 
 
 
774 aa  1057    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.146887  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2586  cell divisionFtsK/SpoIIIE  49.34 
 
 
716 aa  645    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0701867  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1598  cell divisionFtsK/SpoIIIE  48.38 
 
 
734 aa  625  1e-178  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1827  cell divisionFtsK/SpoIIIE  46.61 
 
 
789 aa  598  1e-169  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.346925  hitchhiker  0.00000783388 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2423  cell divisionFtsK/SpoIIIE  45.6 
 
 
779 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2004  DNA translocase FtsK  47.82 
 
 
769 aa  583  1.0000000000000001e-165  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1038  cell divisionFtsK/SpoIIIE  46.97 
 
 
770 aa  581  1e-164  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.262432  normal  0.648604 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0936  cell divisionFtsK/SpoIIIE  45.05 
 
 
769 aa  580  1e-164  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.470674  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3179  cell divisionFtsK/SpoIIIE protein  44.4 
 
 
801 aa  579  1e-164  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.015663 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3441  DNA translocase FtsK  46.9 
 
 
771 aa  579  1e-164  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.639772 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0496  cell divisionFtsK/SpoIIIE  45.18 
 
 
769 aa  580  1e-164  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0835  cell divisionFtsK/SpoIIIE  45.36 
 
 
769 aa  581  1e-164  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0975  cell divisionFtsK/SpoIIIE  45.18 
 
 
769 aa  580  1e-164  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4078  DNA translocase FtsK  45.42 
 
 
769 aa  578  1.0000000000000001e-163  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0847  cell divisionFtsK/SpoIIIE  44.79 
 
 
769 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0635  cell division FtsK/SpoIIIE  45.54 
 
 
755 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3349  cell division protein FtsK  44.71 
 
 
801 aa  574  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.293432  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6703  cell division FtsK/SpoIIIE  56.83 
 
 
934 aa  573  1.0000000000000001e-162  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2593  cell division protein FtsK  44.33 
 
 
804 aa  570  1e-161  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0764  cell divisionFtsK/SpoIIIE  42.98 
 
 
821 aa  571  1e-161  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30290  cell division protein FtsK  43.84 
 
 
811 aa  570  1e-161  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3586  DNA translocase FtsK  44.15 
 
 
802 aa  568  1e-160  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.345612  normal  0.877838 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1933  cell divisionFtsK/SpoIIIE  46.35 
 
 
786 aa  568  1e-160  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.440835  normal  0.487385 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1295  DNA translocase FtsK  45.77 
 
 
768 aa  563  1.0000000000000001e-159  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.65138  normal  0.354851 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1519  cell divisionFtsK/SpoIIIE  44.68 
 
 
786 aa  563  1.0000000000000001e-159  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1124  DNA translocase FtsK  46.06 
 
 
765 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.530393 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0546  cell divisionFtsK/SpoIIIE  44.72 
 
 
733 aa  562  1.0000000000000001e-159  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.803279  hitchhiker  0.0000950013 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2720  cell divisionFtsK/SpoIIIE  46.35 
 
 
776 aa  562  1.0000000000000001e-159  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3382  DNA translocase FtsK  46.33 
 
 
776 aa  562  1.0000000000000001e-159  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.265787 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06128  DNA translocase FtsK  46.65 
 
 
786 aa  561  1e-158  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.185359  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3043  DNA translocase FtsK  44.99 
 
 
768 aa  560  1e-158  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.517068  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2990  DNA translocase FtsK  44.99 
 
 
822 aa  559  1e-158  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2122  cell division protein FtsK  44.99 
 
 
822 aa  559  1e-158  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.204581  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3077  cell division ftsk transmembrane protein  44.99 
 
 
822 aa  559  1e-158  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.737589  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0790  cell division protein FtsK  44.99 
 
 
822 aa  559  1e-158  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1561  cell division protein FtsK  45.13 
 
 
819 aa  560  1e-158  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1990  cell division protein FtsK  44.99 
 
 
768 aa  560  1e-158  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01038  DNA translocase FtsK  46.65 
 
 
786 aa  561  1e-158  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.37301  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2622  cell division protein FtsK  44.99 
 
 
768 aa  560  1e-158  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.436072  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3408  cell divisionFtsK/SpoIIIE  43.79 
 
 
819 aa  561  1e-158  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.336852 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4004  cell divisionFtsK/SpoIIIE  42.63 
 
 
834 aa  556  1e-157  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00500623 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3609  cell divisionFtsK/SpoIIIE  42.7 
 
 
807 aa  556  1e-157  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1285  cell divisionFtsK/SpoIIIE  44.64 
 
 
799 aa  557  1e-157  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.139445  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0176  cell division FtsK/SpoIIIE  44.19 
 
 
776 aa  557  1e-157  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0793  cell division protein  44.5 
 
 
784 aa  558  1e-157  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1829  cell divisionFtsK/SpoIIIE  42.93 
 
 
831 aa  557  1e-157  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0290854 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0704  cell divisionFtsK/SpoIIIE  44.11 
 
 
784 aa  557  1e-157  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2944  DNA translocase FtsK  44.18 
 
 
808 aa  556  1e-157  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1695  cell division protein FtsK, putative  44.03 
 
 
844 aa  552  1e-156  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1300  cell divisionFtsK/SpoIIIE  54.23 
 
 
853 aa  549  1e-155  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.728533 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1693  DNA translocase FtsK  43.5 
 
 
782 aa  551  1e-155  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.782698  normal  0.477366 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3235  DNA translocase FtsK  42.36 
 
 
840 aa  549  1e-155  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2152  cell divisionFtsK/SpoIIIE  44.99 
 
 
781 aa  551  1e-155  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.356378  normal  0.85601 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2556  cell divisionFtsK/SpoIIIE  45.3 
 
 
781 aa  551  1e-155  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1823  putative cell division protein FtsK  53.65 
 
 
874 aa  545  1e-154  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.603207  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1730  hypothetical protein  42.84 
 
 
794 aa  547  1e-154  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2388  DNA translocase FtsK  43.07 
 
 
802 aa  547  1e-154  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0162583 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1764  cell divisionFtsK/SpoIIIE  44.29 
 
 
763 aa  543  1e-153  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.947558  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1895  cell division protein FtsK, putative  53.65 
 
 
854 aa  545  1e-153  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.627487  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1730  hypothetical protein  42.45 
 
 
794 aa  543  1e-153  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2600  DNA translocase FtsK  44.14 
 
 
774 aa  543  1e-153  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0960  cell divisionFtsK/SpoIIIE  53.47 
 
 
858 aa  545  1e-153  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0093  FtsK/SpoIIIE family protein  43.51 
 
 
806 aa  543  1e-153  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1396  cell divisionFtsK/SpoIIIE  42.98 
 
 
837 aa  541  9.999999999999999e-153  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.840983  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0690  cell division FtsK/SpoIIIE  43.66 
 
 
770 aa  540  9.999999999999999e-153  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.159753  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0685  DNA translocase FtsK  44.3 
 
 
775 aa  541  9.999999999999999e-153  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.579249  normal  0.40602 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1712  DNA translocase FtsK  43.92 
 
 
789 aa  540  9.999999999999999e-153  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.475518  normal  0.695556 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3426  DNA translocase FtsK  44.79 
 
 
779 aa  540  9.999999999999999e-153  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.643705  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3052  cell divisionFtsK/SpoIIIE  53.23 
 
 
890 aa  538  1e-151  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0059  DNA translocase  53.01 
 
 
995 aa  538  1e-151  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.771975  hitchhiker  0.00000133062 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0378  cell divisionFtsK/SpoIIIE  43.77 
 
 
809 aa  536  1e-151  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.373989  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2900  cell division FtsK/SpoIIIE  55 
 
 
1091 aa  536  1e-151  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.694821  normal  0.686839 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0145  cell divisionFtsK/SpoIIIE  54.81 
 
 
1094 aa  533  1e-150  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.131308 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1120  DNA translocase FtsK  44.13 
 
 
777 aa  532  1e-150  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.149955 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6133  ftsK cell division protein  56.21 
 
 
954 aa  534  1e-150  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.38419  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0347  cell division FtsK/SpoIIIE  54.27 
 
 
814 aa  534  1e-150  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1495  DNA translocase FtsK  54.81 
 
 
1094 aa  533  1e-150  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0291  FtsK/SpoIIIE family protein  53.77 
 
 
872 aa  533  1e-150  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3799  DNA translocase FtsK  43.85 
 
 
781 aa  533  1e-150  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4236  ftsK cell division protein  54.94 
 
 
880 aa  532  1e-150  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4342  cell divisionFtsK/SpoIIIE  51.83 
 
 
967 aa  533  1e-150  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.285957  normal  0.716083 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0428  DNA translocase FtsK  50.69 
 
 
963 aa  529  1e-149  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2341  cell division ftsk transmembrane protein  44.26 
 
 
781 aa  529  1e-148  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.86356  normal  0.195593 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1759  cell division FtsK/SpoIIIE  44.76 
 
 
777 aa  527  1e-148  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2101  cell divisionFtsK/SpoIIIE  53.23 
 
 
871 aa  526  1e-148  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0889775  decreased coverage  0.00141598 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2673  cell divisionFtsK/SpoIIIE  53.46 
 
 
894 aa  526  1e-148  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4346  cell divisionFtsK/SpoIIIE  51.71 
 
 
931 aa  526  1e-148  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.389284  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4192  cell division FtsK/SpoIIIE  51.99 
 
 
930 aa  526  1e-148  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0601  cell divisionFtsK/SpoIIIE  39.51 
 
 
838 aa  525  1e-148  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0575901  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3137  cell divisionFtsK/SpoIIIE  55.73 
 
 
1040 aa  526  1e-148  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.321844  normal  0.346965 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4324  cell divisionFtsK/SpoIIIE  51.71 
 
 
931 aa  526  1e-148  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3557  cell divisionFtsK/SpoIIIE  53.76 
 
 
830 aa  526  1e-148  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3211  cell divisionFtsK/SpoIIIE  43.16 
 
 
818 aa  528  1e-148  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.129812  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>