More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2789 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_2789  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  100 
 
 
385 aa  769    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.183499 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5850  acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal domain protein  72.77 
 
 
380 aa  546  1e-154  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.856697 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33630  acyl-CoA dehydrogenase  65.35 
 
 
386 aa  494  1e-139  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.732719 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1814  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  69.11 
 
 
381 aa  492  9.999999999999999e-139  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.283341  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5326  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  68.59 
 
 
382 aa  484  1e-135  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.777784 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3174  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  63.28 
 
 
383 aa  473  1e-132  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0000929019  hitchhiker  0.000000000938929 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0966  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  63.45 
 
 
390 aa  468  1.0000000000000001e-131  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2377  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  65.18 
 
 
381 aa  463  1e-129  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0847683  hitchhiker  0.00260799 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2886  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  65.69 
 
 
375 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000161346  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6416  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  61.52 
 
 
381 aa  449  1e-125  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.555099  normal  0.372827 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0068  putative acyl-CoA dehydrogenase  61.88 
 
 
391 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.544206  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0525  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  62.83 
 
 
381 aa  446  1.0000000000000001e-124  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21870  acyl-CoA dehydrogenase  55.13 
 
 
391 aa  446  1.0000000000000001e-124  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.10506  normal  0.934225 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0241  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  61.4 
 
 
389 aa  442  1e-123  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2258  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  63.61 
 
 
380 aa  444  1e-123  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.157301  normal  0.10942 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1208  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  62.53 
 
 
391 aa  435  1e-121  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.166701  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4943  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  61.26 
 
 
380 aa  432  1e-120  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.218623  normal  0.894762 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0545  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  62.83 
 
 
382 aa  427  1e-118  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1476  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  61.88 
 
 
380 aa  424  1e-117  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.963789 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1242  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  59.06 
 
 
379 aa  420  1e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.176039  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2379  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  62.83 
 
 
379 aa  412  1e-114  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0099  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  58.16 
 
 
380 aa  405  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0089  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  58.16 
 
 
380 aa  405  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.372364 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0108  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  58.16 
 
 
380 aa  405  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.255375 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4016  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  58.12 
 
 
379 aa  396  1e-109  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.112227  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3341  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  48.8 
 
 
379 aa  360  2e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5488  acyl-CoA dehydrogenase  49.33 
 
 
379 aa  360  3e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.270181  hitchhiker  1.62736e-22 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5464  acyl-CoA dehydrogenase  49.6 
 
 
379 aa  360  3e-98  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000608426  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5139  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  49.33 
 
 
379 aa  355  5e-97  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5041  acyl-CoA dehydrogenase  49.07 
 
 
379 aa  355  6.999999999999999e-97  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5472  acyl-CoA dehydrogenase  49.07 
 
 
379 aa  354  1e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5519  acyl-CoA dehydrogenase  49.07 
 
 
379 aa  354  1e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.814074  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5434  acyl-CoA dehydrogenase  49.07 
 
 
379 aa  354  2e-96  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000286159 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3450  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  48.27 
 
 
380 aa  352  7e-96  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5190  acyl-CoA dehydrogenase  48.8 
 
 
379 aa  352  8.999999999999999e-96  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5586  acyl-CoA dehydrogenase  48.8 
 
 
379 aa  352  8.999999999999999e-96  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5025  butyryl-CoA dehydrogenase (short-chain acyl-CoA dehydrogenase)  48.8 
 
 
379 aa  350  2e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3862  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  47.73 
 
 
379 aa  342  5e-93  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5487  acyl-CoA dehydrogenase  45.82 
 
 
381 aa  341  1e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0302943  hitchhiker  1.44799e-22 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5191  acyl-CoA dehydrogenase  45.55 
 
 
376 aa  339  4e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5587  acyl-CoA dehydrogenase  45.55 
 
 
376 aa  339  4e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5473  acyl-CoA dehydrogenase  45.55 
 
 
376 aa  339  5e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5520  acyl-CoA dehydrogenase  45.55 
 
 
381 aa  339  5e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5026  short-chain acyl-CoA dehydrogenase; butyryl-CoA dehydrogenase  45.55 
 
 
376 aa  339  5.9999999999999996e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5042  short-chain acyl-CoA dehydrogenase; butyryl-CoA dehydrogenase  45.55 
 
 
376 aa  339  5.9999999999999996e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5435  acyl-CoA dehydrogenase  45.55 
 
 
376 aa  339  5.9999999999999996e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000529924 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5465  acyl-CoA dehydrogenase  45.28 
 
 
381 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000680329  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3863  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  45.58 
 
 
376 aa  336  5e-91  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5140  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  44.83 
 
 
376 aa  335  5.999999999999999e-91  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3342  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  44.83 
 
 
379 aa  330  2e-89  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2865  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  45.58 
 
 
389 aa  323  2e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1179  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  46.34 
 
 
392 aa  320  3e-86  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0402  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  43.43 
 
 
380 aa  316  5e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0585  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  43.97 
 
 
379 aa  316  5e-85  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1802  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  43.16 
 
 
381 aa  315  8e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2327  acyl-CoA dehydrogenase  42.9 
 
 
381 aa  311  1e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2560  acyl-CoA dehydrogenase  42.9 
 
 
381 aa  311  1e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.1486499999999994e-20 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2369  acyl-CoA dehydrogenase  42.9 
 
 
381 aa  310  2e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.73982  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2355  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  43.16 
 
 
381 aa  310  2e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.774843  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1881  butyryl-CoA dehydrogenase  42.67 
 
 
379 aa  311  2e-83  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.593492  normal  0.222475 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2548  acyl-CoA dehydrogenase  42.63 
 
 
381 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.438014  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2285  acyl-CoA dehydrogenase  42.63 
 
 
381 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.769883  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2511  acyl-CoA dehydrogenase  42.63 
 
 
381 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2812  acyl-CoA dehydrogenase  42.63 
 
 
381 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000163693 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2603  acyl-CoA dehydrogenase  42.63 
 
 
381 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.608519  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2547  acyl-CoA dehydrogenase  42.63 
 
 
381 aa  309  5.9999999999999995e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3455  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  44 
 
 
375 aa  308  8e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.129524 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0934  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  46.56 
 
 
387 aa  308  9e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.496704 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0733  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  46.26 
 
 
377 aa  306  4.0000000000000004e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3778  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  44.18 
 
 
382 aa  305  9.000000000000001e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.341587  normal  0.271407 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0876  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  45.72 
 
 
387 aa  305  9.000000000000001e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.189497  normal  0.119821 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6030  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  45.87 
 
 
391 aa  305  1.0000000000000001e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4743  butyryl-CoA dehydrogenase  45.31 
 
 
417 aa  304  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4384  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  44.44 
 
 
375 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.17615  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0837  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40.1 
 
 
390 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2867  Acyl-CoA dehydrogenase-like  44.47 
 
 
375 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.967944  normal  0.115681 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2589  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  45.38 
 
 
390 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000683478  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4115  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  45.38 
 
 
390 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0397  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  43.47 
 
 
379 aa  303  4.0000000000000003e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.362138 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6504  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  44.72 
 
 
375 aa  302  6.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.285028  normal  0.547313 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3775  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  45.24 
 
 
386 aa  301  2e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.212433  normal  0.155443 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3451  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  44.77 
 
 
377 aa  301  2e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0268  butyryl-CoA dehydrogenase  42.93 
 
 
379 aa  301  2e-80  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2584  butyryl-CoA dehydrogenase  42.67 
 
 
379 aa  300  3e-80  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2286  butyryl-CoA dehydrogenase  42.67 
 
 
379 aa  300  3e-80  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2037  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  45.19 
 
 
375 aa  300  4e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.666233 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2684  putative acyl-CoA dehydrogenase  45.01 
 
 
375 aa  299  6e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.126402  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13303  acyl-CoA dehydrogenase fadE25  44.77 
 
 
389 aa  299  6e-80  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1336  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  46.11 
 
 
388 aa  298  9e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.11867  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1300  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  46.11 
 
 
388 aa  298  9e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1842  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  43.47 
 
 
375 aa  298  9e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0292697  normal  0.208883 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31540  putative acyl-CoA dehydrogenase  45.28 
 
 
375 aa  298  9e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.430124  hitchhiker  0.000095284 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1317  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  46.11 
 
 
388 aa  298  9e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.247959 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3973  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  43.47 
 
 
377 aa  298  1e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.78306  normal  0.788161 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0714  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  45.57 
 
 
388 aa  298  1e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.114203  normal  0.0860013 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1546  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  43.16 
 
 
381 aa  298  1e-79  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4086  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  43.47 
 
 
377 aa  298  1e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.303595  normal  0.349393 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1719  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  44.77 
 
 
389 aa  298  1e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4353  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  46.4 
 
 
385 aa  297  2e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3522  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  42.93 
 
 
375 aa  296  3e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0559083 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>