139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_R0063 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_R0063  tRNA-Gly  100 
 
 		 78 bp  155  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.220412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0009  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  95.6  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0007  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  95.6  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2154  tRNA-Gly  97.92 
 
 		 74 bp  87.7  3e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.480765  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2514  tRNA-Gly  97.92 
 
 		 74 bp  87.7  3e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0272965  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2521  tRNA-Gly  97.92 
 
 		 74 bp  87.7  3e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000668115  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2524  tRNA-Gly  97.92 
 
 		 74 bp  87.7  3e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000475976  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2532  tRNA-Gly  97.92 
 
 		 74 bp  87.7  3e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000000101375  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2620  tRNA-Gly  97.92 
 
 		 74 bp  87.7  3e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0852955  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2627  tRNA-Gly  97.92 
 
 		 74 bp  87.7  3e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2629  tRNA-Gly  97.92 
 
 		 74 bp  87.7  3e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1865  tRNA-Gly  97.92 
 
 		 74 bp  87.7  3e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2218  tRNA-Gly  97.92 
 
 		 74 bp  87.7  3e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000193879  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2225  tRNA-Gly  97.92 
 
 		 74 bp  87.7  3e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000670564  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2228  tRNA-Gly  97.92 
 
 		 74 bp  87.7  3e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000002233  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2236  tRNA-Gly  97.92 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000000133551  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2306  tRNA-Gly  97.92 
 
 		 74 bp  87.7  3e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000790544  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2313  tRNA-Gly  97.92 
 
 		 74 bp  87.7  3e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2315  tRNA-Gly  97.92 
 
 		 74 bp  87.7  3e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0017  tRNA-Gly  95.83 
 
 		 74 bp  79.8  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.292285 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4566  tRNA-Gly  95.83 
 
 		 74 bp  79.8  0.00000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.778703  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1214  tRNA-Gly  95.83 
 
 		 74 bp  79.8  0.00000000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0017  tRNA-Gly  95.83 
 
 		 74 bp  79.8  0.00000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00877648 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0035  tRNA-Gly  95.83 
 
 		 74 bp  79.8  0.00000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0018  tRNA-Gly  95.83 
 
 		 74 bp  79.8  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.395535  normal  0.2939 
 
 
-
 
NC_004310  BR_t22  tRNA-Gly  95.56 
 
 		 71 bp  73.8  0.000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.656712  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0561  tRNA-Gly  93.75 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000476059  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0562  hypothetical protein  93.75 
 
 		 141 bp  71.9  0.00000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000293219  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0106  tRNA-Gly  91.84 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000281433  hitchhiker  0.00000200758 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0044  tRNA-Gly  91.67 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000110049  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t06  tRNA-Gly  89.8 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.490066  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA68  tRNA-Gly  89.8 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000000111768  normal  0.639487 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R88  tRNA-Gly  89.8 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000223228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0013  tRNA-Gly  89.8 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000000316853  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0068  tRNA-Gly  89.8 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.911099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0015  tRNA-Gly  89.8 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000649804  normal  0.0121052 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0820  tRNA-Gly  89.8 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0945604  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0085  tRNA-Gly  89.8 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000318176  normal  0.990431 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5030  tRNA-Gly  89.8 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.539673  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5034  tRNA-Gly  89.8 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.616369  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0018  tRNA-Gly  89.8 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0132435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0064  tRNA-Gly  89.58 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_t007  tRNA-Gly  89.58 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0022  tRNA-Gly  89.58 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.600355 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0040    89.58 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0038  tRNA-Gly  89.58 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0028  tRNA-Gly  89.58 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.721667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0069  tRNA-Gly  89.58 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.024134  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0052  tRNA-Gly  89.58 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0161202 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0055  tRNA-Gly  89.58 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.3002  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0041  tRNA-Gly  89.58 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0007  tRNA-Gly  89.58 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0014  tRNA-Gly  89.58 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000252588  normal  0.0241581 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0014  tRNA-Gly  89.58 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000837111  hitchhiker  0.00969138 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0014  tRNA-Gly  89.58 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000323957  normal  0.0855349 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0012  tRNA-Gly  89.58 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0012  tRNA-Gly  89.58 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000471876  hitchhiker  0.000087686 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09150  tRNA-Gly  89.58 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0613367 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0125  tRNA-Gly  89.58 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000000108683  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA37  tRNA-Gly  89.58 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0779293 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0037  tRNA-Gly  89.58 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.374526 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0021  tRNA-Gly  89.58 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.292095 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0020  tRNA-Gly  89.58 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.156043  normal  0.538933 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t06  tRNA-Gly  89.13 
 
 		 71 bp  52  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.000883403  unclonable  0.000000195442 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0043  tRNA-Gly  89.13 
 
 		 71 bp  52  0.00002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0944227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08660  tRNA-Gly  89.13 
 
 		 71 bp  52  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000214078  hitchhiker  0.000527439 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60030  tRNA-Gly  89.13 
 
 		 71 bp  52  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00076  tRNA-Gly  87.76 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00000423625  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0047  tRNA-Gly  96.55 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0009  tRNA-Gly  91.89 
 
 		 71 bp  50.1  0.00007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0035  tRNA-Gly  91.89 
 
 		 71 bp  50.1  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4473  tRNA-Gly  87.76 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.0000778472  hitchhiker  0.000364054 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5443  tRNA-Gly  87.76 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000114766  hitchhiker  0.00132893 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0004  tRNA-Gly  96.55 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tGly01  tRNA-Gly  87.76 
 
 		 78 bp  50.1  0.00007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000000588593  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4550  tRNA-Gly  87.76 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000345033  hitchhiker  0.00000000000121992 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0004  tRNA-Gly  96.55 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.699145  normal  0.0309415 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0006  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 66 bp  50.1  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.926314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0007  tRNA-Gly  96.55 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00254544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNAGlyVIMSS1309072  tRNA-Gly  91.89 
 
 		 71 bp  50.1  0.00007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNAGlyVIMSS1309123  tRNA-Gly  91.89 
 
 		 71 bp  50.1  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.658382  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAGlyVIMSS1309292  tRNA-Gly  91.89 
 
 		 71 bp  50.1  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4695  tRNA-Gly  87.76 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  5.29308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0004  tRNA-Gly  96.55 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.786418  normal  0.400526 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNAGlyVIMSS1309148  tRNA-Gly  91.89 
 
 		 71 bp  50.1  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4354  tRNA-Gly  87.76 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0000000304012  normal  0.98071 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0001  tRNA-Gly  96.55 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.508752  normal  0.0130418 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0490  tRNA-Gly  87.76 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.826084  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2721  tRNA-Gly  87.76 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000223193  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0049  tRNA-Gly  90.24 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.099885  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0956  tRNA-Gly  90.24 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0050  tRNA-Gly  87.76 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000235663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14004  tRNA-Gly  96.55 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4386  tRNA-Gly  87.76 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.0000000000000113588  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0037  tRNA-Gly  90.24 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4426  tRNA-Gly  87.76 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000000739048  hitchhiker  0.0000476038 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4719  tRNA-Gly  87.76 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.20782e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5102  tRNA-Gly  87.76 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000061566  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0698  tRNA-Gly  87.76 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00121364  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0107  tRNA-Gly  87.76 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000460652  hitchhiker  0.00217641 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>