230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5662 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_5662  iron-containing alcohol dehydrogenase  100 
 
 		 364 aa  721    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.971556  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0011  iron-containing alcohol dehydrogenase  56.21 
 
 		 381 aa  379  1e-104  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.556568  normal  0.0107863 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1714  iron-containing alcohol dehydrogenase  50.28 
 
 		 362 aa  316  3e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.105051 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4666  iron-containing alcohol dehydrogenase  45.04 
 
 		 360 aa  285  8e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1883  glycerol dehydrogenase  46.13 
 
 		 371 aa  270  2e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.563228 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0902  iron-containing alcohol dehydrogenase  43.14 
 
 		 373 aa  267  2e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4570  glycerol dehydrogenase  46.77 
 
 		 365 aa  257  2e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1690  glycerol dehydrogenase  40.69 
 
 		 367 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.386813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3814  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.72 
 
 		 380 aa  236  5.0000000000000005e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.594531  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2109  glycerol dehydrogenase  40.06 
 
 		 366 aa  233  3e-60  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0658599  normal  0.138257 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00260  glycerol dehydrogenase-like oxidoreductase  39.43 
 
 		 383 aa  227  3e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.952088  normal  0.866411 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4514  glycerol dehydrogenase  38.27 
 
 		 367 aa  223  6e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000391797 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4273  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.32 
 
 		 368 aa  221  9.999999999999999e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.510478 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4443  glycerol dehydrogenase  38.27 
 
 		 367 aa  220  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0136708 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4325  glycerol dehydrogenase  38.27 
 
 		 367 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4440  glycerol dehydrogenase  38.27 
 
 		 367 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.91593 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0522  glycerol dehydrogenase  37.54 
 
 		 364 aa  219  3.9999999999999997e-56  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.386114  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0498  glycerol dehydrogenase  37.54 
 
 		 364 aa  219  3.9999999999999997e-56  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000685434  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5406  glycerol dehydrogenase  37.96 
 
 		 367 aa  219  6e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4393  glycerol dehydrogenase  37.96 
 
 		 367 aa  219  6e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.652154 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4356  glycerol dehydrogenase  37.96 
 
 		 367 aa  219  7e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03831  glycerol dehydrogenase  37.96 
 
 		 367 aa  218  8.999999999999998e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4040  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.96 
 
 		 367 aa  218  8.999999999999998e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03780  hypothetical protein  37.96 
 
 		 367 aa  218  8.999999999999998e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4432  glycerol dehydrogenase  37.96 
 
 		 367 aa  218  8.999999999999998e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4070  glycerol dehydrogenase  37.96 
 
 		 367 aa  218  8.999999999999998e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4180  glycerol dehydrogenase  37.96 
 
 		 367 aa  218  8.999999999999998e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4485  glycerol dehydrogenase  37.96 
 
 		 367 aa  218  8.999999999999998e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4031  glycerol dehydrogenase  37.96 
 
 		 367 aa  216  5.9999999999999996e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.710337 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0519  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.83 
 
 		 374 aa  214  9.999999999999999e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0734  glycerol dehydrogenase  35.83 
 
 		 365 aa  215  9.999999999999999e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001639  glycerol dehydrogenase  34.67 
 
 		 360 aa  211  2e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0498  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.36 
 
 		 383 aa  209  4e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1067  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.81 
 
 		 364 aa  209  4e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000211882  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2460  glycerol dehydrogenase  36.69 
 
 		 364 aa  204  2e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2801  glycerol dehydrogenase  36.93 
 
 		 395 aa  203  5e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0333  glycerol dehydrogenase  34.81 
 
 		 362 aa  201  1.9999999999999998e-50  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4859  glycerol dehydrogenase  34.96 
 
 		 360 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.84426 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5962  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.68 
 
 		 365 aa  197  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.323555 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2426  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.03 
 
 		 385 aa  197  3e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0709781  normal  0.330647 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2346  glycerol dehydrogenase  32.5 
 
 		 367 aa  196  8.000000000000001e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3899  glycerol dehydrogenase  34.26 
 
 		 369 aa  194  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.406608  normal  0.540531 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3796  glycerol dehydrogenase  35.24 
 
 		 369 aa  193  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0209909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3838  glycerol dehydrogenase  36.33 
 
 		 369 aa  193  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.200623 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3730  glycerol dehydrogenase  36.01 
 
 		 369 aa  192  9e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0094  glycerol dehydrogenase  32.55 
 
 		 376 aa  189  8e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0772  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.25 
 
 		 367 aa  186  7e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.277229  normal  0.0195639 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2706  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.77 
 
 		 366 aa  182  1e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0712  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.89 
 
 		 363 aa  181  1e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1840  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.68 
 
 		 373 aa  182  1e-44  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1007  glycerol dehydrogenase  35.28 
 
 		 371 aa  176  7e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0985  glycerol dehydrogenase  35 
 
 		 371 aa  176  7e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2945  glycerol dehydrogenase  35.1 
 
 		 372 aa  176  8e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1019  glycerol dehydrogenase  35 
 
 		 371 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.556711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6106  glycerol dehydrogenase  37.11 
 
 		 374 aa  173  5e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.25848  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3356  glycerol dehydrogenase  34.44 
 
 		 371 aa  171  1e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1046  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.47 
 
 		 368 aa  171  2e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.251209  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0464  Iron-containing alcohol dehydrogenase  33.52 
 
 		 363 aa  169  5e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.392924  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39990  glycerol dehydrogenase  33.61 
 
 		 379 aa  169  7e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.284351  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0061  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.74 
 
 		 364 aa  160  2e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1653  glycerol dehydrogenase  36.51 
 
 		 398 aa  159  5e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.218949  normal  0.875823 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2634  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.49 
 
 		 360 aa  130  5.0000000000000004e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.453676  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3356  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.72 
 
 		 378 aa  121  1.9999999999999998e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.875561  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0085  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.22 
 
 		 373 aa  120  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.196497 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1022  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.12 
 
 		 377 aa  119  7.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0088  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.95 
 
 		 373 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1321  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.53 
 
 		 385 aa  116  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3601  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.15 
 
 		 384 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.875305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1650  glycerol dehydrogenase  30.11 
 
 		 359 aa  114  2.0000000000000002e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0116595  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27210  glycerol dehydrogenase-like oxidoreductase  29.52 
 
 		 352 aa  113  5e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0016  Iron-containing alcohol dehydrogenase  28.49 
 
 		 396 aa  110  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.537378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2285  glycerol dehydrogenase  29.32 
 
 		 359 aa  110  3e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.370062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4190  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.8 
 
 		 358 aa  107  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1794  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.33 
 
 		 367 aa  105  1e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1396  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.04 
 
 		 367 aa  103  6e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.498895  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1388  putative glycerol dehydrogenase  28.76 
 
 		 366 aa  100  5e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.106406  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1296  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.62 
 
 		 339 aa  98.6  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.764657  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09901  putative glycerol dehydrogenase  28.85 
 
 		 417 aa  97.4  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11781  putative glycerol dehydrogenase  23.61 
 
 		 364 aa  96.7  5e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0502  hypothetical protein  27.4 
 
 		 362 aa  94  3e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3080  hypothetical protein  28.18 
 
 		 363 aa  93.6  5e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2519  hypothetical protein  28.18 
 
 		 363 aa  93.6  5e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.113395  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2422  hypothetical protein  28.18 
 
 		 363 aa  93.6  5e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11931  putative glycerol dehydrogenase  22.99 
 
 		 363 aa  92  1e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.273319  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0620  hypothetical protein  27.67 
 
 		 362 aa  92  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00567  predicted oxidoreductase  27.47 
 
 		 362 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00556  hypothetical protein  27.47 
 
 		 362 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.730411  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0620  hypothetical protein  27.4 
 
 		 362 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.505795  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3025  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.12 
 
 		 362 aa  90.5  4e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3044  hypothetical protein  27.12 
 
 		 362 aa  90.5  4e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0651  hypothetical protein  27.12 
 
 		 362 aa  90.5  4e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0661  glycerol dehydrogenase family protein  22.04 
 
 		 372 aa  90.1  5e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0783296  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11941  putative glycerol dehydrogenase  22.95 
 
 		 363 aa  89.4  9e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0685  hypothetical protein  28.02 
 
 		 362 aa  89  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1971  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  27.01 
 
 		 358 aa  88.6  1e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2046  glycerol dehydrogenase, putative  27.24 
 
 		 361 aa  88.6  2e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.220349  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1098  putative glycerol dehydrogenase  22.99 
 
 		 363 aa  88.2  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14931  putative glycerol dehydrogenase  21.49 
 
 		 372 aa  88.2  2e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.115918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2371  hypothetical protein  30.89 
 
 		 362 aa  87  5e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1626  putative glycerol dehydrogenase  32.21 
 
 		 366 aa  85.9  9e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.234673  normal  0.71595 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>