36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3990 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_3990  nitrogen fixation protein  100 
 
 		 160 aa  323  5e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186093  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3540  nitrogen fixation protein  86.16 
 
 		 158 aa  275  2e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.859638  hitchhiker  0.00968593 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2283  hypothetical protein  63.51 
 
 		 157 aa  204  6e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1473  hypothetical protein  60.14 
 
 		 165 aa  192  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.554599  decreased coverage  0.000104665 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1564  nitrogen fixation protein  62.94 
 
 		 153 aa  189  1e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3626  nitrogen fixation protein  55.56 
 
 		 155 aa  187  4e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.136981 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1352  nitrogen fixation protein  54.79 
 
 		 159 aa  187  5.999999999999999e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5095  nitrogen fixation protein  57.72 
 
 		 154 aa  186  8e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0975  hypothetical protein  56.29 
 
 		 154 aa  185  2e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.33721 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1232  nitrogen fixation protein  61.59 
 
 		 155 aa  182  2.0000000000000003e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000318988 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1514  hypothetical protein  61.59 
 
 		 155 aa  182  2.0000000000000003e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.111049  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2322  hypothetical protein  58.11 
 
 		 170 aa  182  2.0000000000000003e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0454045  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0236  hypothetical protein  55.17 
 
 		 152 aa  179  1e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0970015  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1079  hypothetical protein  54.36 
 
 		 155 aa  179  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4457  hypothetical protein  53.8 
 
 		 155 aa  179  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0094  hypothetical protein  51.63 
 
 		 156 aa  174  4e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.123891  normal  0.916048 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5919  hypothetical protein  54.68 
 
 		 156 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.29421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0479  nitrogen fixation protein  53.42 
 
 		 156 aa  168  4e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2187  hypothetical protein  50.31 
 
 		 156 aa  165  2.9999999999999998e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0900342 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0535  hypothetical protein  50.31 
 
 		 156 aa  165  2.9999999999999998e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.385601  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1252  hypothetical protein  48.43 
 
 		 156 aa  160  9e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0266  hypothetical protein  44.94 
 
 		 169 aa  147  4e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1192  hypothetical protein  40.88 
 
 		 149 aa  128  4.0000000000000003e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000719142 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01490  hypothetical protein  40.69 
 
 		 160 aa  125  2.0000000000000002e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1347  nitrogen fixation protein  38.36 
 
 		 158 aa  125  2.0000000000000002e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.629038  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3935  hypothetical protein  40.14 
 
 		 158 aa  124  7e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0255327 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4253  hypothetical protein  38.99 
 
 		 158 aa  121  3e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1508  hypothetical protein  38.13 
 
 		 153 aa  121  5e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.689838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6875  hypothetical protein  44.93 
 
 		 155 aa  118  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.268079 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2113  nitrogen fixation protein  40.82 
 
 		 159 aa  117  9e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00558029 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4482  hypothetical protein  45 
 
 		 147 aa  116  9.999999999999999e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.995501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1791  nitrogen fixation protein  39.29 
 
 		 156 aa  114  6.9999999999999995e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1819  nitrogen fixation protein  39.86 
 
 		 156 aa  114  7.999999999999999e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4141  hypothetical protein  36.17 
 
 		 156 aa  110  7.000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4799  nitrogen fixation protein  36.49 
 
 		 157 aa  109  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2115  hypothetical protein  29.41 
 
 		 154 aa  74.3  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00818252 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>