More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_2988 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_2988  phosphoribosylamine--glycine ligase  100 
 
 
428 aa  872    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002184  phosphoribosylamine--glycine ligase  74.07 
 
 
429 aa  652    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.25624  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0360  Phosphoribosylamine--glycine ligase  73.3 
 
 
430 aa  640    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00211  phosphoribosylamine--glycine ligase  73.36 
 
 
429 aa  644    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2652  phosphoribosylamine--glycine ligase  72.83 
 
 
429 aa  642    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0555  phosphoribosylamine--glycine ligase  72.03 
 
 
431 aa  627  1e-178  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3406  phosphoribosylamine--glycine ligase  71.99 
 
 
432 aa  625  1e-178  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.586038  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2843  phosphoribosylamine--glycine ligase  72.13 
 
 
430 aa  622  1e-177  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.294227  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3219  phosphoribosylamine--glycine ligase  71.03 
 
 
429 aa  623  1e-177  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.708681 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0438  phosphoribosylamine--glycine ligase  70.96 
 
 
430 aa  622  1e-177  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.199076  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0394  phosphoribosylamine--glycine ligase  70.83 
 
 
431 aa  618  1e-176  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0266  phosphoribosylamine--glycine ligase  71.43 
 
 
427 aa  619  1e-176  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000213794  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0431  phosphoribosylamine--glycine ligase  71 
 
 
433 aa  616  1e-175  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03941  Phosphoribosylamine-glycine ligase  71.36 
 
 
430 aa  612  9.999999999999999e-175  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0295  phosphoribosylamine--glycine ligase  70.93 
 
 
430 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3402  phosphoribosylamine--glycine ligase  72.22 
 
 
432 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3585  phosphoribosylamine--glycine ligase  71.76 
 
 
432 aa  611  9.999999999999999e-175  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0492  phosphoribosylamine--glycine ligase  70.74 
 
 
433 aa  611  9.999999999999999e-175  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0440  phosphoribosylamine--glycine ligase  71.76 
 
 
432 aa  611  9.999999999999999e-175  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0224  phosphoribosylamine--glycine ligase  69.79 
 
 
428 aa  610  1e-173  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0267401  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4037  phosphoribosylamine--glycine ligase  71.76 
 
 
432 aa  608  1e-173  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3914  phosphoribosylamine--glycine ligase  71.76 
 
 
432 aa  608  1e-173  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0215  phosphoribosylamine--glycine ligase  70.33 
 
 
430 aa  608  1e-173  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0406099  normal  0.0125796 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0361  phosphoribosylamine--glycine ligase  70.12 
 
 
427 aa  607  9.999999999999999e-173  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.292405  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0419  phosphoribosylamine--glycine ligase  71.53 
 
 
432 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0441  phosphoribosylamine--glycine ligase  71.06 
 
 
432 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0228  phosphoribosylamine--glycine ligase  69.09 
 
 
428 aa  605  9.999999999999999e-173  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0316556  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0805  phosphoribosylamine--glycine ligase  71.19 
 
 
430 aa  605  9.999999999999999e-173  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3841  phosphoribosylamine--glycine ligase  71.53 
 
 
432 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.111405 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0444  phosphoribosylamine--glycine ligase  71.3 
 
 
432 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03882  phosphoribosylamine-glycine ligase  70.33 
 
 
429 aa  602  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000860274  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3988  phosphoribosylamine/glycine ligase  70.09 
 
 
429 aa  602  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0361396  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03835  hypothetical protein  70.33 
 
 
429 aa  602  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000931477  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4496  phosphoribosylamine--glycine ligase  70.09 
 
 
429 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000225394  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4876  phosphoribosylamine--glycine ligase  70.49 
 
 
431 aa  601  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0707  phosphoribosylamine--glycine ligase  70.49 
 
 
429 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3862  phosphoribosylamine--glycine ligase  69.16 
 
 
429 aa  604  1.0000000000000001e-171  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.256361  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06880  phosphoribosylamine--glycine ligase  69.72 
 
 
426 aa  601  1.0000000000000001e-171  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.285428  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0356  phosphoribosylamine--glycine ligase  69.01 
 
 
428 aa  601  1.0000000000000001e-171  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0104682  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4020  phosphoribosylamine--glycine ligase  70.33 
 
 
429 aa  603  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000927217  normal  0.0101467 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4453  phosphoribosylamine--glycine ligase  69.86 
 
 
429 aa  602  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0221711  hitchhiker  0.000392069 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4419  phosphoribosylamine--glycine ligase  70.09 
 
 
429 aa  602  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.160091  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3844  phosphoribosylamine--glycine ligase  69.01 
 
 
428 aa  603  1.0000000000000001e-171  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000315171  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4508  phosphoribosylamine--glycine ligase  69.93 
 
 
429 aa  602  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0778373 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4548  phosphoribosylamine--glycine ligase  70.33 
 
 
429 aa  603  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00000304372  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5474  phosphoribosylamine--glycine ligase  69.63 
 
 
429 aa  602  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.13476  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4613  phosphoribosylamine--glycine ligase  70.49 
 
 
431 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.302277 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3413  phosphoribosylamine--glycine ligase  70.37 
 
 
433 aa  601  1.0000000000000001e-171  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.872928 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4239  phosphoribosylamine--glycine ligase  70.09 
 
 
429 aa  601  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00124381  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4698  phosphoribosylamine--glycine ligase  70.02 
 
 
430 aa  599  1e-170  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.744432  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4823  phosphoribosylamine--glycine ligase  70.02 
 
 
431 aa  599  1e-170  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0464  phosphoribosylamine--glycine ligase  68.78 
 
 
428 aa  600  1e-170  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00032027  normal  0.0111484 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4386  phosphoribosylamine--glycine ligase  70.09 
 
 
429 aa  601  1e-170  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.677738 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0909  phosphoribosylamine--glycine ligase  68.69 
 
 
432 aa  601  1e-170  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4582  phosphoribosylamine--glycine ligase  69.86 
 
 
429 aa  599  1e-170  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.213422  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3708  phosphoribosylamine--glycine ligase  69.09 
 
 
428 aa  600  1e-170  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0202463  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4506  phosphoribosylamine--glycine ligase  69.7 
 
 
429 aa  600  1e-170  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0278032 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0443  phosphoribosylamine--glycine ligase  70.77 
 
 
430 aa  599  1e-170  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.201644 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3451  phosphoribosylamine--glycine ligase  67.45 
 
 
428 aa  596  1e-169  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.264337  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5575  phosphoribosylamine--glycine ligase  69.09 
 
 
429 aa  592  1e-168  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0292  phosphoribosylamine--glycine ligase  68 
 
 
427 aa  594  1e-168  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00181025  normal  0.0133648 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64220  phosphoribosylamine--glycine ligase  68.85 
 
 
429 aa  592  1e-168  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.88359  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0612  phosphoribosylamine--glycine ligase  68.62 
 
 
430 aa  588  1e-167  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.147919  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0177  phosphoribosylamine/glycine ligase  67.83 
 
 
429 aa  585  1e-166  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.348487  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4407  phosphoribosylamine--glycine ligase  67.92 
 
 
431 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.357121 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0612  phosphoribosylamine--glycine ligase  65.89 
 
 
430 aa  581  1.0000000000000001e-165  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000692344  hitchhiker  0.00000110971 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4867  phosphoribosylamine--glycine ligase  67.76 
 
 
431 aa  578  1e-164  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2827  phosphoribosylamine--glycine ligase  64.08 
 
 
437 aa  575  1.0000000000000001e-163  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000587328  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1626  phosphoribosylamine--glycine ligase  65.05 
 
 
432 aa  570  1e-161  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2342  phosphoribosylamine/glycine ligase  65.81 
 
 
428 aa  565  1e-160  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.51337  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3665  phosphoribosylamine--glycine ligase  66.43 
 
 
428 aa  562  1.0000000000000001e-159  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02964  phosphoribosylamine--glycine ligase  64.02 
 
 
429 aa  552  1e-156  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0997  phosphoribosylamine--glycine ligase  60.98 
 
 
430 aa  532  1e-150  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0875  phosphoribosylamine--glycine ligase  61.92 
 
 
430 aa  533  1e-150  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.712895  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1999  phosphoribosylamine--glycine ligase  60.19 
 
 
429 aa  531  1e-150  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00638776  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0348  phosphoribosylamine--glycine ligase  61.47 
 
 
422 aa  522  1e-147  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.6128 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1442  phosphoribosylamine--glycine ligase  62.21 
 
 
426 aa  518  1e-146  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.577495  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3668  phosphoribosylamine--glycine ligase  60.42 
 
 
425 aa  517  1.0000000000000001e-145  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0036  phosphoribosylamine--glycine ligase  58.06 
 
 
424 aa  514  1.0000000000000001e-145  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.413084  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0617  phosphoribosylamine--glycine ligase  60.71 
 
 
425 aa  516  1.0000000000000001e-145  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0434  phosphoribosylamine--glycine ligase  59.06 
 
 
424 aa  514  1e-144  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1753  phosphoribosylamine--glycine ligase  59.06 
 
 
437 aa  514  1e-144  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.528627  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3260  phosphoribosylamine--glycine ligase  58.31 
 
 
432 aa  511  1e-144  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.207571  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1300  phosphoribosylamine--glycine ligase  57.85 
 
 
432 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.617554  normal  0.088058 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1989  phosphoribosylamine--glycine ligase  59.1 
 
 
422 aa  505  9.999999999999999e-143  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.187802  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2459  phosphoribosylamine--glycine ligase  62.15 
 
 
425 aa  505  9.999999999999999e-143  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2389  phosphoribosylamine--glycine ligase  59.34 
 
 
422 aa  506  9.999999999999999e-143  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1419  phosphoribosylamine--glycine ligase  58.69 
 
 
425 aa  505  9.999999999999999e-143  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1238  phosphoribosylamine--glycine ligase  60.47 
 
 
425 aa  506  9.999999999999999e-143  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2065  phosphoribosylamine--glycine ligase  57.85 
 
 
425 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.19426 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2191  phosphoribosylamine--glycine ligase  59.06 
 
 
422 aa  503  1e-141  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1729  phosphoribosylamine--glycine ligase  59.16 
 
 
430 aa  504  1e-141  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.576125 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5622  phosphoribosylamine--glycine ligase  57.51 
 
 
425 aa  502  1e-141  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1969  phosphoribosylamine--glycine ligase  59.12 
 
 
433 aa  502  1e-141  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.949647 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0784  phosphoribosylamine--glycine ligase  59.53 
 
 
422 aa  503  1e-141  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.110869  normal  0.244609 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2318  phosphoribosylamine--glycine ligase  58.31 
 
 
426 aa  503  1e-141  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.57608 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2295  phosphoribosylamine--glycine ligase  58.55 
 
 
426 aa  503  1e-141  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0983  phosphoribosylamine--glycine ligase  57.98 
 
 
425 aa  500  1e-140  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0720926  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1061  phosphoribosylamine--glycine ligase  57.24 
 
 
442 aa  499  1e-140  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1338  phosphoribosylamine--glycine ligase  59.45 
 
 
430 aa  499  1e-140  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>