45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0682 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0682  SAM-binding motif-containing protein  100 
 
 
191 aa  393  1e-109  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.206315  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1781  SAM (and some other nucleotide) binding motif  91.62 
 
 
286 aa  362  2e-99  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.183763  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0122  SAM-binding motif-containing protein  86.91 
 
 
286 aa  345  2e-94  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.350495 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0046  methyltransferase type 12  72.49 
 
 
283 aa  276  1e-73  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.165361  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0429  methyltransferase type 12  33.33 
 
 
275 aa  96.7  2e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1090  methyltransferase  23.96 
 
 
283 aa  79  0.00000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000294134  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0005  Methyltransferase type 11  27.14 
 
 
293 aa  77.8  0.00000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0234268 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2016  methyltransferase  27.66 
 
 
283 aa  77.4  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3701  methyltransferase type 12  29.8 
 
 
279 aa  76.3  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1924  methyltransferase type 12  25.42 
 
 
291 aa  73.9  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.302412  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1469  methyltransferase type 11  24.74 
 
 
280 aa  73.6  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00000470965  normal  0.0590447 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1590  Methyltransferase type 11  29.05 
 
 
298 aa  70.9  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0369722  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2033  methyltransferase  26.42 
 
 
302 aa  68.6  0.00000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.931745  normal  0.810156 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2737  methyltransferase  27.03 
 
 
278 aa  68.2  0.00000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000116085  decreased coverage  0.0000479797 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0326  hypothetical protein  31.07 
 
 
276 aa  67  0.0000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0245  ribosomal RNA adenine dimethylase  23.31 
 
 
278 aa  65.9  0.0000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.14559  normal  0.593332 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0150  methyltransferase  27.48 
 
 
269 aa  65.1  0.0000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.520005  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1177  ribosomal RNA adenine dimethylase  24.65 
 
 
274 aa  64.3  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0369  methyltransferase type 12  25.71 
 
 
254 aa  64.3  0.000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.151072  normal  0.249023 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2275  methyltransferase type 12  23.44 
 
 
279 aa  63.2  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0040  hypothetical protein  28.98 
 
 
274 aa  62.8  0.000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.25968  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1473  methyltransferase type 12  24.37 
 
 
270 aa  62.4  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0235  methyltransferase type 12  26.71 
 
 
254 aa  61.6  0.000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1288  serine protease  27.23 
 
 
279 aa  61.2  0.000000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00462648  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2360  methyltransferase type 12  25.13 
 
 
319 aa  60.5  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.328542  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2361  methyltransferase type 12  24.74 
 
 
291 aa  60.1  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0812  hypothetical protein  25 
 
 
271 aa  59.3  0.00000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.158523  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1471  methyltransferase type 11  27.34 
 
 
279 aa  59.7  0.00000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0487894  normal  0.185117 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1317  ribosomal RNA adenine dimethylase  21.13 
 
 
279 aa  59.3  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.222413  normal  0.0120668 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1588  Methyltransferase type 12  23.33 
 
 
293 aa  58.9  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0308513  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1447  hypothetical protein  26.82 
 
 
280 aa  58.9  0.00000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.814616  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0058  methyltransferase type 11  28.12 
 
 
287 aa  55.8  0.0000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0327  putative SAM-dependent methyltransferase  29.14 
 
 
323 aa  54.7  0.0000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1320  putative methyltransferase  23.19 
 
 
291 aa  53.9  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0114884 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1672  hypothetical protein  27.54 
 
 
268 aa  50.8  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.51834  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01690  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  25.87 
 
 
291 aa  44.7  0.0008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.160618  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0032  methyltransferase type 11  24.21 
 
 
288 aa  43.9  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1127  methyltransferase type 12  24.56 
 
 
302 aa  43.9  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.287777  hitchhiker  0.00000151267 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1224  hypothetical protein  23.59 
 
 
277 aa  43.5  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0472515 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1045  hypothetical protein  25 
 
 
277 aa  43.5  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1216  hypothetical protein  29.13 
 
 
286 aa  43.5  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.43284  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1481  hypothetical protein  33.8 
 
 
279 aa  43.5  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1285  methyltransferase type 12  27.6 
 
 
273 aa  42.7  0.003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3030  methyltransferase type 12  23.04 
 
 
274 aa  42.4  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1495  hypothetical protein  27.08 
 
 
273 aa  42.4  0.005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000420591  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>