20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0894 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_0894  hypothetical protein  100 
 
 
522 aa  1025    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00000463989  hitchhiker  0.00000186641 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0361  polysaccharide biosynthesis protein  39.69 
 
 
519 aa  340  4e-92  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.602182  normal  0.0588594 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0954  polysaccharide biosynthesis protein  38.65 
 
 
514 aa  336  5e-91  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.861474  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0827  polysaccharide biosynthesis protein  38.25 
 
 
522 aa  331  2e-89  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.769454  normal  0.213046 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0958  polysaccharide biosynthesis protein  36.61 
 
 
517 aa  318  1e-85  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.393592  n/a   
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3744  hypothetical protein  37.16 
 
 
525 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.788366 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1803  O-antigen and teichoic acid export protein  25.35 
 
 
506 aa  172  1e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1219  polysaccharide biosynthesis protein  21.93 
 
 
505 aa  106  1e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3571  polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 
534 aa  105  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0458  polysaccharide biosynthesis protein  21.03 
 
 
505 aa  95.1  3e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.320222  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1387  polysaccharide biosynthesis protein  22.18 
 
 
504 aa  88.6  2e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5012  putative polysaccharide biosynthesis protein  21.01 
 
 
499 aa  62.4  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1791  polysaccharide biosynthesis protein  22.76 
 
 
504 aa  58.9  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2096  polysaccharide biosynthesis protein  22.3 
 
 
511 aa  57.8  0.0000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3669  polysaccharide biosynthesis protein  23.15 
 
 
501 aa  57.8  0.0000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.77196  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1637  polysaccharide biosynthesis protein  22.2 
 
 
504 aa  52.8  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1606  putative transmembrane protein  22.45 
 
 
512 aa  47.4  0.0007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.931285  normal  0.650131 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0062  polysaccharide biosynthesis protein  21.49 
 
 
510 aa  44.3  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0651262  normal  0.28777 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0438  transporter of NadC family protein  20 
 
 
516 aa  43.9  0.007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0809046  normal  0.0220844 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3059  polysaccharide biosynthesis protein  23.19 
 
 
454 aa  43.5  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>