33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0099 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_0099  50S ribosomal protein L19e  100 
 
 
150 aa  304  2.0000000000000002e-82  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.991542 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2235  50S ribosomal protein L19e  68.75 
 
 
148 aa  207  4e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000217277  normal  0.577583 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0550  50S ribosomal protein L19e  66.22 
 
 
150 aa  205  2e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.172805  normal  0.437569 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0582  50S ribosomal protein L19e  64.86 
 
 
150 aa  195  1.0000000000000001e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0522753  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0460  50S ribosomal protein L19e  63.51 
 
 
150 aa  194  3e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0612567  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2236  Ribosomal protein L19e  54.55 
 
 
149 aa  167  6e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0092  50S ribosomal protein L19e  54.93 
 
 
150 aa  163  5.9999999999999996e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000444774  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0228  Ribosomal protein L19e  52.45 
 
 
149 aa  162  1.0000000000000001e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.129864  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1846  Ribosomal protein L19e  49.65 
 
 
149 aa  157  4e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0019  50S ribosomal protein L19e  53.47 
 
 
148 aa  147  4e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000168936  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1710  50S ribosomal protein L19e  52.41 
 
 
152 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0155799  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2310  50S ribosomal protein L19e  45.45 
 
 
148 aa  139  1.9999999999999998e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.348153  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1402  50S ribosomal protein L19e  49.65 
 
 
148 aa  137  4.999999999999999e-32  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.754312  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1256  50S ribosomal protein L19e  48.23 
 
 
149 aa  135  2e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.021288  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0662  50S ribosomal protein L19e  48.23 
 
 
149 aa  135  2e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00691512 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2431  50S ribosomal protein L19e  45.83 
 
 
153 aa  134  3.0000000000000003e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0728  50S ribosomal protein L19e  48.91 
 
 
149 aa  132  9.999999999999999e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.76769  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0161  50S ribosomal protein L19e  48.91 
 
 
149 aa  130  6e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00000681634  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0238  50S ribosomal protein L19e  44.29 
 
 
155 aa  124  4.0000000000000003e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1503  Ribosomal protein L19e  43.97 
 
 
150 aa  120  5e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000108897  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2007  50S ribosomal protein L19e  38.13 
 
 
147 aa  103  5e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1255  50S ribosomal protein L19e  38.13 
 
 
147 aa  103  6e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.563803  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1867  50S ribosomal protein L19e  39.57 
 
 
147 aa  103  1e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0174  50S ribosomal protein L19e  36.69 
 
 
147 aa  96.3  1e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10740  60S ribosomal protein L19 (AFU_orthologue; AFUA_2G07970)  37.93 
 
 
190 aa  91.7  3e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.620404  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0109  50S ribosomal protein L19e  39.58 
 
 
151 aa  88.6  2e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.0000000000123544  unclonable  0.000000342934 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0390  50S ribosomal protein L19e  31.33 
 
 
151 aa  89  2e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.189985 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1760  Ribosomal protein L19e  39.16 
 
 
151 aa  87.4  5e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.297222  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86681  predicted protein  36.55 
 
 
189 aa  83.6  8e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.696448  normal  0.779358 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_30262  predicted protein  37.4 
 
 
192 aa  80.9  0.000000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.535143  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI01090  60S ribosomal protein L19, putative  37.31 
 
 
194 aa  77.8  0.00000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119482  ribosomal protein L19  34.33 
 
 
192 aa  76.6  0.0000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0528113  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0011  50S ribosomal protein L19e  35.29 
 
 
158 aa  61.2  0.000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0579006  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>