50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_4317 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_4232  hypothetical protein  98.85 
 
 
448 aa  188  2e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.815534  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4317  hypothetical protein  100 
 
 
87 aa  182  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0667309  normal  0.918419 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3615  hypothetical protein  92.94 
 
 
444 aa  176  1e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.444236  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3547  hypothetical protein  92.94 
 
 
444 aa  176  1e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3542  hypothetical protein  92.94 
 
 
444 aa  176  1e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4610  hypothetical protein  90.8 
 
 
448 aa  175  2e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3803  hypothetical protein  91.76 
 
 
447 aa  174  5e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.866819  normal  0.47715 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3799  hypothetical protein  94.05 
 
 
87 aa  168  2e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.274784  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3872  hypothetical protein  94.05 
 
 
87 aa  168  2e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.709194  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2779  hypothetical protein  97.4 
 
 
473 aa  166  8e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0348  hypothetical protein  89.29 
 
 
492 aa  166  1e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.385516 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0338  hypothetical protein  89.29 
 
 
492 aa  166  1e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265907  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2152  hypothetical protein  88.1 
 
 
492 aa  165  2e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.166446 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2106  hypothetical protein  88.1 
 
 
446 aa  164  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.426457  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2089  hypothetical protein  86.9 
 
 
493 aa  162  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.129503 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2749  hypothetical protein  90.91 
 
 
473 aa  157  4e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.621595  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2793  hypothetical protein  90.91 
 
 
473 aa  157  4e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.925956  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0327  hypothetical protein  81.18 
 
 
490 aa  155  1e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.565601 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0179  hypothetical protein  82.76 
 
 
442 aa  154  4e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0170  hypothetical protein  82.76 
 
 
442 aa  154  4e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.523196  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4014  hypothetical protein  50.59 
 
 
464 aa  89.7  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00728967 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13504  hypothetical protein  51.19 
 
 
239 aa  85.5  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3050  hypothetical protein  52.63 
 
 
495 aa  85.1  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.184286 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10095  hypothetical protein  51.19 
 
 
317 aa  84.7  4e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.391031  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3851  hypothetical protein  51.32 
 
 
513 aa  84  7e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.116307  normal  0.432378 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4451  hypothetical protein  50 
 
 
518 aa  81.3  0.000000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3379  hypothetical protein  50 
 
 
497 aa  80.1  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.887374  normal  0.158077 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11717  hypothetical protein  45.88 
 
 
454 aa  79.3  0.00000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.12455 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11604  REP13E12 repeat-containing protein  52.87 
 
 
240 aa  79  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.81222e-18  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11173  hypothetical protein  49.41 
 
 
499 aa  78.6  0.00000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11974  hypothetical protein  50.65 
 
 
454 aa  77.8  0.00000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11151  hypothetical protein  45.78 
 
 
451 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1835  hypothetical protein  42.35 
 
 
489 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3477  hypothetical protein  44 
 
 
506 aa  68.2  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.800826  normal  0.648899 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3231  hypothetical protein  44 
 
 
510 aa  67.8  0.00000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4912  hypothetical protein  42.68 
 
 
508 aa  67.4  0.00000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.477526  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4397  hypothetical protein  44 
 
 
501 aa  67.4  0.00000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.42746  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5865  hypothetical protein  42.67 
 
 
511 aa  67  0.00000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.563621  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4827  hypothetical protein  45.33 
 
 
508 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.79889  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3484  hypothetical protein  45.24 
 
 
552 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.210016  normal  0.9875 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4351  hypothetical protein  44 
 
 
507 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.489972  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4437  hypothetical protein  44 
 
 
507 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.835135  normal  0.189151 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5454  hypothetical protein  42.67 
 
 
519 aa  62  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.157039  decreased coverage  0.0069948 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1730  hypothetical protein  42.67 
 
 
507 aa  62  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4731  hypothetical protein  42.67 
 
 
507 aa  62  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5365  hypothetical protein  42.67 
 
 
158 aa  61.6  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1777  hypothetical protein  42.67 
 
 
507 aa  62  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.159063  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1709  hypothetical protein  42.67 
 
 
507 aa  62  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5741  hypothetical protein  42.67 
 
 
519 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.316715 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2829  HNH endonuclease  38.81 
 
 
469 aa  41.6  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.418942  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>