More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_1684 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_1684  urease accessory protein UreG  100 
 
 
206 aa  404  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0058  urease accessory protein UreG  66.17 
 
 
204 aa  261  4.999999999999999e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.418935  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2409  urease accessory protein UreG  67.37 
 
 
220 aa  259  2e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2196  urease accessory protein UreG  67.03 
 
 
220 aa  251  5.000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000358866  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4441  urease accessory protein UreG  61.34 
 
 
214 aa  240  1e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.761562  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1963  urease accessory protein UreG  62.63 
 
 
216 aa  238  5.999999999999999e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4413  urease accessory protein UreG  57.14 
 
 
208 aa  236  2e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0748  urease accessory protein UreG  53.73 
 
 
212 aa  234  5.0000000000000005e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1302  urease accessory protein UreG  56.1 
 
 
215 aa  231  7.000000000000001e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1464  urease accessory protein UreG  56.1 
 
 
215 aa  231  7.000000000000001e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6188  urease accessory protein UreG  62.9 
 
 
208 aa  230  1e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.226032  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1137  urease accessory protein UreG  61.5 
 
 
216 aa  230  1e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1358  urease accessory protein UreG  61.5 
 
 
214 aa  229  2e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.208123  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1198  urease accessory protein UreG  61.5 
 
 
214 aa  229  3e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.195176  normal  0.215478 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5119  urease accessory protein UreG  56.1 
 
 
215 aa  229  3e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1136  urease accessory protein UreG  54.92 
 
 
220 aa  224  7e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.755264  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1082  urease accessory protein UreG  54.92 
 
 
220 aa  224  7e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3559  urease accessory protein  54.92 
 
 
220 aa  224  7e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.29571  normal  0.0153059 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2768  urease accessory protein UreG  56.48 
 
 
205 aa  217  1e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29751  urease accessory protein UreG  57.14 
 
 
203 aa  215  5e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4636  urease accessory protein UreG  56.77 
 
 
200 aa  212  1.9999999999999998e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000195315  normal  0.0674257 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09380  urease accessory protein UreG  54.23 
 
 
204 aa  211  3.9999999999999995e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1317  urease accessory protein UreG  52.53 
 
 
212 aa  211  4.9999999999999996e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0224  urease accessory protein UreG  56.06 
 
 
207 aa  211  5.999999999999999e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3659  urease accessory protein UreG  52.74 
 
 
205 aa  210  1e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.319946  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1424  urease accessory protein UreG  53.77 
 
 
201 aa  209  2e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.62844 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2621  urease accessory protein UreG  57.98 
 
 
201 aa  209  2e-53  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.131688  normal  0.804945 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0959  urease accessory protein UreG  51.76 
 
 
213 aa  209  2e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2717  urease accessory protein  54.36 
 
 
209 aa  209  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2251  urease accessory protein UreG  56.99 
 
 
201 aa  208  4e-53  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0664  urease accessory protein UreG  55.03 
 
 
204 aa  208  4e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.469815  normal  0.0339996 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1764  urease accessory protein UreG  55.38 
 
 
203 aa  208  5e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.861416  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2261  urease accessory protein UreG  57.22 
 
 
201 aa  207  9e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0587702  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64670  urease accessory protein UreG  56.08 
 
 
204 aa  207  1e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00341231  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1361  urease accessory protein UreG  51.52 
 
 
212 aa  206  2e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.346026  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2877  urease accessory protein UreG  54.87 
 
 
203 aa  206  2e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1701  urease accessory protein UreG  54.92 
 
 
204 aa  206  2e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000266659 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5616  urease accessory protein UreG  55.56 
 
 
204 aa  206  2e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2317  urease accessory protein UreG  52.88 
 
 
204 aa  205  4e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.301422  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0723  urease accessory protein UreG  52.6 
 
 
203 aa  205  4e-52  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0187  urease accessory protein UreG  54.55 
 
 
211 aa  205  4e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2360  urease accessory protein UreG  52.88 
 
 
204 aa  205  4e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.553398  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1813  urease accessory protein UreG  50.5 
 
 
202 aa  204  6e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3107  urease accessory protein UreG  55.85 
 
 
202 aa  204  6e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3261  urease accessory protein UreG  56.52 
 
 
221 aa  204  7e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03470  urease accessory protein UreG  54.01 
 
 
203 aa  204  8e-52  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.546995  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3942  urease accessory protein UreG  54.31 
 
 
225 aa  204  8e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.452121  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0246  urease accessory protein UreG  54.79 
 
 
205 aa  204  8e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1205  urease accessory protein UreG  56.48 
 
 
211 aa  204  9e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1874  urease accessory protein UreG  51.28 
 
 
204 aa  204  1e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2663  urease accessory protein UreG  59.12 
 
 
249 aa  203  1e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.093444 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0992  urease accessory protein UreG  58.29 
 
 
207 aa  202  2e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0395  urease accessory protein UreG  54.26 
 
 
204 aa  202  2e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2008  urease accessory protein UreG  56.15 
 
 
206 aa  202  2e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2377  urease accessory protein UreG  53.73 
 
 
203 aa  202  4e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.168299 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3013  urease accessory protein UreG  52.53 
 
 
204 aa  202  4e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.311602  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3238  urease accessory protein UreG  52.53 
 
 
204 aa  202  4e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.522124 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2360  urease accessory protein  58.82 
 
 
202 aa  202  4e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.695138 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4832  urease accessory protein UreG  56.52 
 
 
212 aa  201  6e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0302  urease accessory protein G  59.24 
 
 
207 aa  200  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2063  urease accessory protein UreG  53.23 
 
 
211 aa  200  9.999999999999999e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000301925  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3202  urease accessory protein UreG  55.74 
 
 
204 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1049  urease accessory protein UreG  50.5 
 
 
205 aa  199  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.113322  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0561  urease accessory protein UreG  56.08 
 
 
204 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.562305  normal  0.940607 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0684  urease accessory protein UreG  52.41 
 
 
203 aa  199  1.9999999999999998e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19201  urease accessory protein UreG  51.27 
 
 
205 aa  199  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2451  urease accessory protein UreG  55.91 
 
 
219 aa  199  1.9999999999999998e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.296243  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4160  urease accessory protein UreG  53.33 
 
 
211 aa  199  3e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1946  urease accessory protein UreG  58.7 
 
 
207 aa  198  3.9999999999999996e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00965207  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0983  urease accessory protein UreG  49.01 
 
 
217 aa  198  3.9999999999999996e-50  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.942838  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6443  urease accessory protein UreG  57.84 
 
 
226 aa  198  5e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.187428  normal  0.14632 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1089  urease accessory protein UreG  53.3 
 
 
204 aa  198  5e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2687  urease accessory protein UreG  56.15 
 
 
207 aa  198  5e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1556  urease accessory protein UreG  54.17 
 
 
206 aa  197  6e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0338  urease accessory protein UreG  52.79 
 
 
206 aa  197  7e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0328  urease accessory protein  52.04 
 
 
204 aa  197  7e-50  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2867  urease accessory protein UreG  55.19 
 
 
205 aa  197  9e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.378326  normal  0.197237 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1477  urease accessory protein UreG  55.43 
 
 
212 aa  197  1.0000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0957656  normal  0.435433 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4911  urease accessory protein UreG  55.03 
 
 
205 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1244  urease accessory protein UreG  51.27 
 
 
213 aa  196  2.0000000000000003e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1756  urease accessory protein UreG  55.56 
 
 
203 aa  196  3e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0086861  normal  0.860103 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3046  urease accessory protein UreG  53.4 
 
 
203 aa  196  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.317226  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3468  urease accessory protein UreG  55.5 
 
 
203 aa  196  3e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2997  urease accessory protein UreG  50.25 
 
 
203 aa  196  3e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.787106 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4453  urease accessory protein UreG  55.03 
 
 
205 aa  195  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3302  urease accessory protein UreG  53.4 
 
 
203 aa  195  4.0000000000000005e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.200502 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1190  urease accessory protein UreG  50.25 
 
 
206 aa  195  5.000000000000001e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.257386  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2117  urease accessory protein UreG  54.17 
 
 
204 aa  195  5.000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0287673 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3506  urease accessory protein UreG  53.61 
 
 
239 aa  194  6e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.138901  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08891  urease accessory protein UreG  50.26 
 
 
203 aa  194  7e-49  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1179  urease accessory protein UreG  50.5 
 
 
213 aa  194  8.000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.585829  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2849  urease accessory protein UreG  50.8 
 
 
207 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0830  urease accessory protein UreG  50.26 
 
 
203 aa  193  1e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00892  urease accessory protein UreG  48.76 
 
 
203 aa  193  1e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.870329  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2931  urease accessory protein UreG  50.8 
 
 
207 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.193752  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08871  urease accessory protein UreG  50.26 
 
 
203 aa  192  2e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2421  urease accessory protein UreG  50.8 
 
 
207 aa  192  2e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0484289  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2840  urease accessory protein UreG  50.54 
 
 
207 aa  192  3e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0273  urease accessory protein UreG  50.76 
 
 
208 aa  191  6e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4032  urease accessory protein UreG  55.43 
 
 
207 aa  191  8e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.199977 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>