74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0046 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_0046  hypothetical protein  100 
 
 
102 aa  213  5e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3554  putative transposase of insertion sequence  50.94 
 
 
173 aa  58.2  4e-08  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0631  putative transposase of insertion sequence  50.94 
 
 
173 aa  58.2  4e-08  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.866083  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3455  putative transposase of insertion sequence  50.94 
 
 
173 aa  58.2  4e-08  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8444  putative transposase of insertion sequence  50.94 
 
 
173 aa  58.2  4e-08  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.4407  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3909  putative transposase of insertion sequence  50.94 
 
 
173 aa  58.2  4e-08  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5622  putative transposase of insertion sequence  50.94 
 
 
173 aa  58.2  4e-08  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6103  putative transposase of insertion sequence  50.94 
 
 
173 aa  58.2  4e-08  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6152  putative transposase of insertion sequence  50.94 
 
 
173 aa  58.2  4e-08  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6255  putative transposase of insertion sequence  50.94 
 
 
173 aa  58.2  4e-08  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6428  putative transposase of insertion sequence  50.94 
 
 
173 aa  58.2  4e-08  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6832  putative transposase of insertion sequence  50.94 
 
 
173 aa  58.2  4e-08  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7501  putative transposase of insertion sequence  50.94 
 
 
173 aa  58.2  4e-08  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.602331  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8190  putative transposase of insertion sequence  50.94 
 
 
173 aa  58.2  4e-08  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0585  putative transposase of insertion sequence  50.94 
 
 
173 aa  58.2  4e-08  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.799947  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3301  putative transposase of insertion sequence  50.94 
 
 
170 aa  54.7  4e-07  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1090  Transposase and inactivated derivatives-like protein  45.28 
 
 
320 aa  53.5  1e-06  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.97275 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36130  transposase of insertion sequence ISRm10-1, orfB C-terminus protein  45.45 
 
 
169 aa  50.1  1e-05  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5181  putative transposase of insertion sequence  45.28 
 
 
191 aa  49.7  1e-05  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3830  transposase  43.86 
 
 
314 aa  48.9  2e-05  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5241  putative transposase of insertion sequence  42.11 
 
 
168 aa  49.7  2e-05  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3417  hypothetical protein  36.78 
 
 
135 aa  48.9  2e-05  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09550  transposase  43.1 
 
 
200 aa  48.5  3e-05  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.303396  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28090  transposase or inactivated derivative  46.15 
 
 
116 aa  48.1  4e-05  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45800  transposase  43.64 
 
 
213 aa  47.8  5e-05  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13570  transposase  43.64 
 
 
213 aa  47.8  5e-05  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2200  ISRm2011-2 transposase protein  34.67 
 
 
188 aa  47.8  5e-05  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.415704  normal  0.285749 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3109  ISRm2011-2 transposase protein  34.67 
 
 
188 aa  47.8  5e-05  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0367059 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2693  ISRm2011-2 transposase protein  34.67 
 
 
188 aa  47.8  5e-05  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.427162 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1434  ISRm2011-2 transposase protein  34.67 
 
 
157 aa  47.8  5e-05  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.575144 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0125  ISRm2011-2 transposase protein  34.67 
 
 
157 aa  47.8  5e-05  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00700  transposase  43.64 
 
 
213 aa  47.8  6e-05  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17150  Transposase protein  43.64 
 
 
213 aa  47.8  6e-05  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0324984  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13540  transposase  43.64 
 
 
213 aa  47.8  6e-05  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21760  transposase  43.64 
 
 
213 aa  47.8  6e-05  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0919758  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23930  transposase  43.64 
 
 
213 aa  47.8  6e-05  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25130  transposase  43.64 
 
 
213 aa  47.8  6e-05  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30220  transposase  43.64 
 
 
213 aa  47.8  6e-05  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33560  transposase  43.64 
 
 
213 aa  47.8  6e-05  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44670  ISRm2011-2 transposase-like protein  43.64 
 
 
213 aa  47.8  6e-05  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.535803  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3006  transposase  42.11 
 
 
314 aa  47.4  7e-05  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0864202 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2724  Transposase IS630  36.84 
 
 
314 aa  47  9e-05  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.35712  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2836  transposase IS630  36.84 
 
 
315 aa  47  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.455996  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2359  transposase IS630  36.84 
 
 
315 aa  47  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.234253  normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3994  transposase  41.82 
 
 
315 aa  46.6  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2717  transposase  36.84 
 
 
315 aa  45.4  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3596  hypothetical protein  41.82 
 
 
132 aa  45.4  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2829  transposase  36.84 
 
 
315 aa  45.4  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.813022  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0389  transposase  36.84 
 
 
315 aa  45.4  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1789  transposase  36.84 
 
 
315 aa  45.4  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0577152  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4425  transposase  36.84 
 
 
315 aa  45.4  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.418617  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1016  ISRm2011-2 transposase protein  35.37 
 
 
238 aa  45.4  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.498871 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1999  ISRm2011-2 transposase protein  35.37 
 
 
238 aa  45.4  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2260  ISRm2011-2 transposase protein  35.37 
 
 
238 aa  45.4  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.105286  normal  0.252905 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2411  ISRm2011-2 transposase protein  35.37 
 
 
238 aa  45.4  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.125527 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2921  ISRm2011-2 transposase protein  35.37 
 
 
238 aa  45.4  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.653073 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1291  ISRm2011-2 transposase protein  35.37 
 
 
238 aa  45.4  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.950102  normal  0.580974 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2437  ISRm2011-2 transposase protein  35.37 
 
 
238 aa  45.4  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0646917 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0976  ISRm2011-2 transposase protein  35.37 
 
 
238 aa  45.4  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.425114  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0954  ISRm2011-2 transposase protein  35.37 
 
 
238 aa  45.4  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.901673 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2489  ISRm2011-2 transposase protein  33.33 
 
 
157 aa  45.1  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.336252  normal  0.806618 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5976  transposase  36.84 
 
 
283 aa  43.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.319425 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1417  ISRm2011-2 transposase protein  33.33 
 
 
188 aa  42  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.154755  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0093  Transposase and inactivated derivatives-like protein  40.35 
 
 
314 aa  42  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4034  putative transposase of insertion sequence ISRm10-1  35.09 
 
 
158 aa  40.4  0.008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.233853  normal  0.491581 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0410  putative transposase of insertion sequence ISRm10-1  35.09 
 
 
158 aa  40.4  0.008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  3.95058e-06 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0348  putative transposase of insertion sequence ISRm10-1  35.09 
 
 
158 aa  40.4  0.008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0604591  hitchhiker  0.00292274 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0141  putative transposase of insertion sequence ISRm10-1  35.09 
 
 
158 aa  40.4  0.008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.112028  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2003  hypothetical protein  40.38 
 
 
272 aa  40.4  0.008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.178183  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1240  putative transposase of insertion sequence ISRm10-1  35.09 
 
 
158 aa  40.4  0.008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0720476  normal  0.411655 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3636  putative transposase of insertion sequence ISRm10-1  35.09 
 
 
158 aa  40.4  0.008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0772273 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1824  putative transposase of insertion sequence ISRm10-1  37.04 
 
 
158 aa  40.4  0.009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.658679 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2083  putative transposase of insertion sequence ISRm10-1  37.04 
 
 
158 aa  40.4  0.009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0776544 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2849  hypothetical protein  39.58 
 
 
126 aa  40  0.01  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>