More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3159 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007778  RPB_1330  adenylosuccinate synthetase  72.16 
 
 
430 aa  659  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.396862  normal  0.220841 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3346  adenylosuccinate synthetase  80.56 
 
 
432 aa  734  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.474516  hitchhiker  0.00582802 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6845  adenylosuccinate synthase  72.92 
 
 
430 aa  650  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2965  adenylosuccinate synthetase  71.69 
 
 
430 aa  659  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.125391  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3544  adenylosuccinate synthetase  78.01 
 
 
432 aa  717  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0262  adenylosuccinate synthase  72.45 
 
 
431 aa  637  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7581  adenylosuccinate synthetase  72.69 
 
 
430 aa  652  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3159  adenylosuccinate synthetase  100 
 
 
432 aa  877  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1123  adenylosuccinate synthetase  71.69 
 
 
457 aa  661  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.565795  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0940  Adenylosuccinate synthase  73.61 
 
 
430 aa  662  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1007  Adenylosuccinate synthase  71.99 
 
 
431 aa  640  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0196756 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4774  adenylosuccinate synthetase  70.3 
 
 
430 aa  648  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.114501  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3089  adenylosuccinate synthetase  79.63 
 
 
432 aa  728  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.126084  normal  0.070043 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1106  adenylosuccinate synthetase  71.3 
 
 
429 aa  638  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3894  adenylosuccinate synthetase  71.23 
 
 
430 aa  650  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.108834  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4086  adenylosuccinate synthetase  69.84 
 
 
430 aa  642  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0852587 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5638  adenylosuccinate synthase  74.77 
 
 
430 aa  676  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.171619  normal  0.25149 
 
 
-
 
NC_004310  BR1683  adenylosuccinate synthetase  79.86 
 
 
429 aa  714  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.469628  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0962  Adenylosuccinate synthase  73.61 
 
 
430 aa  663  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.470264  normal  0.45689 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1850  adenylosuccinate synthetase  71 
 
 
430 aa  656  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1627  adenylosuccinate synthetase  79.86 
 
 
533 aa  718  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0999  adenylosuccinate synthase  73.84 
 
 
448 aa  665  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.595096  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1231  adenylosuccinate synthetase  78.7 
 
 
429 aa  705  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0037  adenylosuccinate synthetase  72.39 
 
 
448 aa  657  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.505248  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2144  adenylosuccinate synthase  72.69 
 
 
430 aa  662  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2616  adenylosuccinate synthetase  79.4 
 
 
432 aa  726  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.199466  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0285  adenylosuccinate synthetase  70.37 
 
 
429 aa  631  1e-180  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0875  adenylosuccinate synthetase  69.44 
 
 
430 aa  622  1e-177  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2010  adenylosuccinate synthetase  69.44 
 
 
430 aa  622  1e-177  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.34638  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0366  adenylosuccinate synthetase  69.21 
 
 
430 aa  620  1e-176  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2742  adenylosuccinate synthetase  69.21 
 
 
431 aa  616  1e-175  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0436902 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4682  adenylosuccinate synthetase  67.82 
 
 
429 aa  610  1e-173  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0603  adenylosuccinate synthetase  66.2 
 
 
430 aa  605  1e-172  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1969  adenylosuccinate synthetase  66.67 
 
 
437 aa  605  1e-172  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.769944  normal  0.0974254 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3179  adenylosuccinate synthetase  67.82 
 
 
431 aa  603  1e-171  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0558  adenylosuccinate synthetase  66.13 
 
 
429 aa  597  1e-169  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00595695 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2683  adenylosuccinate synthetase  65.74 
 
 
429 aa  591  1e-167  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0510  adenylosuccinate synthetase  64.81 
 
 
429 aa  587  1e-166  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.37093  normal  0.446838 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0658  adenylosuccinate synthetase  65.66 
 
 
428 aa  582  1e-165  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.163412  normal  0.505489 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2784  adenylosuccinate synthetase  62.96 
 
 
429 aa  566  1e-160  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.436445  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0475  adenylosuccinate synthetase  65.74 
 
 
429 aa  565  1e-160  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.636476  hitchhiker  0.00197029 
 
 
-
 
NC_002978  WD0337  adenylosuccinate synthetase  58.41 
 
 
425 aa  528  1e-149  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.112659  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0564  adenylosuccinate synthetase  53.13 
 
 
431 aa  509  1e-143  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0461  adenylosuccinate synthetase  53.6 
 
 
430 aa  499  1e-140  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3379  adenylosuccinate synthetase  56.12 
 
 
436 aa  477  1e-133  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1523  adenylosuccinate synthetase  53.01 
 
 
442 aa  474  1e-132  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  1.40547e-05  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6675  adenylosuccinate synthase  57.21 
 
 
432 aa  468  1e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.250077 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5832  adenylosuccinate synthase  56.98 
 
 
432 aa  467  1e-130  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2974  adenylosuccinate synthetase  54.15 
 
 
435 aa  466  1e-130  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.823957 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6199  adenylosuccinate synthase  56.98 
 
 
453 aa  467  1e-130  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0247215 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6526  adenylosuccinate synthetase  56.98 
 
 
432 aa  467  1e-130  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.768523 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0578  adenylosuccinate synthetase  53.95 
 
 
432 aa  465  1e-130  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  1.206e-11 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2007  adenylosuccinate synthetase  54.55 
 
 
431 aa  462  1e-129  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00017376  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5997  adenylosuccinate synthase  56.38 
 
 
429 aa  460  1e-128  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.140056  normal  0.195081 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0641  adenylosuccinate synthetase  53.95 
 
 
431 aa  459  1e-128  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00143682 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5753  adenylosuccinate synthase  56.38 
 
 
429 aa  461  1e-128  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.590489 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0607  adenylosuccinate synthetase  52.33 
 
 
432 aa  461  1e-128  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.272974 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0694  adenylosuccinate synthetase  52.56 
 
 
432 aa  456  1e-127  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0750  adenylosuccinate synthetase  53.36 
 
 
431 aa  457  1e-127  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  6.82785e-07  hitchhiker  0.00737735 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3648  adenylosuccinate synthetase  52.56 
 
 
432 aa  456  1e-127  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5326  adenylosuccinate synthase  56.98 
 
 
432 aa  458  1e-127  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0668634 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3793  adenylosuccinate synthetase  52.56 
 
 
432 aa  456  1e-127  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3592  adenylosuccinate synthetase  53.13 
 
 
431 aa  454  1e-126  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  8.97035e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0676  adenylosuccinate synthetase  52.5 
 
 
446 aa  452  1e-126  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.678663  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2180  adenylosuccinate synthetase  53.26 
 
 
432 aa  452  1e-126  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  1.34883e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1434  adenylosuccinate synthetase  51.45 
 
 
459 aa  451  1e-126  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.104272  normal  0.451204 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0540  adenylosuccinate synthetase  53.02 
 
 
432 aa  452  1e-126  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.311763  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1583  adenylosuccinate synthetase  53.55 
 
 
440 aa  452  1e-126  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.147694  unclonable  2.27018e-07 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1978  adenylosuccinate synthetase  54.55 
 
 
432 aa  451  1e-125  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65230  adenylosuccinate synthetase  53.02 
 
 
430 aa  449  1e-125  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1985  adenylosuccinate synthetase  52.41 
 
 
444 aa  449  1e-125  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.133256  normal  0.151418 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0528  adenylosuccinate synthetase  54.31 
 
 
429 aa  450  1e-125  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.650318  normal  0.308275 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3357  adenylosuccinate synthetase  53.13 
 
 
431 aa  451  1e-125  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0113184  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1281  adenylosuccinate synthetase  52.62 
 
 
446 aa  450  1e-125  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0436  adenylosuccinate synthetase  53.49 
 
 
432 aa  450  1e-125  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  unclonable  4.72279e-08 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4937  adenylosuccinate synthetase  54.19 
 
 
430 aa  449  1e-125  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4680  adenylosuccinate synthetase  53.95 
 
 
430 aa  448  1e-125  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5667  adenylosuccinate synthetase  53.26 
 
 
430 aa  451  1e-125  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0577  adenylosuccinate synthetase  54.19 
 
 
430 aa  449  1e-125  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0497  adenylosuccinate synthetase  52.79 
 
 
432 aa  450  1e-125  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2772  adenylosuccinate synthetase  53.09 
 
 
438 aa  450  1e-125  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1282  adenylosuccinate synthetase  53.01 
 
 
431 aa  448  1e-125  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.705282  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0330  adenylosuccinate synthetase  53.02 
 
 
431 aa  449  1e-125  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07600  Adenylosuccinate synthetase  51.98 
 
 
430 aa  446  1e-124  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3716  adenylosuccinate synthetase  52.79 
 
 
432 aa  446  1e-124  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.316289  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2198  adenylosuccinate synthetase  52.3 
 
 
443 aa  445  1e-124  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04006  hypothetical protein  53.26 
 
 
432 aa  446  1e-124  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.263842  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4941  adenylosuccinate synthetase  53.49 
 
 
430 aa  446  1e-124  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00348011 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4219  adenylosuccinate synthetase  52.79 
 
 
431 aa  447  1e-124  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  3.17238e-05  hitchhiker  0.000431125 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3816  Adenylosuccinate synthase  53.26 
 
 
432 aa  446  1e-124  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3069  adenylosuccinate synthetase  52.9 
 
 
431 aa  448  1e-124  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00455582  normal  0.136181 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5009  adenylosuccinate synthetase  51.67 
 
 
458 aa  446  1e-124  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.470264  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4648  adenylosuccinate synthetase  53.26 
 
 
432 aa  446  1e-124  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.378806 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4420  adenylosuccinate synthetase  53.26 
 
 
432 aa  446  1e-124  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5693  adenylosuccinate synthetase  53.26 
 
 
432 aa  446  1e-124  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.580203  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002264  adenylosuccinate synthetase  53.32 
 
 
438 aa  446  1e-124  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.151372  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3914  adenylosuccinate synthetase  52.79 
 
 
432 aa  445  1e-124  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.923104  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4708  adenylosuccinate synthetase  53.26 
 
 
432 aa  446  1e-124  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4765  adenylosuccinate synthetase  53.49 
 
 
430 aa  446  1e-124  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04044  adenylosuccinate synthetase  53.26 
 
 
432 aa  446  1e-124  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.191338  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>