19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_2746 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_2746  DNA polymerase beta domain protein region  100 
 
 		 122 aa  240  5e-63  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0500  DNA polymerase beta domain protein region  50.85 
 
 		 135 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3226  DNA polymerase beta subunit  46.36 
 
 		 109 aa  101  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.082492 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3919  DNA polymerase beta subunit  45.05 
 
 		 117 aa  100  6e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.935838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2571  DNA polymerase beta domain protein region  36.97 
 
 		 126 aa  56.6  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.373399  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0104  DNA polymerase beta domain protein region  38.37 
 
 		 114 aa  52.4  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0041  DNA polymerase beta domain protein region  40.43 
 
 		 117 aa  52.4  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4420  DNA polymerase beta subunit  38.54 
 
 		 118 aa  49.7  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.478946  normal  0.142305 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0170  DNA polymerase beta subunit  39.68 
 
 		 95 aa  44.3  0.0005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0317  DNA polymerase beta domain protein region  29.73 
 
 		 121 aa  43.9  0.0007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0998  DNA polymerase beta subunit  45.45 
 
 		 151 aa  43.1  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0594708  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4127  hypothetical protein  37.5 
 
 		 191 aa  43.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000129079 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1067  DNA polymerase beta subunit  39.02 
 
 		 108 aa  42  0.003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.485724  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0515  DNA polymerase beta domain protein region  36.9 
 
 		 108 aa  41.2  0.005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0793119  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2316  DNA polymerase beta domain protein region  39.58 
 
 		 155 aa  40.8  0.006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.763015  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3228  hypothetical protein  30 
 
 		 206 aa  40.4  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0857934 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0855  DNA polymerase beta subunit  46.15 
 
 		 107 aa  40.4  0.008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.725816 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2422  DNA polymerase, beta-like region  26.47 
 
 		 109 aa  40  0.01  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2757  nucleotidyltransferase family protein  24.62 
 
 		 102 aa  40  0.01  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>