57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0975 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_0975  formaldehyde-activating enzyme  100 
 
 		 167 aa  332  2e-90  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0927434  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0367  formaldehyde-activating enzyme  68.12 
 
 		 160 aa  236  1e-61  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.203725  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2060  formaldehyde-activating enzyme  67.7 
 
 		 178 aa  230  8.000000000000001e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.189028  normal  0.41416 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6007  formaldehyde-activating enzyme  57.49 
 
 		 171 aa  201  3e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.100814  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5783  formaldehyde-activating enzyme  57.49 
 
 		 171 aa  201  4e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0971644  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1285  formaldehyde-activating enzyme  61.01 
 
 		 165 aa  198  3e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2390  formaldehyde-activating enzyme  60.62 
 
 		 175 aa  196  1.0000000000000001e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0032  formaldehyde-activating protein  58.08 
 
 		 169 aa  195  2.0000000000000003e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.848098 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0533  formaldehyde-activating enzyme  58.49 
 
 		 170 aa  195  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1785  formaldehyde-activating enzyme  58.49 
 
 		 170 aa  195  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1365  formaldehyde-activating protein  58.08 
 
 		 191 aa  193  9e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.745489  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3079  formaldehyde-activating enzyme  56.89 
 
 		 170 aa  192  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6487  formaldehyde-activating enzyme  55.69 
 
 		 169 aa  192  3e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.497311  normal  0.302319 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2169  formaldehyde-activating enzyme  57.23 
 
 		 170 aa  189  1e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.783809  normal  0.178175 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1834  formaldehyde-activating enzyme  57.23 
 
 		 170 aa  189  1e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3147  formaldehyde-activating enzyme  56.89 
 
 		 169 aa  189  2e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2436  formaldehyde-activating protein  55.69 
 
 		 169 aa  189  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.397979 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2612  formaldehyde-activating enzyme  53.29 
 
 		 169 aa  184  4e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0416881  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2866  formaldehyde-activating enzyme  55.62 
 
 		 170 aa  182  1.0000000000000001e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1994  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  56.69 
 
 		 396 aa  177  5.999999999999999e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2543  formaldehyde-activating enzyme  50.86 
 
 		 178 aa  167  6e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.234356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0988  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  56.33 
 
 		 392 aa  158  4e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1652  formaldehyde-activating enzyme  47.43 
 
 		 178 aa  157  6e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000163018  normal  0.176505 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0935  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  55.77 
 
 		 392 aa  156  1e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0033619  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1036  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  46.79 
 
 		 393 aa  150  7e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0996  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  47.13 
 
 		 403 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.566431 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1085  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  50.32 
 
 		 393 aa  143  1e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.136979  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0772  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  45.86 
 
 		 393 aa  143  1e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.58783 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1628  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  49.04 
 
 		 393 aa  128  3e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3063  formaldehyde-activating enzyme  39.88 
 
 		 177 aa  107  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6933  formaldehyde-activating enzyme  33.96 
 
 		 190 aa  106  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.587797  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1725  formaldehyde-activating enzyme  38.36 
 
 		 179 aa  102  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.393787  normal  0.0143668 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1450  formaldehyde-activating enzyme  38.36 
 
 		 179 aa  102  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.485811 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2627  putative formaldehyde-activating enzyme  39.04 
 
 		 177 aa  102  3e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.212894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1445  formaldehyde-activating enzyme  38.36 
 
 		 179 aa  101  4e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.318243 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3132  formaldehyde-activating enzyme  38.1 
 
 		 181 aa  101  4e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2364  putative formaldehyde-activating enzyme  35.76 
 
 		 182 aa  100  6e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000204771  normal  0.719365 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4369  formaldehyde-activating enzyme  37.67 
 
 		 181 aa  100  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.279882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2016  formaldehyde-activating enzyme  38.36 
 
 		 179 aa  100  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.560353  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2524  putative formaldehyde-activating enzyme  38.55 
 
 		 183 aa  99.4  2e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2825  hypothetical protein  32.08 
 
 		 174 aa  99.8  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4915  formaldehyde-activating enzyme  36.99 
 
 		 181 aa  97.8  5e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.090523  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5474  formaldehyde-activating enzyme  35.58 
 
 		 177 aa  96.7  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0338658  normal  0.0655052 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1627  formaldehyde-activating protein  36.3 
 
 		 179 aa  97.1  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.67854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2468  formaldehyde-activating protein  33.54 
 
 		 167 aa  92.4  3e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1542  hypothetical protein  35.44 
 
 		 167 aa  90.5  9e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1651  formaldehyde-activating enzyme  35.44 
 
 		 167 aa  90.5  9e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1721  hypothetical protein  35.44 
 
 		 167 aa  90.1  1e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.054067  hitchhiker  0.00446803 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1799  formaldehyde-activating enzyme  33.56 
 
 		 178 aa  89.4  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3519  formaldehyde-activating enzyme  33.13 
 
 		 211 aa  86.3  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4467  formaldehyde-activating protein  31.71 
 
 		 182 aa  85.1  4e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.164696 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3465  Formaldehyde-activating enzyme (Fae)  30.49 
 
 		 182 aa  82.8  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.719607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3143  formaldehyde-activating protein  30.49 
 
 		 182 aa  82.8  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.389753  normal  0.873661 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3340  Formaldehyde-activating enzyme (Fae)  30.49 
 
 		 182 aa  81.6  0.000000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3403  Formaldehyde-activating enzyme (Fae)  29.27 
 
 		 182 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2778  formaldehyde-activating domain-containing protein  40.51 
 
 		 119 aa  66.2  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0614  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  31.65 
 
 		 391 aa  65.9  0.0000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>