35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_0029 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_0029  holo-ACP synthase, malonate decarboxylase-specific  100 
 
 		 219 aa  413  1e-114  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0520843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0028  hypothetical protein  92.24 
 
 		 218 aa  338  4e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.920505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0050  hypothetical protein  79.45 
 
 		 219 aa  330  1e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.390549  normal  0.0698555 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6853  hypothetical protein  76.26 
 
 		 218 aa  310  6.999999999999999e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3155  holo-ACP synthase, malonate decarboxylase-specific  70.78 
 
 		 218 aa  285  4e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0171  hypothetical protein  56.81 
 
 		 219 aa  219  3e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.846138 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0792  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  48.6 
 
 		 222 aa  152  4e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.147641  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1273  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  48.6 
 
 		 222 aa  152  4e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0280828  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1245  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  51.06 
 
 		 222 aa  152  5e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0753275 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2046  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  46.92 
 
 		 222 aa  152  5e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4416  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  47.66 
 
 		 232 aa  145  3e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.356238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3188  holo-ACP synthase, malonate decarboxylase-specific  44.05 
 
 		 245 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.605974 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1163  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  45.58 
 
 		 222 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.707422  normal  0.167545 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1151  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  46.26 
 
 		 222 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1260  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  45.39 
 
 		 296 aa  102  3e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.199636  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0790  malonate decarboxylase  38.86 
 
 		 229 aa  103  3e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00220342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0610  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  45.39 
 
 		 296 aa  102  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.785994  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0543  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  45.39 
 
 		 308 aa  102  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.39768  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3033  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  45.39 
 
 		 308 aa  102  4e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.623128  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1486  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  45.39 
 
 		 308 aa  101  9e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.876381  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1456  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  45.39 
 
 		 308 aa  101  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0184396  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2799  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  45.71 
 
 		 294 aa  100  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0976082  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1587  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  45.39 
 
 		 307 aa  100  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4290  hypothetical protein  41.06 
 
 		 209 aa  98.2  9e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1077  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  37.67 
 
 		 213 aa  96.3  3e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1847  malonate decarboxylase  32.37 
 
 		 231 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.705884  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1764  holo-ACP synthase, malonate decarboxylase-specific  35.29 
 
 		 237 aa  78.6  0.00000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5370  holo-ACP synthase, malonate decarboxylase-specific  32.7 
 
 		 229 aa  75.9  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0548916  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0075  holo-ACP synthase, malonate decarboxylase-specific  32.73 
 
 		 253 aa  72  0.000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4016  malonate decarboxylase  29.82 
 
 		 222 aa  68.2  0.00000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2892  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  32.47 
 
 		 252 aa  55.5  0.0000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0787604  normal  0.0710753 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1062  hypothetical protein  31.21 
 
 		 244 aa  55.1  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2496  hypothetical protein  23.42 
 
 		 207 aa  54.3  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3293  hypothetical protein  33.33 
 
 		 237 aa  50.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1142  putative malonate decarboxylase, subunit E  25.81 
 
 		 234 aa  50.4  0.00002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0172841  normal  0.360178 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>