20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_2038 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_2038  membrane protein-like protein  100 
 
 		 184 aa  359  1e-98  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0752149  normal  0.0532499 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2429  membrane protein-like protein  47.4 
 
 		 169 aa  147  6e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.419091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2369  membrane protein-like protein  48.98 
 
 		 173 aa  125  5e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12921  hypothetical protein  33.57 
 
 		 151 aa  50.8  0.000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0893341 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0015  hypothetical protein  25.77 
 
 		 380 aa  49.3  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1464  membrane protein-like  35.4 
 
 		 151 aa  48.9  0.00004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.121948  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0097  hypothetical protein  31.13 
 
 		 347 aa  47.8  0.00008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0146368  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2884  hypothetical protein  32.95 
 
 		 360 aa  46.6  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3131  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  29.3 
 
 		 738 aa  46.6  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.861685  normal  0.88928 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1329  hypothetical protein  32.23 
 
 		 217 aa  46.2  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.666788  normal  0.253277 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2765  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  29.3 
 
 		 738 aa  45.4  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.617524 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1017  hypothetical protein  30.65 
 
 		 217 aa  43.9  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.120147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0765  hypothetical protein  30.65 
 
 		 217 aa  43.9  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.644467 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2889  hypothetical protein  28.66 
 
 		 740 aa  44.3  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.777719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1157  hypothetical protein  24.36 
 
 		 238 aa  44.3  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.596662  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4389  hypothetical protein  27.61 
 
 		 361 aa  43.5  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5449  hypothetical protein  24.19 
 
 		 189 aa  42.4  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.962565 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1226  hypothetical protein  23.9 
 
 		 636 aa  42  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000692495  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3032  hypothetical protein  27.22 
 
 		 770 aa  42.4  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0228594  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1914  protein of unknown function DUF939  31.76 
 
 		 395 aa  42  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>