275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2084 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2084  glycerol-3-phosphate cytidyltransferase  100 
 
 
139 aa  285  1e-76  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0657652  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0427  cytidyltransferase-related protein  65.47 
 
 
143 aa  195  1.0000000000000001e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0791  cytidyltransferase-like protein  60.29 
 
 
143 aa  174  2e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0310  cytidyltransferase-related domain protein  56.12 
 
 
153 aa  160  5.0000000000000005e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.531506  normal  0.452914 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2296  cytidyltransferase-like protein  56.12 
 
 
149 aa  160  7e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0408  hypothetical protein  51.09 
 
 
140 aa  160  8.000000000000001e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0199555  hitchhiker  0.00270844 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0209  cytidyltransferase-like protein  54.01 
 
 
148 aa  158  2e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2404  cytidyltransferase-related  50.75 
 
 
156 aa  150  4e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0621  cytidyltransferase-related domain protein  50.36 
 
 
148 aa  142  2e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0747  cytidyltransferase-related domain protein  50 
 
 
149 aa  140  4e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00798293  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1909  cytidyltransferase-related domain protein  51.49 
 
 
143 aa  137  3.9999999999999997e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0344857  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2116  cytidyltransferase-related domain protein  48.95 
 
 
143 aa  137  7e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2406  cytidyltransferase-related domain protein  47.89 
 
 
153 aa  135  2e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.508544  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1304  cytidyltransferase-like protein  50 
 
 
156 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.494614  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0715  cytidyltransferase-related domain protein  46.04 
 
 
142 aa  127  4.0000000000000003e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1736  cytidyltransferase-like protein  43.17 
 
 
216 aa  111  4.0000000000000004e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.355762  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1298  cytidyltransferase-like protein  44.7 
 
 
206 aa  109  1.0000000000000001e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000283099 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0190  cytidyltransferase-like protein  43.8 
 
 
150 aa  107  6e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.847612  normal  0.946455 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1930  cytidyltransferase-related domain protein  42.45 
 
 
226 aa  106  9.000000000000001e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.791436  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0750  cytidyltransferase-like protein  42.34 
 
 
150 aa  106  9.000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1712  cytidyltransferase-like protein  42.34 
 
 
150 aa  105  2e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.432331  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1245  cytidyltransferase-like protein  38.85 
 
 
241 aa  105  3e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0187562  hitchhiker  0.00542026 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2337  cytidyltransferase-like protein  35.77 
 
 
238 aa  103  7e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.022864 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0687  cytidyltransferase-like protein  32.61 
 
 
226 aa  95.5  2e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.285167 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2107  cytidyltransferase-like protein  33.33 
 
 
223 aa  93.2  1e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0688  cytidyltransferase-like protein  51.06 
 
 
225 aa  89.7  1e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0246  cytidyltransferase-like protein  40.88 
 
 
151 aa  86.3  1e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1979  cytidyltransferase-like protein  31.39 
 
 
226 aa  84.3  4e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.278192  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16500  RfaeE domain II  35.29 
 
 
158 aa  74.7  0.0000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000908825  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1884  bifunctional ADP-heptose synthase  35.25 
 
 
173 aa  71.6  0.000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1685  cytidyltransferase-like protein  33.81 
 
 
169 aa  72  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0309  putative transferase protein  34.07 
 
 
166 aa  70.9  0.000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0711  bifunctional ADP-heptose synthase  39.8 
 
 
455 aa  69.7  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0342906  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0164  rfaE bifunctional protein  33.33 
 
 
178 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.701084 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0171  rfaE bifunctional protein  33.33 
 
 
178 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0537  bifunctional heptose 7-phosphate kinase/heptose 1-phosphate adenyltransferase  39.13 
 
 
474 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.673885 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1591  cytidyltransferase-related domain protein  32.59 
 
 
363 aa  67.8  0.00000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4715  rfaE bifunctional protein  34.04 
 
 
166 aa  67.8  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.328325 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2577  cytidyltransferase-like protein  41.76 
 
 
160 aa  67.8  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.526786  normal  0.149536 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2819  rfaE bifunctional protein  32.59 
 
 
161 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.675163  normal  0.258332 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2613  bifunctional heptose 7-phosphate kinase/heptose 1-phosphate adenyltransferase  34.56 
 
 
502 aa  66.2  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0100846  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1575  cytidyltransferase-related domain protein  34.15 
 
 
501 aa  66.6  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.528601  normal  0.0217414 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2639  rfaE bifunctional protein  36.97 
 
 
461 aa  66.2  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2922  rfaE bifunctional protein  33.33 
 
 
161 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.69152 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4994  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  34.51 
 
 
158 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327738  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44680  bifunctional heptose 7-phosphate kinase/heptose 1-phosphate adenyltransferase  38.04 
 
 
474 aa  65.9  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.290309  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1901  bifunctional ADP-heptose synthase  31.88 
 
 
179 aa  65.5  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0730146  normal  0.846811 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5731  bifunctional heptose 7-phosphate kinase/heptose 1-phosphate adenyltransferase  38.04 
 
 
474 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4229  cytidyltransferase-related protein  32.59 
 
 
160 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.204202 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0616  rfaE bifunctional protein  33.33 
 
 
163 aa  65.5  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.584874  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2293  bifunctional ADP-heptose synthase  33.33 
 
 
161 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.401253  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2956  rfaE bifunctional protein  32.59 
 
 
161 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2907  rfaE bifunctional protein  33.33 
 
 
161 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0202219  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3971  cytidyltransferase-like protein  32.59 
 
 
175 aa  65.9  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0646  bifunctional heptose 7-phosphate kinase/heptose 1-phosphate adenyltransferase  36.17 
 
 
482 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66060  bifunctional heptose 7-phosphate kinase/heptose 1-phosphate adenyltransferase  38.04 
 
 
474 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0146  cytidyltransferase-related domain protein  30.88 
 
 
495 aa  65.1  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4983  lipopolysaccharide biosynthesis protein RfaE  36.96 
 
 
474 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1282  putative ADP-heptose synthase  30.71 
 
 
490 aa  64.7  0.0000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6250  ADP-heptose synthase bifunctional sugarkinase/adenylyltransferase  32.59 
 
 
161 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.264846 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1969  rfaE bifunctional protein  36.07 
 
 
162 aa  64.7  0.0000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0105  cytidyltransferase-like protein  32.77 
 
 
171 aa  64.3  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3788  bifunctional ADP-heptose synthase  29.85 
 
 
223 aa  64.3  0.0000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2610  cytidyltransferase-related  39.36 
 
 
163 aa  64.3  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.248173  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0487  rfaE bifunctional protein  31.85 
 
 
160 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0349421 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2696  cytidyltransferase-related domain protein  39.56 
 
 
163 aa  63.9  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0199265  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2791  cytidyltransferase-related domain protein  39.36 
 
 
163 aa  63.9  0.0000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0240  putative transferase protein  32.59 
 
 
159 aa  63.9  0.0000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1676  rfaE bifunctional protein  34.43 
 
 
162 aa  63.5  0.0000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11230  cytidyltransferase-related enzyme  34.53 
 
 
484 aa  63.5  0.0000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.448325  normal  0.110426 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0425  aut protein  31.85 
 
 
161 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.121089  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0072  cytidyltransferase-like protein  31.85 
 
 
161 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.41814  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0607  bifunctional ADP-heptose synthase  31.85 
 
 
161 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0484  bifunctional heptose 7-phosphate kinase/heptose 1-phosphate adenyltransferase  34.78 
 
 
474 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.198605  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3395  rfaE bifunctional protein  29.71 
 
 
487 aa  63.2  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1355  cytidyltransferase-like protein  31.85 
 
 
161 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.29998  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0864  rfaE bifunctional protein  30.43 
 
 
487 aa  62.8  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.848286  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3207  cytidyltransferase-like protein  31.85 
 
 
161 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0397  rfaE bifunctional protein  31.85 
 
 
160 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.32955  normal  0.0151006 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1579  rfaE bifunctional protein  27.86 
 
 
158 aa  63.2  0.000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0238  cytidyltransferase-like protein  31.85 
 
 
161 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0597  bifunctional heptose 7-phosphate kinase/heptose 1-phosphate adenyltransferase  34.78 
 
 
473 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0444  aut protein  31.85 
 
 
161 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.47822  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3975  rfaE bifunctional protein  39.13 
 
 
562 aa  63.2  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4934  bifunctional heptose 7-phosphate kinase/heptose 1-phosphate adenyltransferase  35.87 
 
 
473 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5043  cytidyltransferase-related domain protein  35.04 
 
 
494 aa  62.8  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.516423  normal  0.0391511 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0577  udp-N-acetylglucosamine--n-acetylmuramyl- (pentapeptide)pyrophosphoryl -undecaprenol n-acetylglucosamine transferase (undecaprenyl-PP-MurNAc-pentapeptide-udpglcnac glcnactransferase)  32.98 
 
 
472 aa  62  0.000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.347278  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0201  rfaE bifunctional protein  30.37 
 
 
160 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0662  rfaE bifunctional protein  33.09 
 
 
485 aa  62.4  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.148803 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3591  rfaE bifunctional protein  29.71 
 
 
488 aa  62  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00169311  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0532  bifunctional heptose 7-phosphate kinase/heptose 1-phosphate adenyltransferase  35.87 
 
 
473 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0351851 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4983  bifunctional heptose 7-phosphate kinase/heptose 1-phosphate adenyltransferase  35.87 
 
 
473 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0786  bifunctional heptose 7-phosphate kinase/heptose 1-phosphate adenyltransferase  39.18 
 
 
481 aa  62.8  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4806  bifunctional heptose 7-phosphate kinase/heptose 1-phosphate adenyltransferase  35.87 
 
 
473 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4360  rfaE bifunctional protein  36.96 
 
 
643 aa  61.6  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0405663 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0244  bifunctional protein HldE  35.87 
 
 
468 aa  61.6  0.000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0769  D-beta-D-heptose 1-phosphate adenylyltransferase / D-alpha,beta-D-heptose 7-phosphate 1-kinase  35.87 
 
 
488 aa  61.6  0.000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00625792 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3038  cytidyltransferase-like protein  29.86 
 
 
170 aa  62  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00756978 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0113  cytidyltransferase-like protein  27.07 
 
 
139 aa  62  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4553  rfaE bifunctional protein  29.71 
 
 
162 aa  61.6  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.587181 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>