57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2060 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2060  formaldehyde-activating enzyme  100 
 
 
178 aa  360  7e-99  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.189028  normal  0.41416 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0367  formaldehyde-activating enzyme  72.5 
 
 
160 aa  254  4e-67  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.203725  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0975  formaldehyde-activating enzyme  67.7 
 
 
167 aa  204  8e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0927434  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5783  formaldehyde-activating enzyme  57.32 
 
 
171 aa  199  1e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0971644  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2390  formaldehyde-activating enzyme  57.49 
 
 
175 aa  198  4e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1365  formaldehyde-activating protein  59.15 
 
 
191 aa  197  5e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.745489  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0032  formaldehyde-activating protein  57.32 
 
 
169 aa  197  8e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.848098 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6007  formaldehyde-activating enzyme  56.1 
 
 
171 aa  194  4e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.100814  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1285  formaldehyde-activating enzyme  58.49 
 
 
165 aa  194  8e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0533  formaldehyde-activating enzyme  55.49 
 
 
170 aa  193  1e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6487  formaldehyde-activating enzyme  56.1 
 
 
169 aa  193  1e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.497311  normal  0.302319 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2436  formaldehyde-activating protein  56.1 
 
 
169 aa  192  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.397979 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1785  formaldehyde-activating enzyme  54.88 
 
 
170 aa  192  3e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2866  formaldehyde-activating enzyme  56.17 
 
 
170 aa  189  1e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1834  formaldehyde-activating enzyme  54.27 
 
 
170 aa  188  4e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2169  formaldehyde-activating enzyme  54.27 
 
 
170 aa  188  4e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.783809  normal  0.178175 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2612  formaldehyde-activating enzyme  55.49 
 
 
169 aa  186  1e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0416881  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3079  formaldehyde-activating enzyme  55.49 
 
 
170 aa  185  3e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3147  formaldehyde-activating enzyme  55.49 
 
 
169 aa  183  1e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0988  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  60.76 
 
 
392 aa  177  5e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1994  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  51.59 
 
 
396 aa  171  5e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1036  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  49.36 
 
 
393 aa  161  5e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0935  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  54.49 
 
 
392 aa  161  5e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0033619  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1652  formaldehyde-activating enzyme  50 
 
 
178 aa  160  9e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  1.63018e-10  normal  0.176505 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0996  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  49.68 
 
 
403 aa  159  2e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.566431 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2543  formaldehyde-activating enzyme  48.84 
 
 
178 aa  154  6e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.234356  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0772  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  48.41 
 
 
393 aa  153  2e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.58783 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1085  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  51.59 
 
 
393 aa  147  1e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.136979  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1628  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  49.68 
 
 
393 aa  139  2e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6933  formaldehyde-activating enzyme  37.11 
 
 
190 aa  117  9e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.587797  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2825  hypothetical protein  36.08 
 
 
174 aa  114  6e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1651  formaldehyde-activating enzyme  38.89 
 
 
167 aa  105  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1542  hypothetical protein  38.89 
 
 
167 aa  105  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1725  formaldehyde-activating enzyme  36.99 
 
 
179 aa  104  5e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.393787  normal  0.0143668 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1450  formaldehyde-activating enzyme  36.99 
 
 
179 aa  104  5e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.485811 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1721  hypothetical protein  38.89 
 
 
167 aa  105  5e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.054067  hitchhiker  0.00446803 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1445  formaldehyde-activating enzyme  36.99 
 
 
179 aa  104  6e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.318243 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2364  putative formaldehyde-activating enzyme  35.76 
 
 
182 aa  104  9e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  2.04771e-07  normal  0.719365 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2468  formaldehyde-activating protein  39.46 
 
 
167 aa  102  3e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3132  formaldehyde-activating enzyme  39.04 
 
 
181 aa  99.8  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5474  formaldehyde-activating enzyme  36.81 
 
 
177 aa  100  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0338658  normal  0.0655052 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2524  putative formaldehyde-activating enzyme  39.16 
 
 
183 aa  99  3e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4369  formaldehyde-activating enzyme  36.3 
 
 
181 aa  99.4  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.279882  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3063  formaldehyde-activating enzyme  38.36 
 
 
177 aa  99  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4915  formaldehyde-activating enzyme  35.62 
 
 
181 aa  98.6  4e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.090523  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2016  formaldehyde-activating enzyme  35.62 
 
 
179 aa  98.2  5e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.560353  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2627  putative formaldehyde-activating enzyme  37.67 
 
 
177 aa  98.2  6e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.212894  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1627  formaldehyde-activating protein  35.85 
 
 
179 aa  96.7  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.67854  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3519  formaldehyde-activating enzyme  34.36 
 
 
211 aa  96.3  2e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1799  formaldehyde-activating enzyme  34.25 
 
 
178 aa  92.8  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3465  Formaldehyde-activating enzyme (Fae)  29.88 
 
 
182 aa  84  1e-15  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.719607  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3143  formaldehyde-activating protein  29.88 
 
 
182 aa  84  1e-15  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.389753  normal  0.873661 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3340  Formaldehyde-activating enzyme (Fae)  29.88 
 
 
182 aa  83.2  2e-15  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4467  formaldehyde-activating protein  29.27 
 
 
182 aa  81.6  5e-15  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.164696 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3403  Formaldehyde-activating enzyme (Fae)  29.27 
 
 
182 aa  80.9  8e-15  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0614  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  32.7 
 
 
391 aa  66.6  2e-10  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2778  formaldehyde-activating domain-containing protein  37.66 
 
 
119 aa  55.1  5e-07  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>