46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0718 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0718  hypothetical protein  100 
 
 		 147 aa  293  6e-79  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1471  hypothetical protein  63.5 
 
 		 137 aa  189  9e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1309  hypothetical protein  61.42 
 
 		 132 aa  159  1e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0648242  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0506  protein of unknown function DUF126  55.04 
 
 		 130 aa  145  1.0000000000000001e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0208  hypothetical protein  56.49 
 
 		 137 aa  145  1.0000000000000001e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.920123  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1457  hypothetical protein  56.25 
 
 		 146 aa  146  1.0000000000000001e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.219192 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0800  aconitase subunit 2  56.82 
 
 		 131 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000377463 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1041  hypothetical protein  54.26 
 
 		 138 aa  141  3e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.587371 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0615  predicted aconitase subunit 2  54.33 
 
 		 142 aa  129  1.0000000000000001e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.478753  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0019  hypothetical protein  49.23 
 
 		 131 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6392  hypothetical protein  41.48 
 
 		 154 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6625  hypothetical protein  41.48 
 
 		 154 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.925457 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6223  hypothetical protein  41.48 
 
 		 154 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1754  hypothetical protein  47.37 
 
 		 130 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0149  hypothetical protein  47.37 
 
 		 130 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.104212  normal  0.0128163 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0709  hypothetical protein  47.37 
 
 		 130 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0452  hypothetical protein  44.78 
 
 		 138 aa  114  5e-25  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.265076  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3212  protein of unknown function DUF126  40.15 
 
 		 150 aa  110  7.000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0797  hypothetical protein  50 
 
 		 136 aa  106  1e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0054  hypothetical protein  45.54 
 
 		 128 aa  100  6e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47930  hypothetical protein  35.37 
 
 		 580 aa  87.8  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.444415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4133  hypothetical protein  38.28 
 
 		 580 aa  86.7  9e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4854  hypothetical protein  41.84 
 
 		 563 aa  86.3  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.684084  normal  0.761618 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0848  protein of unknown function DUF126  40.32 
 
 		 120 aa  85.5  2e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1865  hypothetical protein  42.5 
 
 		 142 aa  83.6  8e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.00000298888  normal  0.822078 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08629  DUF521 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G00490)  40.2 
 
 		 576 aa  83.2  0.000000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.255951  normal  0.881341 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2143  protein of unknown function DUF521  35.48 
 
 		 580 aa  81.6  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.180277  normal  0.183216 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47407  predicted protein  40.96 
 
 		 652 aa  77.4  0.00000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1693  hypothetical protein  35.46 
 
 		 599 aa  75.1  0.0000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3862  hypothetical protein  36.84 
 
 		 563 aa  74.3  0.0000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0854  hypothetical protein  36.89 
 
 		 126 aa  71.6  0.000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.104037 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0009  hypothetical protein  35.51 
 
 		 155 aa  68.6  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.604454  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2339  aconitase subunit 2  37.11 
 
 		 154 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1423  aconitase subunit 2  36.96 
 
 		 166 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00470678  normal  0.0794476 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3637  hypothetical protein  34.02 
 
 		 149 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.983078  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3760  hypothetical protein  36.46 
 
 		 159 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0710107  normal  0.198691 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3763  hypothetical protein  36.46 
 
 		 159 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.177508 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1399  hypothetical protein  33.08 
 
 		 135 aa  66.6  0.0000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.903911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5491  hypothetical protein  34.02 
 
 		 149 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.982679 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4603  hypothetical protein  36.46 
 
 		 159 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4970  hypothetical protein  35.42 
 
 		 152 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2555  hypothetical protein  32 
 
 		 150 aa  63.5  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000224136  normal  0.128546 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1919  hypothetical protein  33.33 
 
 		 116 aa  62.4  0.000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0950  aconitase subunit 2  31.46 
 
 		 118 aa  58.9  0.00000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2206  hypothetical protein  31.62 
 
 		 147 aa  47  0.00009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.292408  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4968  hypothetical protein  24.77 
 
 		 158 aa  45.1  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.861184  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>