115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_1364 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_1364  hypothetical protein  100 
 
 
340 aa  682  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.953103  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3465  bile acid:sodium symporter  46.25 
 
 
348 aa  281  2e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.440703 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04030  bile acid/sodium symporter  47.49 
 
 
334 aa  278  1e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3177  bile acid:sodium symporter  49.23 
 
 
347 aa  275  8e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.98524  normal  0.0121029 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3262  hypothetical protein  46.41 
 
 
333 aa  275  8e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.528574  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5029  hypothetical protein  49.38 
 
 
330 aa  275  9e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0527  hypothetical protein  44.88 
 
 
363 aa  272  5e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  5.23356e-05 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0321  Bile acid:sodium symporter  48.91 
 
 
323 aa  270  2e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.15131 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3320  Bile acid:sodium symporter  48.37 
 
 
334 aa  269  6e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3619  Bile acid:sodium symporter  49.21 
 
 
344 aa  268  1e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0585  lipoprotein transmembrane  44.55 
 
 
341 aa  265  1e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38320  bile acid/Na+ symporter family transporter  47.3 
 
 
333 aa  263  2e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0277216 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2813  Bile acid:sodium symporter  43.47 
 
 
343 aa  263  3e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2407  Bile acid:sodium symporter  42.81 
 
 
343 aa  263  4e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.195437  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2904  bile acid:sodium symporter  46.57 
 
 
334 aa  261  2e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.731183  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2538  lipoprotein transmembrane  44.38 
 
 
358 aa  261  2e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.405057 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2501  bile acid:sodium symporter  45.31 
 
 
324 aa  260  3e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2565  bile acid/Na+ symporter family protein  43.49 
 
 
332 aa  258  8e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  8.97855e-06  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2697  bile acid/Na+ symporter family protein  43.49 
 
 
332 aa  256  3e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  2.09356e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3641  sodium:bile acid symporter family protein  43.49 
 
 
332 aa  256  3e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  2.61961e-06  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2029  sodium/bile acid symporter family protein  45.09 
 
 
346 aa  256  4e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3064  sodium/bile acid symporter family protein  45.09 
 
 
346 aa  256  4e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3390  sodium/bile acid symporter family protein  45.09 
 
 
346 aa  256  4e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0339  sodium/bile acid symporter family protein  45.09 
 
 
346 aa  256  4e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2255  sodium/bile acid symporter family protein  45.09 
 
 
346 aa  256  4e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0532  sodium/bile acid symporter family protein  45.09 
 
 
382 aa  256  5e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.180228  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2770  sodium:bile acid symporter family protein  43.49 
 
 
332 aa  256  5e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  2.64758e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3255  bile acid:sodium symporter  48.12 
 
 
332 aa  255  9e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.50904 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2714  bile acid:sodium symporter  45.95 
 
 
331 aa  255  9e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.476045  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0352  sodium/bile acid symporter family protein  45.09 
 
 
346 aa  254  1e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.446247  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02270  hypothetical protein  43.2 
 
 
332 aa  254  2e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  8.38069e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2738  hypothetical protein  47.22 
 
 
329 aa  254  2e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.889143  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1269  bile acid:sodium symporter  43.2 
 
 
332 aa  254  2e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  9.08139e-08  hitchhiker  0.000128844 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3402  hypothetical protein  47.52 
 
 
329 aa  254  2e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.431314  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02309  predicted inner membrane protein  43.2 
 
 
332 aa  254  2e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  8.32535e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2544  bile acid/Na+ symporter family protein  43.2 
 
 
332 aa  254  2e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  9.83747e-12  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1252  Bile acid:sodium symporter  43.2 
 
 
332 aa  254  2e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000190028  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0302  sodium/bile acid symporter family protein  45.97 
 
 
394 aa  253  3e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0112  hypothetical protein  42.99 
 
 
328 aa  252  7e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0657186 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3613  bile acid:sodium symporter  42.86 
 
 
338 aa  251  2e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.423949  hitchhiker  0.00964207 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4937  Bile acid:sodium symporter  43.24 
 
 
335 aa  250  3e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0152  bile acid:sodium symporter  45.56 
 
 
340 aa  249  6e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.20925 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0247  bile acid:sodium symporter  44.85 
 
 
324 aa  248  9e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2382  bile acid:sodium symporter  45.67 
 
 
330 aa  247  2e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2937  bile acid:sodium symporter  42.31 
 
 
331 aa  247  3e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00230251  normal  0.120648 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2618  bile acid/Na+ symporter family protein  44.54 
 
 
332 aa  246  4e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2144  Bile acid:sodium symporter  43.88 
 
 
333 aa  246  4e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2569  transporter, bile acid/Na+ symporter family  44.54 
 
 
332 aa  245  8e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000515206  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2660  transporter bile acid/Na+ symporter family  44.54 
 
 
332 aa  245  8e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2484  bile acid:sodium symporter  42.12 
 
 
331 aa  245  9e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.846841  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2965  bile acid:sodium symporter  43.98 
 
 
343 aa  244  1e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2684  bile acid/Na+ symporter family transporter  44.25 
 
 
332 aa  244  2e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.68374  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3017  bile acid:sodium symporter  45 
 
 
347 aa  243  3e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2790  bile acid/Na+ symporter family transporter  44.54 
 
 
332 aa  243  4e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4465  bile acid:sodium symporter  46.5 
 
 
333 aa  243  4e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1906  Bile acid:sodium symporter  42.94 
 
 
331 aa  242  5e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2880  bile acid:sodium symporter  45 
 
 
347 aa  242  6e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1098  bile acid:sodium symporter  43.61 
 
 
336 aa  242  9e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.981697  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6319  bile acid/sodium symporter  43.24 
 
 
343 aa  241  9e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2877  bile acid/Na+ symporter family protein  45.95 
 
 
333 aa  241  1e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2812  bile acid:sodium symporter  45.59 
 
 
333 aa  241  2e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.885659  normal  0.695799 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2970  bile acid:sodium symporter  44.69 
 
 
343 aa  240  3e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2990  bile acid:sodium symporter  44.38 
 
 
343 aa  240  3e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2356  bile acid:sodium symporter  44.69 
 
 
343 aa  240  3e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.385828  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4282  putative sodium/bile acid symporter family protein  44.55 
 
 
342 aa  239  7e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.175014 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2034  Bile acid:sodium symporter  43.29 
 
 
330 aa  238  8e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.639895  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0807  Bile acid:sodium symporter  41.98 
 
 
357 aa  238  1e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.308554 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0427  Bile acid:sodium symporter  45.26 
 
 
342 aa  236  6e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.866752 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2334  Bile acid:sodium symporter  43.73 
 
 
329 aa  234  2e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.87771  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1029  sodium/bile acid symporter family protein  45.48 
 
 
321 aa  233  3e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1064  sodium/bile acid symporter family protein  45.48 
 
 
321 aa  233  3e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.763791  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2484  bile acid:sodium symporter  42.06 
 
 
328 aa  228  1e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.284228  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0525  bile acid:sodium symporter  42.51 
 
 
336 aa  228  1e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0139  hypothetical protein  38.58 
 
 
326 aa  228  2e-58  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3442  bile acid:sodium symporter  42.11 
 
 
330 aa  226  3e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.176045  hitchhiker  0.000533491 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2148  bile acid:sodium symporter  43.84 
 
 
344 aa  227  3e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3716  Bile acid:sodium symporter  43.41 
 
 
343 aa  222  6e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0440669 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2250  hypothetical protein  41.72 
 
 
332 aa  220  4e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  2.288e-05 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0326  Bile acid:sodium symporter  39.62 
 
 
325 aa  218  9e-56  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0453748 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1994  hypothetical protein  42.51 
 
 
342 aa  217  2e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1880  putative sodium/bile acid symporter family protein  42.51 
 
 
342 aa  216  3e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2266  putative sodium/bile acid symporter family protein  42.81 
 
 
342 aa  216  4e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4831  putative symporter family protein  43.22 
 
 
332 aa  215  8e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.900242  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0648  transporter, putative  41.98 
 
 
342 aa  214  1e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2427  bile acid:sodium symporter  39.33 
 
 
335 aa  214  2e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0574524  normal  0.0414588 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0866  bile acid:sodium symporter  39.64 
 
 
339 aa  211  1e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.964069  normal  0.299881 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4216  Bile acid:sodium symporter  40.37 
 
 
329 aa  208  1e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0747  transporter, putative  42.22 
 
 
342 aa  208  1e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17200  predicted Na+-dependent transporter  41.72 
 
 
328 aa  208  1e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2103  Bile acid:sodium symporter  37.42 
 
 
348 aa  206  6e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4379  bile acid:sodium symporter  41.67 
 
 
322 aa  206  7e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.603742 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3572  hypothetical protein  45.69 
 
 
328 aa  204  2e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2649  bile acid:sodium symporter  45.93 
 
 
335 aa  202  9e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.19525 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4204  bile acid:sodium symporter  41.41 
 
 
330 aa  199  8e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.360906 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3906  bile acid:sodium symporter  36.76 
 
 
378 aa  197  2e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.926991 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3818  bile acid:sodium symporter  36.44 
 
 
332 aa  194  1e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.530909  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3205  Bile acid:sodium symporter  38.84 
 
 
328 aa  189  8e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  2.45995e-06 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1125  Bile acid:sodium symporter  36.84 
 
 
341 aa  181  2e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1899  Bile acid:sodium symporter  35.87 
 
 
338 aa  172  1e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4668  Na+-dependent transporter-like protein  37.8 
 
 
337 aa  170  3e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>