72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1140 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA1140  hydrogenase subunit  100 
 
 		 225 aa  441  1e-123  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1263  hypothetical protein  44.81 
 
 		 219 aa  187  1e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.14188  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0918  hydrogenase 4 membrane component  45.75 
 
 		 219 aa  186  2e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.911214 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0109  hydrogenase 4 membrane component  44.81 
 
 		 219 aa  186  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1530  putative hydrogenase, membrane subunit  44.81 
 
 		 219 aa  185  6e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1615  putative hydrogenase, membrane subunit  44.81 
 
 		 219 aa  185  6e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4669  hydrogenase 4 subunit E  45.28 
 
 		 219 aa  184  7e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.253819  normal  0.171348 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0327  hypothetical protein  44.34 
 
 		 219 aa  184  8e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.704563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0177  hypothetical protein  44.81 
 
 		 219 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.25299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3290  hydrogenase 4 membrane component  45.75 
 
 		 219 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.540565  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6067  hypothetical protein  42.86 
 
 		 219 aa  180  1e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0736972  hitchhiker  0.000527865 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2151  hydrogenase-4, E subunit  46.63 
 
 		 225 aa  167  1e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1809  hydrogenase 4 membrane component  46.63 
 
 		 225 aa  167  1e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0168  putative hydrogenase-4 component E  42.92 
 
 		 226 aa  156  3e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.456786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2476  hypothetical protein  42.65 
 
 		 220 aa  156  3e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.815072 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3853  hypothetical protein  40.89 
 
 		 220 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.395736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1262  hypothetical protein  40.89 
 
 		 220 aa  151  8e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0296387 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1398  hydrogenase 4 membrane component (E)-like protein  39.9 
 
 		 229 aa  148  6e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1689  hydrogenase, membrane subunit 2-like protein  34.31 
 
 		 220 aa  135  7.000000000000001e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.674662  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0931  hypothetical protein  41.18 
 
 		 220 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.229661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2462  hydrogenase 4 membrane component (E)  36.94 
 
 		 222 aa  134  1.9999999999999998e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.495145 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1305  hydrogenase 4 membrane component (E)  29.52 
 
 		 222 aa  124  1e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0701  hydrogenase 4 membrane component (E)  29.33 
 
 		 215 aa  112  6e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.202504  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0793  hypothetical protein  32.54 
 
 		 214 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4286  hypothetical protein  40.17 
 
 		 218 aa  96.7  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00379585  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10086  hydrogenase hycP  30.14 
 
 		 220 aa  95.9  5e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000000000096186  normal  0.18173 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0338  NAD-dependent dehydrogenase subunit  29.27 
 
 		 213 aa  91.7  8e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2556  NAD-dependent dehydrogenase subunit  28.71 
 
 		 213 aa  89.7  4e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1792  hydrogenase 4 membrane component (E)  28.64 
 
 		 226 aa  89.7  4e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.244901  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0741  NAD-dependent dehydrogenase subunit  29.81 
 
 		 213 aa  88.6  7e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.918611  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2599  NAD-dependent dehydrogenase subunit  31.9 
 
 		 213 aa  88.2  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3215  hypothetical protein  34 
 
 		 193 aa  85.9  4e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0373612 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3432  NADH dehydrogenase (quinone)  34 
 
 		 193 aa  85.9  4e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.326498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0373  NAD-dependent dehydrogenase subunit  29.81 
 
 		 212 aa  85.1  9e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0256597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0890  hydrogenase 4 membrane component (E)-like protein  29.33 
 
 		 214 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.973916  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1071  NAD-dependent dehydrogenase subunit  30.62 
 
 		 213 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  9.47177e-35 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3190  NAD-dependent dehydrogenase subunit  30.62 
 
 		 213 aa  84  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.211977  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3715  NAD-dependent dehydrogenase subunit  31.22 
 
 		 215 aa  83.2  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0518094  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3798  NAD-dependent dehydrogenase subunit  31.22 
 
 		 215 aa  82.8  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.173142  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0730  hydrogenase subunit  31.7 
 
 		 224 aa  79.3  0.00000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0129986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3657  NAD-dependent dehydrogenase subunit  30.73 
 
 		 215 aa  79  0.00000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0452808  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2620  NAD-dependent dehydrogenase subunit  33.17 
 
 		 214 aa  78.6  0.00000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.195312  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1282  hydrogenase 4 membrane subunit  28.02 
 
 		 216 aa  77.8  0.0000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.077695  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2189  hydrogenase 4 membrane subunit  27.05 
 
 		 216 aa  78.2  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.523819 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2987  hypothetical protein  30.41 
 
 		 220 aa  77  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0295877  hitchhiker  0.00167925 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3783  NAD-dependent dehydrogenase subunit  28 
 
 		 215 aa  73.2  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0555648  normal  0.797729 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4705  hypothetical protein  30.35 
 
 		 218 aa  70.9  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2458  NAD-dependent dehydrogenase subunit  27.32 
 
 		 213 aa  69.3  0.00000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.124831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4467  putative hydrogenase HycP  35.17 
 
 		 220 aa  67.8  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4572  hydrogenase 4 membrane subunit  27.06 
 
 		 217 aa  67.4  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2711  hydrogenase 4 membrane subunit  25.24 
 
 		 216 aa  67.4  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00970  hydrogenase 4 membrane subunit  24.52 
 
 		 217 aa  64.7  0.000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0186  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  25.46 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0776  NAD-dependent dehydrogenase subunit  27 
 
 		 207 aa  60.5  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.448642  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2632  hydrogenase 4 membrane subunit  24.52 
 
 		 216 aa  59.3  0.00000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1573  hydrogenase subunit, putative  31.29 
 
 		 226 aa  59.3  0.00000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1451  hydrogenase subunit  30.72 
 
 		 226 aa  57.4  0.0000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1319  hydrogenase 4 membrane component (E)-like protein  25.62 
 
 		 226 aa  55.8  0.0000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1184  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  24.52 
 
 		 216 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02377  hydrogenase 4, membrane subunit  24.52 
 
 		 216 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02339  hypothetical protein  24.52 
 
 		 216 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3707  hydrogenase 4 membrane subunit  24.52 
 
 		 216 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2857  hydrogenase 4 membrane subunit  24.52 
 
 		 216 aa  54.7  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1191  hydrogenase 4 membrane subunit  24.52 
 
 		 216 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2767  hydrogenase 4 membrane subunit  24.52 
 
 		 216 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2619  hydrogenase 4 membrane subunit  24.52 
 
 		 216 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1039  hydrogenase 4 membrane subunit  22.82 
 
 		 220 aa  50.1  0.00003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000344071  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1125  hydrogenase-4 component E  25.33 
 
 		 230 aa  50.1  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.457842  normal  0.790146 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0941  hypothetical protein  21.03 
 
 		 210 aa  46.2  0.0004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.353676  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0319  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  22.37 
 
 		 221 aa  45.4  0.0007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.500767  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1912  hydrogenase 4 membrane subunit  22.9 
 
 		 214 aa  45.1  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.199181  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0129  hydrogenase 4 membrane subunit  23.38 
 
 		 211 aa  43.1  0.004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0545856  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>