53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0776 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_0776  NAD-dependent dehydrogenase subunit  100 
 
 		 207 aa  396  1e-109  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.448642  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2599  NAD-dependent dehydrogenase subunit  39.44 
 
 		 213 aa  132  5e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3190  NAD-dependent dehydrogenase subunit  38.5 
 
 		 213 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.211977  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1071  NAD-dependent dehydrogenase subunit  38.5 
 
 		 213 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  9.47177e-35 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0373  NAD-dependent dehydrogenase subunit  40.38 
 
 		 212 aa  123  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0256597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2556  NAD-dependent dehydrogenase subunit  37.26 
 
 		 213 aa  122  4e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0741  NAD-dependent dehydrogenase subunit  34.74 
 
 		 213 aa  121  6e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.918611  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0338  NAD-dependent dehydrogenase subunit  37.85 
 
 		 213 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0890  hydrogenase 4 membrane component (E)-like protein  33.8 
 
 		 214 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.973916  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3798  NAD-dependent dehydrogenase subunit  36.74 
 
 		 215 aa  109  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.173142  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2458  NAD-dependent dehydrogenase subunit  35.68 
 
 		 213 aa  108  4.0000000000000004e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.124831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3715  NAD-dependent dehydrogenase subunit  36.28 
 
 		 215 aa  108  6e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0518094  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3783  NAD-dependent dehydrogenase subunit  34.88 
 
 		 215 aa  106  3e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0555648  normal  0.797729 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3657  NAD-dependent dehydrogenase subunit  36.28 
 
 		 215 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0452808  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2620  NAD-dependent dehydrogenase subunit  36.92 
 
 		 214 aa  102  3e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.195312  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1305  hydrogenase 4 membrane component (E)  29.61 
 
 		 222 aa  87  2e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0701  hydrogenase 4 membrane component (E)  26.67 
 
 		 215 aa  77  0.0000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.202504  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1615  putative hydrogenase, membrane subunit  27.94 
 
 		 219 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1530  putative hydrogenase, membrane subunit  27.94 
 
 		 219 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1689  hydrogenase, membrane subunit 2-like protein  32.26 
 
 		 220 aa  76.3  0.0000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.674662  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1263  hypothetical protein  27.94 
 
 		 219 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.14188  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0177  hypothetical protein  25.98 
 
 		 219 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.25299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0109  hydrogenase 4 membrane component  27.45 
 
 		 219 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0327  hypothetical protein  27.45 
 
 		 219 aa  71.6  0.000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.704563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6067  hypothetical protein  26.47 
 
 		 219 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0736972  hitchhiker  0.000527865 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4286  hypothetical protein  30.7 
 
 		 218 aa  70.5  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00379585  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0918  hydrogenase 4 membrane component  26.73 
 
 		 219 aa  68.9  0.00000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.911214 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3215  hypothetical protein  33.54 
 
 		 193 aa  67  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0373612 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3432  NADH dehydrogenase (quinone)  33.54 
 
 		 193 aa  67  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.326498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4669  hydrogenase 4 subunit E  26.73 
 
 		 219 aa  66.6  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.253819  normal  0.171348 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3290  hydrogenase 4 membrane component  27.04 
 
 		 219 aa  66.6  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.540565  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1262  hypothetical protein  30.48 
 
 		 220 aa  65.9  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0296387 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1140  hydrogenase subunit  26.89 
 
 		 225 aa  65.5  0.0000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3853  hypothetical protein  30 
 
 		 220 aa  65.5  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.395736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1809  hydrogenase 4 membrane component  27.92 
 
 		 225 aa  65.1  0.0000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2151  hydrogenase-4, E subunit  27.92 
 
 		 225 aa  65.1  0.0000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0793  hypothetical protein  28.71 
 
 		 214 aa  63.2  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2476  hypothetical protein  28.1 
 
 		 220 aa  60.1  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.815072 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0168  putative hydrogenase-4 component E  28.75 
 
 		 226 aa  58.9  0.00000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.456786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2462  hydrogenase 4 membrane component (E)  30.65 
 
 		 222 aa  58.5  0.00000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.495145 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0941  hypothetical protein  24.87 
 
 		 210 aa  57.8  0.0000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.353676  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1398  hydrogenase 4 membrane component (E)-like protein  26.8 
 
 		 229 aa  54.7  0.0000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10086  hydrogenase hycP  32.86 
 
 		 220 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000000000096186  normal  0.18173 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0931  hypothetical protein  27.54 
 
 		 220 aa  52.4  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.229661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2189  hydrogenase 4 membrane subunit  23.7 
 
 		 216 aa  49.7  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.523819 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1792  hydrogenase 4 membrane component (E)  30.19 
 
 		 226 aa  46.2  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.244901  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1433  hydrogenase 4 membrane component (E)-like protein  25 
 
 		 209 aa  46.6  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.758709 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1995  conserved hypothetical protein  28.57 
 
 		 213 aa  45.8  0.0005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.829776  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1820  hypothetical protein  24.64 
 
 		 230 aa  45.1  0.0007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000203651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4705  hypothetical protein  28.43 
 
 		 218 aa  45.1  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00970  hydrogenase 4 membrane subunit  23.19 
 
 		 217 aa  43.1  0.003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2987  hypothetical protein  28.28 
 
 		 220 aa  42  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0295877  hitchhiker  0.00167925 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4572  hydrogenase 4 membrane subunit  25.12 
 
 		 217 aa  41.6  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>