47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1820 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_1820  hypothetical protein  100 
 
 		 230 aa  442  1e-123  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000203651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1125  hydrogenase-4 component E  49.07 
 
 		 230 aa  182  3e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.457842  normal  0.790146 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1319  hydrogenase 4 membrane component (E)-like protein  44.44 
 
 		 226 aa  141  8e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1573  hydrogenase subunit, putative  44.44 
 
 		 226 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1451  hydrogenase subunit  44.74 
 
 		 226 aa  137  1e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0177  hypothetical protein  29.35 
 
 		 219 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.25299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0701  hydrogenase 4 membrane component (E)  27.59 
 
 		 215 aa  59.7  0.00000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.202504  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4669  hydrogenase 4 subunit E  29.85 
 
 		 219 aa  59.3  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.253819  normal  0.171348 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2476  hypothetical protein  28.16 
 
 		 220 aa  58.5  0.00000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.815072 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3290  hydrogenase 4 membrane component  26.55 
 
 		 219 aa  57.8  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.540565  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1530  putative hydrogenase, membrane subunit  29.35 
 
 		 219 aa  57  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1615  putative hydrogenase, membrane subunit  29.35 
 
 		 219 aa  57  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0109  hydrogenase 4 membrane component  29.35 
 
 		 219 aa  57  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0327  hypothetical protein  29.7 
 
 		 219 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.704563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6067  hypothetical protein  28.86 
 
 		 219 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0736972  hitchhiker  0.000527865 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1263  hypothetical protein  29.35 
 
 		 219 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.14188  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1689  hydrogenase, membrane subunit 2-like protein  25.26 
 
 		 220 aa  54.7  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.674662  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0918  hydrogenase 4 membrane component  26.63 
 
 		 219 aa  52.8  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.911214 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2599  NAD-dependent dehydrogenase subunit  39.51 
 
 		 213 aa  52  0.000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0373  NAD-dependent dehydrogenase subunit  37.66 
 
 		 212 aa  51.6  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0256597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0941  hypothetical protein  26.9 
 
 		 210 aa  51.6  0.00001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.353676  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2556  NAD-dependent dehydrogenase subunit  27.1 
 
 		 213 aa  50.4  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2458  NAD-dependent dehydrogenase subunit  30.21 
 
 		 213 aa  49.7  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.124831  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3432  NADH dehydrogenase (quinone)  34.25 
 
 		 193 aa  49.3  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.326498  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3215  hypothetical protein  34.25 
 
 		 193 aa  49.3  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0373612 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0890  hydrogenase 4 membrane component (E)-like protein  26.67 
 
 		 214 aa  48.5  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.973916  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1792  hydrogenase 4 membrane component (E)  24.86 
 
 		 226 aa  47.8  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.244901  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0338  NAD-dependent dehydrogenase subunit  35.06 
 
 		 213 aa  47.8  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1305  hydrogenase 4 membrane component (E)  25 
 
 		 222 aa  48.1  0.0001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3783  NAD-dependent dehydrogenase subunit  37.18 
 
 		 215 aa  47  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0555648  normal  0.797729 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0741  NAD-dependent dehydrogenase subunit  33.33 
 
 		 213 aa  45.8  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.918611  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1262  hypothetical protein  27.53 
 
 		 220 aa  46.2  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0296387 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3853  hypothetical protein  27.53 
 
 		 220 aa  45.8  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.395736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3715  NAD-dependent dehydrogenase subunit  36.84 
 
 		 215 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0518094  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1140  hydrogenase subunit  22.12 
 
 		 225 aa  44.7  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1071  NAD-dependent dehydrogenase subunit  38.67 
 
 		 213 aa  44.7  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  9.47177e-35 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3798  NAD-dependent dehydrogenase subunit  36.84 
 
 		 215 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.173142  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3190  NAD-dependent dehydrogenase subunit  38.67 
 
 		 213 aa  44.7  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.211977  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2462  hydrogenase 4 membrane component (E)  27.5 
 
 		 222 aa  44.3  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.495145 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0168  putative hydrogenase-4 component E  26.62 
 
 		 226 aa  44.7  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.456786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1398  hydrogenase 4 membrane component (E)-like protein  24.82 
 
 		 229 aa  43.5  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1995  conserved hypothetical protein  32.05 
 
 		 213 aa  43.9  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.829776  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3657  NAD-dependent dehydrogenase subunit  35.53 
 
 		 215 aa  43.5  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0452808  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00970  hydrogenase 4 membrane subunit  22.22 
 
 		 217 aa  42.7  0.005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0793  hypothetical protein  27.45 
 
 		 214 aa  42.4  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2189  hydrogenase 4 membrane subunit  23.68 
 
 		 216 aa  42.4  0.007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.523819 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1433  hydrogenase 4 membrane component (E)-like protein  23.4 
 
 		 209 aa  42.4  0.007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.758709 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>