74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6067 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010625  Bphy_6067  hypothetical protein  100 
 
 
219 aa  430  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0736972  hitchhiker  0.000527865 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0177  hypothetical protein  90.41 
 
 
219 aa  395  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.25299  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1530  putative hydrogenase, membrane subunit  88.13 
 
 
219 aa  390  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1615  putative hydrogenase, membrane subunit  88.13 
 
 
219 aa  390  1e-108  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0327  hypothetical protein  88.58 
 
 
219 aa  393  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.704563  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0109  hydrogenase 4 membrane component  87.21 
 
 
219 aa  385  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1263  hypothetical protein  87.21 
 
 
219 aa  384  1e-106  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.14188  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0918  hydrogenase 4 membrane component  71.69 
 
 
219 aa  322  2e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.911214 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3290  hydrogenase 4 membrane component  70.32 
 
 
219 aa  315  3e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.540565  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4669  hydrogenase 4 subunit E  69.86 
 
 
219 aa  310  1e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.253819  normal  0.171348 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2151  hydrogenase-4, E subunit  57.73 
 
 
225 aa  209  2e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1809  hydrogenase 4 membrane component  57.73 
 
 
225 aa  209  2e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1140  hydrogenase subunit  42.86 
 
 
225 aa  176  2e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2476  hypothetical protein  42.01 
 
 
220 aa  166  2e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.815072 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3853  hypothetical protein  40.65 
 
 
220 aa  157  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.395736  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1262  hypothetical protein  41.12 
 
 
220 aa  157  1e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0296387 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2462  hydrogenase 4 membrane component (E)  41.12 
 
 
222 aa  152  2.9999999999999998e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.495145 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0168  putative hydrogenase-4 component E  38.6 
 
 
226 aa  149  5e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.456786  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0931  hypothetical protein  37.9 
 
 
220 aa  145  6e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.229661  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0701  hydrogenase 4 membrane component (E)  36.02 
 
 
215 aa  144  1e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.202504  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0793  hypothetical protein  40.38 
 
 
214 aa  135  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1398  hydrogenase 4 membrane component (E)-like protein  35.24 
 
 
229 aa  135  5e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1689  hydrogenase, membrane subunit 2-like protein  34.98 
 
 
220 aa  125  5e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.674662  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1305  hydrogenase 4 membrane component (E)  31.8 
 
 
222 aa  120  1.9999999999999998e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4286  hypothetical protein  34.62 
 
 
218 aa  102  4e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00379585  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0373  NAD-dependent dehydrogenase subunit  31.65 
 
 
212 aa  101  9e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0256597  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0741  NAD-dependent dehydrogenase subunit  30.8 
 
 
213 aa  99.8  3e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.918611  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10086  hydrogenase hycP  30.66 
 
 
220 aa  99.8  3e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000000000096186  normal  0.18173 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3715  NAD-dependent dehydrogenase subunit  28.04 
 
 
215 aa  98.2  8e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0518094  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3798  NAD-dependent dehydrogenase subunit  27.57 
 
 
215 aa  97.4  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.173142  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2556  NAD-dependent dehydrogenase subunit  29.91 
 
 
213 aa  97.1  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0890  hydrogenase 4 membrane component (E)-like protein  30.18 
 
 
214 aa  97.1  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.973916  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3657  NAD-dependent dehydrogenase subunit  27.57 
 
 
215 aa  95.5  5e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0452808  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0338  NAD-dependent dehydrogenase subunit  29.46 
 
 
213 aa  94.7  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3783  NAD-dependent dehydrogenase subunit  30 
 
 
215 aa  94.7  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0555648  normal  0.797729 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3190  NAD-dependent dehydrogenase subunit  29.02 
 
 
213 aa  94  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.211977  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1071  NAD-dependent dehydrogenase subunit  29.02 
 
 
213 aa  93.6  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  9.47177e-35 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3215  hypothetical protein  37.58 
 
 
193 aa  93.6  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0373612 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3432  NADH dehydrogenase (quinone)  37.58 
 
 
193 aa  93.6  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.326498  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2599  NAD-dependent dehydrogenase subunit  29.46 
 
 
213 aa  93.6  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2620  NAD-dependent dehydrogenase subunit  33.74 
 
 
214 aa  87  2e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.195312  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2458  NAD-dependent dehydrogenase subunit  31.46 
 
 
213 aa  86.7  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.124831  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2189  hydrogenase 4 membrane subunit  25 
 
 
216 aa  85.1  8e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.523819 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1792  hydrogenase 4 membrane component (E)  25.11 
 
 
226 aa  82.8  0.000000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.244901  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1282  hydrogenase 4 membrane subunit  26.67 
 
 
216 aa  81.3  0.00000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.077695  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2987  hypothetical protein  33.49 
 
 
220 aa  78.6  0.00000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0295877  hitchhiker  0.00167925 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4705  hypothetical protein  28.44 
 
 
218 aa  77.4  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1125  hydrogenase-4 component E  31.52 
 
 
230 aa  77.4  0.0000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.457842  normal  0.790146 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00970  hydrogenase 4 membrane subunit  23.58 
 
 
217 aa  70.9  0.00000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4572  hydrogenase 4 membrane subunit  26.39 
 
 
217 aa  70.1  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2711  hydrogenase 4 membrane subunit  24.29 
 
 
216 aa  70.5  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0730  hydrogenase subunit  25.71 
 
 
224 aa  68.6  0.00000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0129986  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1573  hydrogenase subunit, putative  37.24 
 
 
226 aa  65.9  0.0000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1451  hydrogenase subunit  33.54 
 
 
226 aa  64.3  0.000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1319  hydrogenase 4 membrane component (E)-like protein  35.15 
 
 
226 aa  62.8  0.000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0776  NAD-dependent dehydrogenase subunit  27.41 
 
 
207 aa  62.4  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.448642  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4467  putative hydrogenase HycP  35.17 
 
 
220 aa  61.2  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0186  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  25.59 
 
 
212 aa  60.5  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0941  hypothetical protein  24.06 
 
 
210 aa  57.4  0.0000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.353676  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1039  hydrogenase 4 membrane subunit  26.05 
 
 
220 aa  57  0.0000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000344071  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2632  hydrogenase 4 membrane subunit  24.07 
 
 
216 aa  55.1  0.0000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1912  hydrogenase 4 membrane subunit  25.58 
 
 
214 aa  53.9  0.000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.199181  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0129  hydrogenase 4 membrane subunit  27.44 
 
 
211 aa  53.1  0.000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0545856  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1184  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  22.62 
 
 
216 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2767  hydrogenase 4 membrane subunit  22.62 
 
 
216 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02377  hydrogenase 4, membrane subunit  22.62 
 
 
216 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02339  hypothetical protein  22.62 
 
 
216 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2857  hydrogenase 4 membrane subunit  22.52 
 
 
216 aa  51.2  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2619  hydrogenase 4 membrane subunit  22.62 
 
 
216 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1191  hydrogenase 4 membrane subunit  22.62 
 
 
216 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3707  hydrogenase 4 membrane subunit  22.62 
 
 
216 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0319  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  24.44 
 
 
221 aa  49.3  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.500767  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1820  hypothetical protein  28.86 
 
 
230 aa  47.4  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000203651  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1864  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  28.31 
 
 
215 aa  44.7  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.31142  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>