25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1995 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1995  conserved hypothetical protein  100 
 
 		 213 aa  403  1e-111  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.829776  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1433  hydrogenase 4 membrane component (E)-like protein  44.29 
 
 		 209 aa  143  2e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.758709 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0777  Hydrogenase 4 membrane component (E)-like protein  30.7 
 
 		 208 aa  62.8  0.000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.38496  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2556  NAD-dependent dehydrogenase subunit  27.1 
 
 		 213 aa  53.5  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0186  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  25.93 
 
 		 212 aa  53.1  0.000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0741  NAD-dependent dehydrogenase subunit  26.96 
 
 		 213 aa  50.1  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.918611  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0373  NAD-dependent dehydrogenase subunit  24.17 
 
 		 212 aa  50.1  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0256597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3190  NAD-dependent dehydrogenase subunit  24.63 
 
 		 213 aa  48.9  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.211977  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1071  NAD-dependent dehydrogenase subunit  24.14 
 
 		 213 aa  48.9  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  9.47177e-35 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0890  hydrogenase 4 membrane component (E)-like protein  27.15 
 
 		 214 aa  48.9  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.973916  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0338  NAD-dependent dehydrogenase subunit  26.04 
 
 		 213 aa  48.5  0.00008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0701  hydrogenase 4 membrane component (E)  31.21 
 
 		 215 aa  48.5  0.00008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.202504  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2599  NAD-dependent dehydrogenase subunit  27.08 
 
 		 213 aa  48.1  0.00009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1305  hydrogenase 4 membrane component (E)  25.34 
 
 		 222 aa  48.1  0.00009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2458  NAD-dependent dehydrogenase subunit  31.96 
 
 		 213 aa  48.1  0.00009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.124831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3783  NAD-dependent dehydrogenase subunit  28.87 
 
 		 215 aa  48.1  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0555648  normal  0.797729 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3715  NAD-dependent dehydrogenase subunit  23.26 
 
 		 215 aa  47  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0518094  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2462  hydrogenase 4 membrane component (E)  27.48 
 
 		 222 aa  46.6  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.495145 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4286  hypothetical protein  38.37 
 
 		 218 aa  46.6  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00379585  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3657  NAD-dependent dehydrogenase subunit  28.87 
 
 		 215 aa  46.6  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0452808  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3798  NAD-dependent dehydrogenase subunit  23.75 
 
 		 215 aa  46.2  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.173142  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1820  hypothetical protein  32.05 
 
 		 230 aa  43.9  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000203651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2476  hypothetical protein  23.66 
 
 		 220 aa  42.7  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.815072 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0793  hypothetical protein  27.23 
 
 		 214 aa  42.7  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2620  NAD-dependent dehydrogenase subunit  30.2 
 
 		 214 aa  42.4  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.195312  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>