27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1433 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_1433  hydrogenase 4 membrane component (E)-like protein  100 
 
 		 209 aa  408  1e-113  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.758709 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1995  conserved hypothetical protein  44.29 
 
 		 213 aa  143  2e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.829776  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1071  NAD-dependent dehydrogenase subunit  23.63 
 
 		 213 aa  63.5  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  9.47177e-35 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3190  NAD-dependent dehydrogenase subunit  23.63 
 
 		 213 aa  63.2  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.211977  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2458  NAD-dependent dehydrogenase subunit  25.56 
 
 		 213 aa  58.2  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.124831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0777  Hydrogenase 4 membrane component (E)-like protein  28.36 
 
 		 208 aa  57.4  0.0000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.38496  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0373  NAD-dependent dehydrogenase subunit  21.84 
 
 		 212 aa  53.1  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0256597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1319  hydrogenase 4 membrane component (E)-like protein  25.16 
 
 		 226 aa  50.4  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0338  NAD-dependent dehydrogenase subunit  26.63 
 
 		 213 aa  50.1  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3783  NAD-dependent dehydrogenase subunit  28.17 
 
 		 215 aa  48.5  0.00008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0555648  normal  0.797729 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3657  NAD-dependent dehydrogenase subunit  27.82 
 
 		 215 aa  48.1  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0452808  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0741  NAD-dependent dehydrogenase subunit  20.88 
 
 		 213 aa  48.5  0.00008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.918611  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1573  hydrogenase subunit, putative  23.9 
 
 		 226 aa  47.8  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2556  NAD-dependent dehydrogenase subunit  22.53 
 
 		 213 aa  47.8  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0890  hydrogenase 4 membrane component (E)-like protein  22.4 
 
 		 214 aa  47.4  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.973916  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1689  hydrogenase, membrane subunit 2-like protein  27.17 
 
 		 220 aa  46.6  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.674662  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3715  NAD-dependent dehydrogenase subunit  27.07 
 
 		 215 aa  47.4  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0518094  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3798  NAD-dependent dehydrogenase subunit  27.07 
 
 		 215 aa  47.4  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.173142  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0186  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  26.42 
 
 		 212 aa  46.2  0.0003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2599  NAD-dependent dehydrogenase subunit  22.29 
 
 		 213 aa  45.8  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1451  hydrogenase subunit  22.58 
 
 		 226 aa  45.8  0.0005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0701  hydrogenase 4 membrane component (E)  23.53 
 
 		 215 aa  45.1  0.0008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.202504  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2189  hydrogenase 4 membrane subunit  26.18 
 
 		 216 aa  44.3  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.523819 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0793  hypothetical protein  21.08 
 
 		 214 aa  44.3  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00970  hydrogenase 4 membrane subunit  26.98 
 
 		 217 aa  42.7  0.004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2620  NAD-dependent dehydrogenase subunit  26.36 
 
 		 214 aa  42.7  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.195312  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1820  hypothetical protein  26.47 
 
 		 230 aa  42.4  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000203651  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>