44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0777 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013926  Aboo_0777  Hydrogenase 4 membrane component (E)-like protein  100 
 
 		 208 aa  396  1e-109  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.38496  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1995  conserved hypothetical protein  30.7 
 
 		 213 aa  76.6  0.0000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.829776  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1433  hydrogenase 4 membrane component (E)-like protein  28.36 
 
 		 209 aa  66.2  0.0000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.758709 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0338  NAD-dependent dehydrogenase subunit  25.58 
 
 		 213 aa  57.8  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2189  hydrogenase 4 membrane subunit  28.7 
 
 		 216 aa  57.4  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.523819 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2462  hydrogenase 4 membrane component (E)  24.15 
 
 		 222 aa  56.6  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.495145 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4669  hydrogenase 4 subunit E  26.09 
 
 		 219 aa  55.8  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.253819  normal  0.171348 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0918  hydrogenase 4 membrane component  27.05 
 
 		 219 aa  55.1  0.0000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.911214 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2556  NAD-dependent dehydrogenase subunit  24.02 
 
 		 213 aa  53.5  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0741  NAD-dependent dehydrogenase subunit  23.83 
 
 		 213 aa  53.5  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.918611  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1792  hydrogenase 4 membrane component (E)  26.06 
 
 		 226 aa  51.2  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.244901  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3190  NAD-dependent dehydrogenase subunit  22.55 
 
 		 213 aa  48.9  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.211977  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2458  NAD-dependent dehydrogenase subunit  25.12 
 
 		 213 aa  48.9  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.124831  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1071  NAD-dependent dehydrogenase subunit  22.55 
 
 		 213 aa  48.9  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  9.47177e-35 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1615  putative hydrogenase, membrane subunit  26.57 
 
 		 219 aa  47.8  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1530  putative hydrogenase, membrane subunit  26.57 
 
 		 219 aa  47.8  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1263  hypothetical protein  26.57 
 
 		 219 aa  47.4  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.14188  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1305  hydrogenase 4 membrane component (E)  26.26 
 
 		 222 aa  47  0.0002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0327  hypothetical protein  25.6 
 
 		 219 aa  46.2  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.704563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0373  NAD-dependent dehydrogenase subunit  23.67 
 
 		 212 aa  46.6  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0256597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6067  hypothetical protein  25.6 
 
 		 219 aa  45.8  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0736972  hitchhiker  0.000527865 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0109  hydrogenase 4 membrane component  26.09 
 
 		 219 aa  45.8  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0941  hypothetical protein  25.99 
 
 		 210 aa  45.4  0.0006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.353676  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0890  hydrogenase 4 membrane component (E)-like protein  22.97 
 
 		 214 aa  45.4  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.973916  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0177  hypothetical protein  26.09 
 
 		 219 aa  45.4  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.25299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0186  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  25.4 
 
 		 212 aa  45.1  0.0008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1282  hydrogenase 4 membrane subunit  25.56 
 
 		 216 aa  44.7  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.077695  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3290  hydrogenase 4 membrane component  23.9 
 
 		 219 aa  44.3  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.540565  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2599  NAD-dependent dehydrogenase subunit  23.04 
 
 		 213 aa  44.3  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02339  hypothetical protein  37.18 
 
 		 216 aa  43.5  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3707  hydrogenase 4 membrane subunit  37.18 
 
 		 216 aa  43.5  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2619  hydrogenase 4 membrane subunit  37.18 
 
 		 216 aa  43.5  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2857  hydrogenase 4 membrane subunit  37.18 
 
 		 216 aa  43.5  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1191  hydrogenase 4 membrane subunit  37.18 
 
 		 216 aa  43.5  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2767  hydrogenase 4 membrane subunit  37.18 
 
 		 216 aa  43.5  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02377  hydrogenase 4, membrane subunit  37.18 
 
 		 216 aa  43.5  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1184  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  37.18 
 
 		 216 aa  43.5  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0701  hydrogenase 4 membrane component (E)  25.39 
 
 		 215 aa  42.7  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.202504  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2476  hypothetical protein  24.59 
 
 		 220 aa  42.7  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.815072 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2632  hydrogenase 4 membrane subunit  26.19 
 
 		 216 aa  43.1  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3783  NAD-dependent dehydrogenase subunit  30.26 
 
 		 215 aa  43.5  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0555648  normal  0.797729 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4286  hypothetical protein  28.09 
 
 		 218 aa  42.4  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00379585  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3798  NAD-dependent dehydrogenase subunit  23.04 
 
 		 215 aa  42.4  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.173142  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3715  NAD-dependent dehydrogenase subunit  23.04 
 
 		 215 aa  42  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0518094  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>