56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_1319 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_1319  hydrogenase 4 membrane component (E)-like protein  100 
 
 		 226 aa  436  1e-121  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1451  hydrogenase subunit  94.69 
 
 		 226 aa  362  2e-99  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1573  hydrogenase subunit, putative  94.69 
 
 		 226 aa  359  2e-98  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1125  hydrogenase-4 component E  49.78 
 
 		 230 aa  173  1.9999999999999998e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.457842  normal  0.790146 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1820  hypothetical protein  44.17 
 
 		 230 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000203651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2462  hydrogenase 4 membrane component (E)  30.05 
 
 		 222 aa  77.8  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.495145 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0941  hypothetical protein  29.67 
 
 		 210 aa  75.9  0.0000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.353676  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6067  hypothetical protein  32.41 
 
 		 219 aa  71.6  0.000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0736972  hitchhiker  0.000527865 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0701  hydrogenase 4 membrane component (E)  33.33 
 
 		 215 aa  69.3  0.00000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.202504  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0177  hypothetical protein  31.31 
 
 		 219 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.25299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0327  hypothetical protein  31.63 
 
 		 219 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.704563  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1140  hydrogenase subunit  28 
 
 		 225 aa  67.8  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2556  NAD-dependent dehydrogenase subunit  29.03 
 
 		 213 aa  67.4  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1689  hydrogenase, membrane subunit 2-like protein  28.57 
 
 		 220 aa  66.6  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.674662  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4669  hydrogenase 4 subunit E  30.41 
 
 		 219 aa  66.6  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.253819  normal  0.171348 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1263  hypothetical protein  30.19 
 
 		 219 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.14188  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0109  hydrogenase 4 membrane component  30.37 
 
 		 219 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1305  hydrogenase 4 membrane component (E)  30.7 
 
 		 222 aa  65.9  0.0000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1615  putative hydrogenase, membrane subunit  30.37 
 
 		 219 aa  65.1  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1530  putative hydrogenase, membrane subunit  30.37 
 
 		 219 aa  65.1  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2458  NAD-dependent dehydrogenase subunit  26.94 
 
 		 213 aa  64.3  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.124831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3290  hydrogenase 4 membrane component  28.24 
 
 		 219 aa  61.2  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.540565  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3853  hypothetical protein  30.05 
 
 		 220 aa  59.7  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.395736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1262  hypothetical protein  30.05 
 
 		 220 aa  60.1  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0296387 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1433  hydrogenase 4 membrane component (E)-like protein  24.39 
 
 		 209 aa  60.1  0.00000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.758709 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2476  hypothetical protein  25.59 
 
 		 220 aa  59.3  0.00000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.815072 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0338  NAD-dependent dehydrogenase subunit  27.17 
 
 		 213 aa  58.9  0.00000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2151  hydrogenase-4, E subunit  27.96 
 
 		 225 aa  58.5  0.00000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1809  hydrogenase 4 membrane component  27.96 
 
 		 225 aa  58.5  0.00000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2599  NAD-dependent dehydrogenase subunit  27.42 
 
 		 213 aa  58.2  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0373  NAD-dependent dehydrogenase subunit  26.06 
 
 		 212 aa  57  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0256597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0918  hydrogenase 4 membrane component  27.37 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.911214 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1071  NAD-dependent dehydrogenase subunit  26.06 
 
 		 213 aa  55.5  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  9.47177e-35 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3190  NAD-dependent dehydrogenase subunit  26.06 
 
 		 213 aa  55.5  0.0000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.211977  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2620  NAD-dependent dehydrogenase subunit  26.19 
 
 		 214 aa  54.7  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.195312  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2189  hydrogenase 4 membrane subunit  28.08 
 
 		 216 aa  53.5  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.523819 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3715  NAD-dependent dehydrogenase subunit  27.96 
 
 		 215 aa  53.5  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0518094  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0890  hydrogenase 4 membrane component (E)-like protein  24.42 
 
 		 214 aa  52.8  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.973916  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3798  NAD-dependent dehydrogenase subunit  31.01 
 
 		 215 aa  53.1  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.173142  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0931  hypothetical protein  28.42 
 
 		 220 aa  49.7  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.229661  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0741  NAD-dependent dehydrogenase subunit  27.96 
 
 		 213 aa  49.7  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.918611  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3432  NADH dehydrogenase (quinone)  32.14 
 
 		 193 aa  49.3  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.326498  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3215  hypothetical protein  32.14 
 
 		 193 aa  49.3  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0373612 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3657  NAD-dependent dehydrogenase subunit  31.47 
 
 		 215 aa  49.3  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0452808  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00970  hydrogenase 4 membrane subunit  24.88 
 
 		 217 aa  48.5  0.00009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1282  hydrogenase 4 membrane subunit  26.37 
 
 		 216 aa  47  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.077695  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2711  hydrogenase 4 membrane subunit  27.86 
 
 		 216 aa  47  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3783  NAD-dependent dehydrogenase subunit  27.66 
 
 		 215 aa  46.6  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0555648  normal  0.797729 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4572  hydrogenase 4 membrane subunit  26.09 
 
 		 217 aa  46.2  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1792  hydrogenase 4 membrane component (E)  29.44 
 
 		 226 aa  45.8  0.0006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.244901  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1995  conserved hypothetical protein  33.9 
 
 		 213 aa  44.7  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.829776  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0168  putative hydrogenase-4 component E  26.45 
 
 		 226 aa  44.3  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.456786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1398  hydrogenase 4 membrane component (E)-like protein  25.73 
 
 		 229 aa  43.9  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0730  hydrogenase subunit  26.77 
 
 		 224 aa  43.5  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0129986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0793  hypothetical protein  25.47 
 
 		 214 aa  44.3  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4467  putative hydrogenase HycP  27.67 
 
 		 220 aa  42  0.008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>