58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0129 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0129  hydrogenase 4 membrane subunit  100 
 
 		 211 aa  405  1.0000000000000001e-112  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0545856  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1912  hydrogenase 4 membrane subunit  62.56 
 
 		 214 aa  263  2e-69  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.199181  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1039  hydrogenase 4 membrane subunit  60.66 
 
 		 220 aa  253  2.0000000000000002e-66  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000344071  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1864  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  59.13 
 
 		 215 aa  223  2e-57  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.31142  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2189  hydrogenase 4 membrane subunit  36.15 
 
 		 216 aa  125  4.0000000000000003e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.523819 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1282  hydrogenase 4 membrane subunit  34.45 
 
 		 216 aa  114  7.999999999999999e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.077695  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2632  hydrogenase 4 membrane subunit  33.17 
 
 		 216 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2711  hydrogenase 4 membrane subunit  32.54 
 
 		 216 aa  108  7.000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1184  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  33.66 
 
 		 216 aa  107  9.000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02339  hypothetical protein  33.66 
 
 		 216 aa  107  9.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3707  hydrogenase 4 membrane subunit  33.66 
 
 		 216 aa  107  9.000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2857  hydrogenase 4 membrane subunit  33.66 
 
 		 216 aa  108  9.000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1191  hydrogenase 4 membrane subunit  33.66 
 
 		 216 aa  107  9.000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2767  hydrogenase 4 membrane subunit  33.66 
 
 		 216 aa  107  9.000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2619  hydrogenase 4 membrane subunit  33.66 
 
 		 216 aa  107  9.000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02377  hydrogenase 4, membrane subunit  33.66 
 
 		 216 aa  107  9.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4572  hydrogenase 4 membrane subunit  34.13 
 
 		 217 aa  99.8  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00970  hydrogenase 4 membrane subunit  31.63 
 
 		 217 aa  99  5e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0186  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  29.84 
 
 		 212 aa  79  0.00000000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2462  hydrogenase 4 membrane component (E)  26.96 
 
 		 222 aa  67.4  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.495145 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0319  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  23.72 
 
 		 221 aa  64.3  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.500767  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0327  hypothetical protein  27.44 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.704563  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3432  NADH dehydrogenase (quinone)  30.19 
 
 		 193 aa  56.2  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.326498  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3215  hypothetical protein  30.19 
 
 		 193 aa  56.2  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0373612 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0890  hydrogenase 4 membrane component (E)-like protein  25.81 
 
 		 214 aa  55.5  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.973916  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1615  putative hydrogenase, membrane subunit  28.37 
 
 		 219 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1530  putative hydrogenase, membrane subunit  28.37 
 
 		 219 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1398  hydrogenase 4 membrane component (E)-like protein  24.55 
 
 		 229 aa  55.1  0.0000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0177  hypothetical protein  28.37 
 
 		 219 aa  53.9  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.25299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2620  NAD-dependent dehydrogenase subunit  25.7 
 
 		 214 aa  53.5  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.195312  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0338  NAD-dependent dehydrogenase subunit  26.63 
 
 		 213 aa  53.9  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6067  hypothetical protein  27.44 
 
 		 219 aa  53.1  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0736972  hitchhiker  0.000527865 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2476  hypothetical protein  27.49 
 
 		 220 aa  52.4  0.000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.815072 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0741  NAD-dependent dehydrogenase subunit  27.33 
 
 		 213 aa  52.4  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.918611  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0109  hydrogenase 4 membrane component  27.88 
 
 		 219 aa  52  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1689  hydrogenase, membrane subunit 2-like protein  26.6 
 
 		 220 aa  52  0.000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.674662  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1263  hypothetical protein  27.88 
 
 		 219 aa  50.8  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.14188  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3715  NAD-dependent dehydrogenase subunit  25.93 
 
 		 215 aa  50.1  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0518094  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3783  NAD-dependent dehydrogenase subunit  24 
 
 		 215 aa  50.1  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0555648  normal  0.797729 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3798  NAD-dependent dehydrogenase subunit  25.93 
 
 		 215 aa  49.7  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.173142  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2458  NAD-dependent dehydrogenase subunit  27.01 
 
 		 213 aa  50.1  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.124831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1305  hydrogenase 4 membrane component (E)  28.57 
 
 		 222 aa  48.9  0.00005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3657  NAD-dependent dehydrogenase subunit  25.64 
 
 		 215 aa  48.1  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0452808  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0793  hypothetical protein  24.06 
 
 		 214 aa  47.8  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0941  hypothetical protein  27.01 
 
 		 210 aa  47.8  0.0001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.353676  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2556  NAD-dependent dehydrogenase subunit  23.85 
 
 		 213 aa  47.8  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1809  hydrogenase 4 membrane component  26.99 
 
 		 225 aa  48.1  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2151  hydrogenase-4, E subunit  26.99 
 
 		 225 aa  48.1  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3290  hydrogenase 4 membrane component  21.81 
 
 		 219 aa  47  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.540565  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1071  NAD-dependent dehydrogenase subunit  23.61 
 
 		 213 aa  46.6  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  9.47177e-35 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0373  NAD-dependent dehydrogenase subunit  24.55 
 
 		 212 aa  46.6  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0256597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3190  NAD-dependent dehydrogenase subunit  23.15 
 
 		 213 aa  45.8  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.211977  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2599  NAD-dependent dehydrogenase subunit  22.9 
 
 		 213 aa  45.4  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0918  hydrogenase 4 membrane component  25.15 
 
 		 219 aa  45.1  0.0008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.911214 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0701  hydrogenase 4 membrane component (E)  25 
 
 		 215 aa  44.3  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.202504  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3853  hypothetical protein  25 
 
 		 220 aa  44.3  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.395736  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1140  hydrogenase subunit  23.87 
 
 		 225 aa  43.1  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1262  hypothetical protein  24.29 
 
 		 220 aa  42.4  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0296387 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>