More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02574 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_02574  glutamyl-tRNA reductase  100 
 
 		 275 aa  563  1e-160  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000230878  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2564  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  65.61 
 
 		 423 aa  345  3e-94  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.508916  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004204  glutamyl-tRNA reductase  54.28 
 
 		 418 aa  290  2e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000179715  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3554  glutamyl-tRNA reductase  57.03 
 
 		 422 aa  287  1e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0359238  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01249  glutamyl-tRNA reductase  53.53 
 
 		 418 aa  285  5e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1606  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  55.82 
 
 		 419 aa  284  1.0000000000000001e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.495518  normal  0.645678 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0789  glutamyl-tRNA reductase  53.94 
 
 		 418 aa  283  2.0000000000000002e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.143605  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3127  glutamyl-tRNA reductase  58.1 
 
 		 416 aa  281  6.000000000000001e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000225636  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2567  glutamyl-tRNA reductase  57.71 
 
 		 416 aa  280  3e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00000152956  normal  0.211294 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2913  glutamyl-tRNA reductase  56.13 
 
 		 416 aa  276  3e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000048664  normal  0.480262 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3460  glutamyl-tRNA reductase  56.92 
 
 		 426 aa  275  8e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000782916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0722  glutamyl-tRNA reductase  54.55 
 
 		 416 aa  270  1e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.131936  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0800  glutamyl-tRNA reductase  55.34 
 
 		 416 aa  269  2.9999999999999997e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000139394  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3686  glutamyl-tRNA reductase  54.94 
 
 		 416 aa  268  5e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0012522  normal  0.509552 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3738  glutamyl-tRNA reductase  54.55 
 
 		 416 aa  268  8e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000445074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3547  glutamyl-tRNA reductase  54.55 
 
 		 416 aa  268  8e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000884413  decreased coverage  0.0000146435 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0695  glutamyl-tRNA reductase  54.55 
 
 		 416 aa  268  8e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000150429  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3834  glutamyl-tRNA reductase  55.34 
 
 		 416 aa  268  8.999999999999999e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3615  glutamyl-tRNA reductase  54.55 
 
 		 416 aa  268  8.999999999999999e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000229913  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1757  glutamyl-tRNA reductase  51.11 
 
 		 419 aa  267  1e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000105006  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3170  glutamyl-tRNA reductase  55.34 
 
 		 416 aa  267  1e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000428438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0796  glutamyl-tRNA reductase  55.34 
 
 		 416 aa  267  1e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000467609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0768  glutamyl-tRNA reductase  55.34 
 
 		 416 aa  267  1e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000952775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0919  glutamyl-tRNA reductase  54.55 
 
 		 416 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000505435  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1528  glutamyl-tRNA reductase  53.73 
 
 		 424 aa  266  4e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2338  glutamyl-tRNA reductase  52.96 
 
 		 434 aa  258  6e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0732  glutamyl-tRNA reductase  53.85 
 
 		 425 aa  258  8e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0760  glutamyl-tRNA reductase  53.85 
 
 		 425 aa  258  8e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0583229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0773  glutamyl-tRNA reductase  53.44 
 
 		 425 aa  257  1e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4457  glutamyl-tRNA reductase  53.04 
 
 		 425 aa  256  3e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5315  glutamyl-tRNA reductase  52.63 
 
 		 422 aa  256  4e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1914  glutamyl-tRNA reductase  52.96 
 
 		 418 aa  254  8e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000422832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1972  glutamyl-tRNA reductase  52.96 
 
 		 418 aa  254  8e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000439602  normal  0.904808 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1908  glutamyl-tRNA reductase  52.96 
 
 		 418 aa  254  8e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00010664  normal  0.872325 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1362  glutamyl-tRNA reductase  52.96 
 
 		 418 aa  254  8e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000971063  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61710  glutamyl-tRNA reductase  51.82 
 
 		 422 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0624585  normal  0.0109768 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0279  glutamyl-tRNA reductase  47.04 
 
 		 446 aa  253  2.0000000000000002e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1546  glutamyl-tRNA reductase  52.57 
 
 		 418 aa  253  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0564626  normal  0.139086 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3252  glutamyl-tRNA reductase  52.21 
 
 		 425 aa  253  3e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000725008  normal  0.10707 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01185  glutamyl-tRNA reductase  52.17 
 
 		 418 aa  252  5.000000000000001e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.112965  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2416  glutamyl-tRNA reductase  52.17 
 
 		 418 aa  252  5.000000000000001e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000119078  hitchhiker  0.0000345051 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1315  glutamyl-tRNA reductase  52.17 
 
 		 418 aa  252  5.000000000000001e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  2.01079e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01195  hypothetical protein  52.17 
 
 		 418 aa  252  5.000000000000001e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0924296  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1358  glutamyl-tRNA reductase  52.17 
 
 		 418 aa  251  6e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000645666  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1374  glutamyl-tRNA reductase  52.17 
 
 		 418 aa  251  6e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000000847987  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2437  glutamyl-tRNA reductase  52.17 
 
 		 418 aa  251  1e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000304893  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1932  glutamyl-tRNA reductase  52.17 
 
 		 418 aa  250  1e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000431786  normal  0.0964629 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1691  glutamyl-tRNA reductase  52.17 
 
 		 418 aa  251  1e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000277643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2361  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  50 
 
 		 429 aa  249  3e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1043  glutamyl-tRNA reductase  49.41 
 
 		 421 aa  248  8e-65  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1059  glutamyl-tRNA reductase  50.2 
 
 		 426 aa  246  2e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1108  glutamyl-tRNA reductase  51.82 
 
 		 425 aa  246  3e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0948  glutamyl-tRNA reductase  51.82 
 
 		 425 aa  246  3e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1989  glutamyl-tRNA reductase  52.57 
 
 		 420 aa  246  3e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00499789  decreased coverage  0.00167683 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4749  glutamyl-tRNA reductase  51.82 
 
 		 428 aa  246  4e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.168503  normal  0.0710553 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3600  glutamyl-tRNA reductase  50.41 
 
 		 422 aa  244  8e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.779704 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0118  glutamyl-tRNA reductase  49.21 
 
 		 413 aa  244  8e-64  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000526977  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2065  glutamyl-tRNA reductase  49.21 
 
 		 431 aa  244  9e-64  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0513326  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0993  glutamyl-tRNA reductase  45.85 
 
 		 449 aa  243  1.9999999999999999e-63  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2461  glutamyl-tRNA reductase  51.78 
 
 		 420 aa  240  2e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000933086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0510  glutamyl-tRNA reductase  47.86 
 
 		 420 aa  240  2e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2067  glutamyl-tRNA reductase  51.78 
 
 		 420 aa  240  2e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  3.85694e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2115  glutamyl-tRNA reductase  50.59 
 
 		 418 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.435842  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0341  glutamyl-tRNA reductase  48.05 
 
 		 432 aa  238  5e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2071  glutamyl-tRNA reductase  49.8 
 
 		 418 aa  238  8e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0132375  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2408  glutamyl-tRNA reductase  50.2 
 
 		 418 aa  238  1e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41480  glutamyl-tRNA reductase  48.58 
 
 		 408 aa  235  5.0000000000000005e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.340284  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1052  glutamyl-tRNA reductase  44.84 
 
 		 420 aa  233  3e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.103209  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2180  glutamyl-tRNA reductase  51.38 
 
 		 438 aa  232  5e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00403267  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0810  glutamyl-tRNA reductase  46.4 
 
 		 459 aa  231  1e-59  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2642  glutamyl-tRNA reductase  44.98 
 
 		 420 aa  227  2e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04547  glutamyl-tRNA reductase  48.02 
 
 		 432 aa  227  2e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2473  glutamyl-tRNA reductase  46.43 
 
 		 414 aa  226  3e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0523  Glutamyl-tRNA reductase  48.59 
 
 		 439 aa  225  5.0000000000000005e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0390  glutamyl-tRNA reductase  41.43 
 
 		 434 aa  223  2e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0690188  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2122  glutamyl-tRNA reductase  46.3 
 
 		 432 aa  224  2e-57  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0115057  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3689  glutamyl-tRNA reductase  45.97 
 
 		 416 aa  223  3e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0722  glutamyl-tRNA reductase  50.19 
 
 		 427 aa  223  3e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.419682 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1855  glutamyl-tRNA reductase  49.01 
 
 		 418 aa  222  6e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.163682  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0776  glutamyl-tRNA reductase  47.7 
 
 		 429 aa  221  9.999999999999999e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.163428 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2492  glutamyl-tRNA reductase  40.6 
 
 		 416 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.59007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2211  glutamyl-tRNA reductase  45.53 
 
 		 432 aa  219  3e-56  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.271306  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1423  glutamyl-tRNA reductase  44.76 
 
 		 418 aa  219  3e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.40052  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2256  glutamyl-tRNA reductase  43.43 
 
 		 424 aa  218  7.999999999999999e-56  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2887  glutamyl-tRNA reductase  45.71 
 
 		 432 aa  218  1e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.171093 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2720  glutamyl-tRNA reductase  43.68 
 
 		 429 aa  216  2e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0505  glutamyl-tRNA reductase  42.34 
 
 		 432 aa  216  4e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.413574  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3600  glutamyl-tRNA reductase  42.34 
 
 		 432 aa  216  4e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3613  glutamyl-tRNA reductase  42.34 
 
 		 434 aa  216  4e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.268717  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0971  glutamyl-tRNA reductase  42.34 
 
 		 434 aa  216  4e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0563906  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1942  glutamyl-tRNA reductase  42.34 
 
 		 434 aa  216  4e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0675  glutamyl-tRNA reductase  42.34 
 
 		 434 aa  216  4e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2283  glutamyl-tRNA reductase  43.03 
 
 		 424 aa  215  5e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3589  glutamyl-tRNA reductase  42.34 
 
 		 434 aa  215  5e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.472177  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1553  glutamyl-tRNA reductase  46.4 
 
 		 429 aa  215  5.9999999999999996e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00506204 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2929  glutamyl-tRNA reductase  42.34 
 
 		 432 aa  215  7e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2593  glutamyl-tRNA reductase  45.31 
 
 		 432 aa  215  7e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3521  glutamyl-tRNA reductase  44.58 
 
 		 428 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.216045  normal  0.218753 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0437  glutamyl-tRNA reductase  44.58 
 
 		 428 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.760471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0852  glutamyl-tRNA reductase  44.66 
 
 		 436 aa  213  1.9999999999999998e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>