More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00439 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_00439  phosphoglyceromutase  100 
 
 		 248 aa  510  1e-144  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.418989  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1403  phosphoglycerate mutase 1 family  64.52 
 
 		 248 aa  346  2e-94  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1258  phosphoglyceromutase  68.29 
 
 		 250 aa  338  5.9999999999999996e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.202337  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2861  phosphoglyceromutase  67.89 
 
 		 250 aa  336  1.9999999999999998e-91  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.187742  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1407  phosphoglyceromutase  67.89 
 
 		 250 aa  336  1.9999999999999998e-91  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2948  phosphoglyceromutase  67.89 
 
 		 250 aa  336  1.9999999999999998e-91  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0922  phosphoglyceromutase  66.67 
 
 		 250 aa  335  2.9999999999999997e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.169898 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3076  phosphoglyceromutase  67.89 
 
 		 250 aa  335  2.9999999999999997e-91  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0836  phosphoglyceromutase  66.67 
 
 		 250 aa  335  2.9999999999999997e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00708  phosphoglyceromutase  65.85 
 
 		 250 aa  335  5e-91  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0244194  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2887  phosphoglycerate mutase 1 family  65.85 
 
 		 250 aa  335  5e-91  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.715971  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0857  phosphoglyceromutase  65.85 
 
 		 250 aa  335  5e-91  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0211138  normal  0.774364 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00697  hypothetical protein  65.85 
 
 		 250 aa  335  5e-91  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0324346  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0778  phosphoglyceromutase  65.85 
 
 		 250 aa  335  5e-91  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.170676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0809  phosphoglyceromutase  65.85 
 
 		 250 aa  335  5e-91  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.794598  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0676  phosphoglyceromutase  65.85 
 
 		 250 aa  335  5e-91  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.281134  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0867  phosphoglyceromutase  66.26 
 
 		 250 aa  335  5e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.192858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2907  phosphoglyceromutase  65.85 
 
 		 250 aa  335  5e-91  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.314254 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1246  phosphoglyceromutase  66.26 
 
 		 250 aa  334  7e-91  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0432438  normal  0.418524 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0899  phosphoglyceromutase  66.26 
 
 		 250 aa  334  9e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0808  phosphoglyceromutase  66.26 
 
 		 250 aa  334  9e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0782  phosphoglyceromutase  65.45 
 
 		 250 aa  334  1e-90  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0185649  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2895  phosphoglyceromutase  67.07 
 
 		 250 aa  333  2e-90  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.148167  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1164  phosphoglyceromutase  65.85 
 
 		 250 aa  330  1e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0187  phosphoglyceromutase  62.75 
 
 		 247 aa  327  8e-89  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00937723  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1288  phosphoglyceromutase  65.04 
 
 		 250 aa  327  2.0000000000000001e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.600576 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1424  phosphoglycerate mutase 1 family  61.69 
 
 		 249 aa  325  5e-88  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0896608  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0780  phosphoglyceromutase  60.32 
 
 		 249 aa  324  8.000000000000001e-88  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2111  phosphoglycerate mutase 1 family  62.1 
 
 		 248 aa  322  3e-87  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.326311  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1938  phosphoglyceromutase  61.13 
 
 		 247 aa  322  4e-87  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.90026  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0627  phosphoglyceromutase  60.73 
 
 		 247 aa  322  5e-87  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0304  phosphoglyceromutase  65.32 
 
 		 248 aa  321  7e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0671  phosphoglycerate mutase 1 family  60.73 
 
 		 247 aa  320  9.999999999999999e-87  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0251  phosphoglycerate mutase  64.92 
 
 		 436 aa  317  2e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1653  phosphoglyceromutase  61.89 
 
 		 247 aa  314  7e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00239487  normal  0.883975 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3004  phosphoglycerate mutase  63.16 
 
 		 253 aa  314  7e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0298836  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0611  phosphoglycerate mutase 1 family  62.5 
 
 		 247 aa  314  9e-85  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1612  phosphoglyceromutase  62.7 
 
 		 247 aa  314  9.999999999999999e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0228  phosphoglyceromutase  63.31 
 
 		 251 aa  314  9.999999999999999e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00314651 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0209  phosphoglyceromutase  63.31 
 
 		 251 aa  314  9.999999999999999e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0780605 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2243  phosphoglyceromutase  66.4 
 
 		 270 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.545502  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2857  phosphoglyceromutase  66.4 
 
 		 270 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.310958  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04761  phosphoglyceromutase  63.41 
 
 		 249 aa  313  1.9999999999999998e-84  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.151884  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0446  phosphoglyceromutase  65.99 
 
 		 270 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.19692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2868  phosphoglyceromutase  66.4 
 
 		 248 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.327501 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1121  phosphoglyceromutase  60.98 
 
 		 251 aa  312  2.9999999999999996e-84  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0353  phosphoglyceromutase  63.31 
 
 		 267 aa  312  3.9999999999999997e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.136198 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6186  phosphoglyceromutase  65.99 
 
 		 270 aa  312  3.9999999999999997e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3208  phosphoglyceromutase  65.52 
 
 		 249 aa  311  4.999999999999999e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2838  phosphoglyceromutase  65.52 
 
 		 249 aa  311  4.999999999999999e-84  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0497  phosphoglyceromutase  65.52 
 
 		 249 aa  311  4.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0662  phosphoglyceromutase  65.52 
 
 		 249 aa  311  4.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0478  phosphoglyceromutase  65.52 
 
 		 249 aa  311  4.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2324  phosphoglycerate mutase 1 family protein  60.48 
 
 		 248 aa  311  4.999999999999999e-84  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1411  phosphoglyceromutase  65.52 
 
 		 249 aa  311  4.999999999999999e-84  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0181  phosphoglyceromutase  65.52 
 
 		 249 aa  311  4.999999999999999e-84  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4181  phosphoglyceromutase  63.97 
 
 		 248 aa  311  5.999999999999999e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2651  phosphoglycerate mutase 1 family protein  60.82 
 
 		 249 aa  311  6.999999999999999e-84  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2912  phosphoglyceromutase  65.18 
 
 		 248 aa  310  1e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0678  phosphoglyceromutase  58.87 
 
 		 248 aa  310  1e-83  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.90978  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0501  phosphoglycerate mutase 1  62.5 
 
 		 247 aa  309  2e-83  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0841539  normal  0.749431 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0927  phosphoglycerate mutase 1 family protein  63.36 
 
 		 250 aa  309  2.9999999999999997e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.224068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0416  phosphoglyceromutase  65.09 
 
 		 250 aa  308  4e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.886094  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2774  phosphoglyceromutase  64.37 
 
 		 248 aa  308  4e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_51298  phosphoglycerate mutase  58.27 
 
 		 306 aa  308  4e-83  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0886  phosphoglycerate mutase  61.13 
 
 		 293 aa  308  5e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0534  phosphoglyceromutase  63.97 
 
 		 248 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3514  phosphoglycerate mutase 1 family protein  62.75 
 
 		 247 aa  305  6e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0019746 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0667  phosphoglyceromutase  58.06 
 
 		 251 aa  303  2.0000000000000002e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000997316  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1309  phosphoglyceromutase  61.54 
 
 		 247 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0266  phosphoglyceromutase  63.16 
 
 		 248 aa  302  3.0000000000000004e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1450  phosphoglyceromutase  58.06 
 
 		 249 aa  301  9e-81  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0421206  normal  0.072339 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2828  phosphoglyceromutase  61.54 
 
 		 247 aa  299  2e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1198  phosphoglyceromutase  60.57 
 
 		 249 aa  299  4e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.111464 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3505  phosphoglyceromutase  62.61 
 
 		 247 aa  298  4e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.991193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3858  phosphoglyceromutase  60.32 
 
 		 247 aa  298  5e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.744697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1813  phosphoglyceromutase  61.74 
 
 		 247 aa  297  9e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1697  phosphoglyceromutase  56.91 
 
 		 247 aa  296  2e-79  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4103  phosphoglycerate mutase 1 family  59.51 
 
 		 247 aa  295  5e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.347525  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0635  phosphoglyceromutase  57.66 
 
 		 249 aa  295  6e-79  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00161854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0601  phosphoglycerate mutase 1 family  60.43 
 
 		 229 aa  293  1e-78  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70394  phosphoglycerate mutase  60.48 
 
 		 248 aa  293  1e-78  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.565846 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06510  phosphoglyceromutase  58.85 
 
 		 253 aa  292  4e-78  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.609997  normal  0.628914 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1072  phosphoglyceromutase  57.72 
 
 		 249 aa  292  4e-78  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.095004  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0953  phosphoglyceromutase  57.72 
 
 		 249 aa  291  8e-78  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.197373  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3133  phosphoglyceromutase  62.17 
 
 		 228 aa  290  2e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.121125  normal  0.825822 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0287  phosphoglyceromutase  54.44 
 
 		 248 aa  289  4e-77  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0130  phosphoglyceromutase  53.63 
 
 		 248 aa  288  8e-77  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00296259 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1653  phosphoglyceromutase  60.09 
 
 		 229 aa  287  9e-77  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1948  phosphoglyceromutase  60.96 
 
 		 229 aa  286  2e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0432  phosphoglyceromutase  56.91 
 
 		 250 aa  286  2e-76  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1323  phosphoglyceromutase  59.05 
 
 		 232 aa  285  4e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196226  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4338  phosphoglycerate mutase 1 family  56.85 
 
 		 248 aa  285  7e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.88322 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1462  phosphoglyceromutase  62.61 
 
 		 249 aa  284  8e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.68427 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0167  phosphoglyceromutase  57.39 
 
 		 230 aa  284  9e-76  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000351468  hitchhiker  1.89085e-19 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2442  phosphoglyceromutase  58.08 
 
 		 245 aa  283  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.205182  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1059  phosphoglycerate mutase 1 family  61.88 
 
 		 229 aa  283  2.0000000000000002e-75  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3265  phosphoglyceromutase  60 
 
 		 228 aa  283  2.0000000000000002e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.602214  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2520  phosphoglyceromutase  58.52 
 
 		 245 aa  281  5.000000000000001e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000915293  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0772  phosphoglycerate mutase 1 family  53.23 
 
 		 601 aa  281  9e-75  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>