162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0426 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_0426  carbamate kinase  100 
 
 
310 aa  630  1e-180  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1228  carbamate kinase  66.02 
 
 
311 aa  424  1e-117  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1253  carbamate kinase  66.02 
 
 
311 aa  424  1e-117  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.661641  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2125  carbamate kinase  66.78 
 
 
308 aa  417  1e-116  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2352  carbamate kinase  63.96 
 
 
310 aa  411  1e-114  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0183  carbamate kinase  58.63 
 
 
310 aa  364  1e-99  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0673  carbamate kinase  57.7 
 
 
317 aa  364  1e-99  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000329636 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06560  carbamate kinase  54.9 
 
 
319 aa  355  5e-97  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.298804 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06680  carbamate kinase  54.87 
 
 
310 aa  352  7e-96  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0029  carbamate kinase  57.14 
 
 
310 aa  350  1e-95  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0679  carbamate kinase  56.72 
 
 
317 aa  350  2e-95  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.378738 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02380  carbamate kinase  54.9 
 
 
317 aa  347  1e-94  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.720538  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1947  carbamate kinase  57.05 
 
 
317 aa  347  1e-94  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0184546  normal  0.423275 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0787  carbamate kinase  57.84 
 
 
312 aa  346  3e-94  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1429  carbamate kinase  56.54 
 
 
310 aa  343  2e-93  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00850  carbamate kinase  55.23 
 
 
319 aa  338  7e-92  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1665  carbamate kinase  55.66 
 
 
313 aa  331  1e-89  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0164  carbamate kinase  54.66 
 
 
314 aa  325  5e-88  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3444  carbamate kinase  53.55 
 
 
312 aa  323  2e-87  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.02546  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0160  carbamate kinase  53.7 
 
 
314 aa  320  1.9999999999999998e-86  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0242  carbamate kinase  51.46 
 
 
313 aa  315  5e-85  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000109106  normal  0.377226 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0069  carbamate kinase-like carbamoyl phosphate synthetase  52.6 
 
 
313 aa  315  5e-85  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3199  carbamate kinase  53.27 
 
 
310 aa  314  9.999999999999999e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0818  carbamate kinase  52.94 
 
 
310 aa  312  3.9999999999999997e-84  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3034  carbamate kinase  52.94 
 
 
310 aa  312  3.9999999999999997e-84  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0834  carbamate kinase  52.94 
 
 
310 aa  312  3.9999999999999997e-84  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3007  carbamate kinase  52.94 
 
 
310 aa  312  3.9999999999999997e-84  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0485  carbamate kinase  54.19 
 
 
313 aa  312  5.999999999999999e-84  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000618454  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2476  carbamate kinase  54.07 
 
 
309 aa  311  6.999999999999999e-84  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02707  predicted amino acid kinase  52.61 
 
 
310 aa  311  1e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02669  hypothetical protein  52.61 
 
 
310 aa  311  1e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4164  carbamate kinase  52.29 
 
 
310 aa  309  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0475  carbamate kinase  50.97 
 
 
320 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.331437  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0351  carbamate kinase  50.97 
 
 
321 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4895  carbamate kinase  50.32 
 
 
320 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.428226  normal  0.706873 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0423  carbamate kinase  50.32 
 
 
320 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0610099  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0651  carbamate kinase  51.63 
 
 
310 aa  305  7e-82  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0344  carbamate kinase  49.68 
 
 
320 aa  304  1.0000000000000001e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05980  carbamate kinase  51.77 
 
 
320 aa  304  1.0000000000000001e-81  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.38542 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12560  carbamate kinase  51.28 
 
 
321 aa  304  1.0000000000000001e-81  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0410  carbamate kinase  49.68 
 
 
320 aa  304  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00340879 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2650  carbamate kinase  49.51 
 
 
313 aa  303  3.0000000000000004e-81  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2167  carbamate kinase  49.2 
 
 
318 aa  301  1e-80  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0269  carbamate kinase  52.88 
 
 
318 aa  295  1e-78  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000010285  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1788  carbamate kinase-like carbamoyl phosphate synthetase  50.32 
 
 
311 aa  290  2e-77  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1927  carbamate kinase-like carbamoyl phosphate synthetase  50.32 
 
 
312 aa  288  7e-77  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0219816  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0039  carbamate kinase  50.64 
 
 
309 aa  276  4e-73  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2656  carbamate kinase  46.6 
 
 
322 aa  273  2.0000000000000002e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.168651  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2712  carbamate kinase  46.6 
 
 
322 aa  273  2.0000000000000002e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2318  carbamate kinase  47.91 
 
 
314 aa  267  2e-70  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2117  carbamate kinase  46.43 
 
 
312 aa  263  3e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.43365  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1948  carbamate kinase  45.13 
 
 
314 aa  258  1e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.572312  hitchhiker  0.000272947 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0247  carbamate kinase  45.16 
 
 
314 aa  251  7e-66  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1820  carbamate kinase  44.77 
 
 
330 aa  250  2e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1838  carbamate kinase  43.55 
 
 
301 aa  250  2e-65  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.955077  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3101  carbamate kinase  46.23 
 
 
309 aa  249  5e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000494592  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2319  carbamate kinase  46.33 
 
 
314 aa  248  1e-64  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03712  Carbamate kinase-like protein yahI  43.59 
 
 
346 aa  245  6.999999999999999e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03661  hypothetical protein  43.59 
 
 
366 aa  245  6.999999999999999e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf130  carbamate kinase  48.26 
 
 
312 aa  245  6.999999999999999e-64  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4199  carbamate kinase  42.95 
 
 
318 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00169191 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2848  carbamate kinase  48.09 
 
 
313 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.431073  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3141  putative carbamate kinase  47.27 
 
 
316 aa  243  1.9999999999999999e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.463314  normal  0.769623 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1878  carbamate kinase  41.21 
 
 
316 aa  237  2e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2359  carbamate kinase  43.59 
 
 
301 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2409  carbamate kinase  43.59 
 
 
301 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4849  carbamate kinase  46.93 
 
 
310 aa  232  5e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4720  carbamate kinase  46.6 
 
 
310 aa  230  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.153382 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4868  carbamate kinase  46.6 
 
 
310 aa  230  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4813  carbamate kinase  46.6 
 
 
310 aa  230  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.42996  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4750  carbamate kinase  46.28 
 
 
310 aa  230  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0388  putative carbamate kinase  45.98 
 
 
316 aa  229  5e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.662634 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3300  putative carbamate kinase  45.98 
 
 
316 aa  228  7e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.777293  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00278  predicted carbamate kinase-like protein  45.98 
 
 
316 aa  228  8e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00282  hypothetical protein  45.98 
 
 
316 aa  228  8e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2239  carbamate kinase  43.99 
 
 
305 aa  227  2e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.126564  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0451  carbamate kinase  47.16 
 
 
303 aa  227  2e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0361431 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3283  Carbamate kinase  45.66 
 
 
316 aa  226  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0353  putative carbamate kinase  45.34 
 
 
316 aa  226  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2177  carbamate kinase  41.72 
 
 
304 aa  225  6e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0383  putative carbamate kinase  45.02 
 
 
316 aa  225  7e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0341  putative carbamate kinase  45.63 
 
 
316 aa  225  8e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1620  carbamate kinase  43.64 
 
 
298 aa  223  3e-57  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1036  carbamate kinase  42.77 
 
 
309 aa  223  4e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.873124  normal  0.536796 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0999  carbamate kinase  42.77 
 
 
309 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.782851  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0998  carbamate kinase  42.26 
 
 
309 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4225  carbamate kinase  41.94 
 
 
309 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.375863  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1389  carbamate kinase  41.16 
 
 
314 aa  216  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0373109  normal  0.478353 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5913  carbamate kinase  41.99 
 
 
310 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2426  carbamate kinase  40.97 
 
 
318 aa  216  5e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6441  carbamate kinase  41.61 
 
 
312 aa  216  5e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.841619  normal  0.393603 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68350  carbamate kinase  41.67 
 
 
310 aa  215  9e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.221419 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2686  carbamate kinase  42.26 
 
 
309 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4388  carbamate kinase  41.61 
 
 
309 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.692138  normal  0.186068 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1106  carbamate kinase  41.61 
 
 
308 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0757388  normal  0.19397 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0529  carbamate kinase  43.64 
 
 
298 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1875  carbamate kinase  42.63 
 
 
303 aa  212  7e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3187  carbamate kinase-like carbamoyl phosphate synthetase  42.39 
 
 
308 aa  212  7e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0172  carbamate kinase  40.19 
 
 
307 aa  211  1e-53  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.528941  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1966  carbamate kinase  40.13 
 
 
313 aa  210  2e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>