34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3072 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_3072  acyltransferase 3  100 
 
 		 351 aa  700    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0454  acyltransferase 3  37.61 
 
 		 348 aa  207  3e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4855  acyltransferase 3  37.05 
 
 		 352 aa  205  1e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.520478  normal  0.742854 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0537  acyltransferase 3  35.57 
 
 		 350 aa  204  3e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0504  acyltransferase 3  37.61 
 
 		 351 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2598  acyltransferase 3  37.71 
 
 		 372 aa  199  5e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7354  hypothetical protein  36.24 
 
 		 350 aa  197  3e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.351955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0301  acyltransferase 3  37.9 
 
 		 351 aa  196  6e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.267307 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0358  acyltransferase 3  36.42 
 
 		 370 aa  195  1e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.662003 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3182  acyltransferase 3  36.71 
 
 		 356 aa  186  5e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.815834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0134  acyltransferase 3  34.95 
 
 		 371 aa  180  4e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1197  acyltransferase 3  34.68 
 
 		 383 aa  169  8e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.649951 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4528  acyltransferase 3  37.35 
 
 		 357 aa  168  1e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.323845  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3208  acyltransferase 3  34.17 
 
 		 363 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.148496 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1411  acyltransferase 3  34.8 
 
 		 387 aa  160  2e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.252484 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1250  acyltransferase 3  34.2 
 
 		 387 aa  155  1e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.457932 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1630  acyltransferase 3  30.61 
 
 		 350 aa  148  1.0000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02910  predicted membrane protein  25.84 
 
 		 360 aa  73.6  0.000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2951  acyltransferase 3  28.24 
 
 		 333 aa  72.8  0.000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.100604 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0387  acyltransferase 3  27.96 
 
 		 369 aa  70.1  0.00000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.819707  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1093  acyltransferase 3  30.72 
 
 		 331 aa  62  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21050  predicted membrane protein  26.01 
 
 		 368 aa  60.8  0.00000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.851198  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3702  acyltransferase 3  30.73 
 
 		 360 aa  55.5  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00240595  normal  0.215938 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0740  acyltransferase 3  28.31 
 
 		 431 aa  55.1  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0988663  hitchhiker  0.00725636 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1630  acyltransferase 3  24.68 
 
 		 357 aa  50.8  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00419884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2208  putative acyltransferase  24.06 
 
 		 357 aa  50.8  0.00004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.162897  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1495  putative acyltransferase  24.06 
 
 		 357 aa  50.1  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0187927  normal  0.449977 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2532  acyltransferase 3  25 
 
 		 357 aa  49.7  0.00007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000991638  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1237  hypothetical protein  25 
 
 		 357 aa  49.7  0.00007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000187356  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2486  acyltransferase 3  25 
 
 		 357 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00152746  hitchhiker  0.00445696 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1238  hypothetical protein  25 
 
 		 357 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00200189  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01119  hypothetical protein  24.38 
 
 		 357 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.168503  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2011  putative acyltransferase  23.4 
 
 		 357 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.020428 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01111  predicted inner membrane protein  24.38 
 
 		 357 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.180967  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>