More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_2081 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_2081  30S ribosomal protein S15  100 
 
 		 89 aa  181  3e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0208  30S ribosomal protein S15  88.76 
 
 		 89 aa  160  5.0000000000000005e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000141015  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0202  30S ribosomal protein S15  87.64 
 
 		 89 aa  157  4e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1171  30S ribosomal protein S15  69.66 
 
 		 89 aa  129  1.0000000000000001e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000173887  hitchhiker  0.0000000000423662 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1333  30S ribosomal protein S15  67.42 
 
 		 89 aa  126  8.000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.927081  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1359  30S ribosomal protein S15  67.42 
 
 		 89 aa  126  8.000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3855  30S ribosomal protein S15  65.17 
 
 		 89 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000193325  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3630  30S ribosomal protein S15  65.17 
 
 		 89 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0989611  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3846  30S ribosomal protein S15  65.17 
 
 		 89 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1338  30S ribosomal protein S15  65.17 
 
 		 89 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0311618 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3659  30S ribosomal protein S15  65.17 
 
 		 89 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000386008  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3549  30S ribosomal protein S15  65.17 
 
 		 89 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3567  30S ribosomal protein S15  65.17 
 
 		 89 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000530871  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3945  30S ribosomal protein S15  65.17 
 
 		 89 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3819  30S ribosomal protein S15  65.17 
 
 		 89 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.73221e-63 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3906  30S ribosomal protein S15  65.17 
 
 		 89 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2460  30S ribosomal protein S15  65.17 
 
 		 89 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0021133  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0648  30S ribosomal protein S15  67.42 
 
 		 89 aa  125  2.0000000000000002e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000459061  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1582  30S ribosomal protein S15  69.66 
 
 		 89 aa  125  2.0000000000000002e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.844449  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1160  30S ribosomal protein S15  65.17 
 
 		 89 aa  124  6e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000129722  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0840  30S ribosomal protein S15  65.17 
 
 		 89 aa  122  2e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2052  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 		 89 aa  122  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1283  SSU ribosomal protein S15P  65.17 
 
 		 89 aa  120  6e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1055  SSU ribosomal protein S15P  60.67 
 
 		 89 aa  115  9.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000690643  hitchhiker  0.0000086131 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1560  30S ribosomal protein S15  59.77 
 
 		 88 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.2194e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3723  SSU ribosomal protein S15P  57.3 
 
 		 89 aa  111  3e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0177  30S ribosomal protein S15  57.3 
 
 		 89 aa  110  4.0000000000000004e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3671  30S ribosomal protein S15  58.62 
 
 		 88 aa  111  4.0000000000000004e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000549892  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1935  30S ribosomal protein S15  60.92 
 
 		 87 aa  111  4.0000000000000004e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1653  30S ribosomal protein S15  60.92 
 
 		 87 aa  111  4.0000000000000004e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2419  ribosomal protein S15  55.06 
 
 		 89 aa  110  6e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.746866  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002612  SSU ribosomal protein S15p (S13e)  56.18 
 
 		 89 aa  109  1.0000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3166  30S ribosomal protein S15  57.3 
 
 		 89 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.177567  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1338  30S ribosomal protein S15  55.68 
 
 		 90 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0211534  normal  0.0449315 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1708  ribosomal protein S15  58.62 
 
 		 87 aa  109  2.0000000000000002e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1441  ribosomal protein S15  62.79 
 
 		 88 aa  108  2.0000000000000002e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3784  30S ribosomal protein S15  56.18 
 
 		 89 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.116654  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3219  30S ribosomal protein S15  55.68 
 
 		 90 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.962482 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0905  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 		 89 aa  108  2.0000000000000002e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.713518  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2994  30S ribosomal protein S15  57.3 
 
 		 89 aa  108  2.0000000000000002e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2449  SSU ribosomal protein S15P  56.18 
 
 		 89 aa  108  3e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0751959  normal  0.780373 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1951  ribosomal protein S15  58.43 
 
 		 89 aa  108  3e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.245042  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1905  30S ribosomal protein S15  57.47 
 
 		 88 aa  108  3e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000149248  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1449  SSU ribosomal protein S15P  56.18 
 
 		 89 aa  108  3e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00001939  normal  0.2265 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1056  30S ribosomal protein S15  57.47 
 
 		 88 aa  107  4.0000000000000004e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000322002  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2206  30S ribosomal protein S15  55.06 
 
 		 89 aa  107  5e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.442595  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5458  30S ribosomal protein S15  56.18 
 
 		 89 aa  107  6e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.259891  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62720  30S ribosomal protein S15  56.18 
 
 		 89 aa  107  6e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.460956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0490  ribosomal protein S15  57.3 
 
 		 89 aa  107  6e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.515865 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2014  ribosomal protein S15  53.93 
 
 		 89 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0275051  normal  0.303203 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1673  30S ribosomal protein S15  56.32 
 
 		 88 aa  107  8.000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000247174  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2483  30S ribosomal protein S15  57.3 
 
 		 89 aa  106  9.000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.629413  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1835  30S ribosomal protein S15  53.93 
 
 		 89 aa  105  1e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4063  30S ribosomal protein S15  55.06 
 
 		 89 aa  105  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0743  30S ribosomal protein S15  53.93 
 
 		 89 aa  105  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.660742  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1429  30S ribosomal protein S15  53.93 
 
 		 89 aa  105  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1590  30S ribosomal protein S15  59.52 
 
 		 88 aa  106  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.18687e-19  normal  0.0361736 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1284  30S ribosomal protein S15  53.93 
 
 		 89 aa  105  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.942726  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1055  30S ribosomal protein S15  53.93 
 
 		 89 aa  105  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00453834  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1124  30S ribosomal protein S15  53.93 
 
 		 89 aa  105  1e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0407  30S ribosomal protein S15  53.93 
 
 		 89 aa  105  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07090  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 		 89 aa  106  1e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.619693  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42790  30S ribosomal protein S15  55.06 
 
 		 89 aa  105  1e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.441707  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1292  30S ribosomal protein S15  53.93 
 
 		 89 aa  105  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.608351  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3030  30S ribosomal protein S15  53.93 
 
 		 89 aa  106  1e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000113979  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2479  ribosomal protein S15  59.55 
 
 		 89 aa  106  1e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.053537  normal  0.211646 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1663  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 		 89 aa  105  2e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.1386  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4383  30S ribosomal protein S15  55.06 
 
 		 89 aa  105  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.846173 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0081  30S ribosomal protein S15  53.93 
 
 		 89 aa  105  2e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1698  30S ribosomal protein S15  55.06 
 
 		 89 aa  105  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1024  ribosomal protein S15  58.43 
 
 		 89 aa  105  2e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1464  ribosomal protein S15  52.81 
 
 		 89 aa  105  2e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0601  30S ribosomal protein S15  53.93 
 
 		 89 aa  105  2e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.831516  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0967  30S ribosomal protein S15  56.32 
 
 		 88 aa  105  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000355811  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2278  30S ribosomal protein S15  53.93 
 
 		 89 aa  104  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0135045  normal  0.085969 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10370  SSU ribosomal protein S15P  55.06 
 
 		 89 aa  105  3e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00597955  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1023  30S ribosomal protein S15  53.93 
 
 		 89 aa  104  3e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.672022 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5582  30S ribosomal protein S15  53.93 
 
 		 89 aa  104  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.171961  normal  0.430005 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2171  30S ribosomal protein S15  53.93 
 
 		 89 aa  104  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.191878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1642  30S ribosomal protein S15  53.93 
 
 		 89 aa  104  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.655154  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1145  30S ribosomal protein S15  55.06 
 
 		 89 aa  105  3e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.150061  normal  0.144917 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2292  30S ribosomal protein S15  53.93 
 
 		 89 aa  104  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0792803  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2254  30S ribosomal protein S15  53.93 
 
 		 89 aa  104  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4709  30S ribosomal protein S15  55.06 
 
 		 89 aa  104  4e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00644247 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4574  30S ribosomal protein S15  55.06 
 
 		 89 aa  104  4e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0323645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1257  ribosomal protein S15  56.18 
 
 		 89 aa  104  4e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01764  30S ribosomal protein S15  55.06 
 
 		 89 aa  104  4e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00913478  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3445  30S ribosomal protein S15  52.81 
 
 		 89 aa  104  4e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0173  30S ribosomal protein S15  55.06 
 
 		 89 aa  104  4e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.401011  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2760  30S ribosomal protein S15  53.93 
 
 		 89 aa  104  4e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00582272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2767  30S ribosomal protein S15  59.77 
 
 		 88 aa  103  6e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0332694  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3605  30S ribosomal protein S15  55.06 
 
 		 89 aa  103  6e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.228641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1438  30S ribosomal protein S15  56.18 
 
 		 89 aa  103  7e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000724827 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3049  SSU ribosomal protein S15P  52.81 
 
 		 89 aa  103  7e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1166  30S ribosomal protein S15  55.06 
 
 		 89 aa  103  8e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.466617  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1106  30S ribosomal protein S15  55.06 
 
 		 89 aa  103  8e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1234  30S ribosomal protein S15  55.06 
 
 		 89 aa  103  8e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0854619  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0417  30S ribosomal protein S15  56.32 
 
 		 87 aa  103  8e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2033  30S ribosomal protein S15  54.55 
 
 		 90 aa  103  8e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0943  30S ribosomal protein S15  54.55 
 
 		 90 aa  103  9e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.186111  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>