35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4294 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_4294  hypothetical protein  100 
 
 
197 aa  382  1e-105  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.17157  normal  0.269993 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0106  hypothetical protein  63.78 
 
 
190 aa  222  4e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3575  hypothetical protein  63.64 
 
 
190 aa  218  5e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2447  hypothetical protein  61.38 
 
 
187 aa  170  1e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.537217  decreased coverage  0.0000000310841 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1294  hypothetical protein  57.63 
 
 
176 aa  166  2e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.247549  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1741  MOSC domain-containing protein  40 
 
 
153 aa  111  6e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.296315  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1460  hypothetical protein  38.26 
 
 
160 aa  99.8  3e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.371187  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3073  MOSC domain containing protein  36.17 
 
 
153 aa  73.6  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4639  MOSC domain containing protein  32.26 
 
 
163 aa  70.1  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2906  MOSC domain containing protein  34.88 
 
 
167 aa  69.3  0.00000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1811  MOSC  32.12 
 
 
158 aa  64.3  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.98215  normal  0.190966 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00774  mosc  35.71 
 
 
151 aa  64.3  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00950006  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2516  MOSC  36.28 
 
 
165 aa  63.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.406281  normal  0.326487 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1442  MOSC domain-containing protein  33.59 
 
 
158 aa  61.2  0.000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0530  alpha amylase domain-containing protein  31.62 
 
 
144 aa  61.2  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0265  MOSC domain containing protein  32.59 
 
 
184 aa  60.5  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.798311  normal  0.0276593 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5926  hypothetical protein  34.01 
 
 
189 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0229267  normal  0.231206 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4831  hypothetical protein  34.21 
 
 
189 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  unclonable  0.000000085919  hitchhiker  0.00670464 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4111  putative sulferase  31.69 
 
 
174 aa  60.1  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.641133  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2412  MOSC domain-containing protein  34.15 
 
 
162 aa  57.8  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.255229  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2927  hypothetical protein  35.59 
 
 
165 aa  56.6  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0113815  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1459  MOSC domain-containing protein  29.58 
 
 
181 aa  53.9  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.550389  normal  0.126815 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3206  MOSC domain containing protein  28.67 
 
 
200 aa  53.5  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0881785  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1008  MOSC  32.3 
 
 
181 aa  50.1  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1526  MOSC domain containing protein  30 
 
 
178 aa  50.1  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7200  MOSC domain-containing protein  27.11 
 
 
167 aa  49.7  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.313237 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4829  MOSC  31.08 
 
 
175 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.142865  normal  0.399285 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0358  MOSC  30.7 
 
 
155 aa  46.6  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1356  hypothetical protein  37.66 
 
 
188 aa  47  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0007  MOSC domain-containing protein  34.48 
 
 
206 aa  46.6  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.278634  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0919  MOSC domain protein  30 
 
 
174 aa  44.3  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3499  hypothetical protein  31.58 
 
 
178 aa  43.1  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.70844  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0082  MOSC domain-containing protein  29.23 
 
 
164 aa  42.7  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5172  hypothetical protein  29.08 
 
 
146 aa  41.6  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.634719  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2198  hypothetical protein  30.95 
 
 
159 aa  41.2  0.01  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>