55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_2506 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_2506  YibE/F family protein  100 
 
 		 406 aa  808    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.416194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36270  predicted multitransmembrane protein  60.63 
 
 		 484 aa  406  1.0000000000000001e-112  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1777  YibE/F family protein  46.65 
 
 		 422 aa  304  2.0000000000000002e-81  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0836045  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1371  YibE/F family protein  40.68 
 
 		 484 aa  289  8e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000298866 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1335  YibE/F family protein  42.07 
 
 		 499 aa  284  2.0000000000000002e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3598  YibE/F family protein  41.31 
 
 		 428 aa  253  6e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3310  YibE/F family protein  47.43 
 
 		 386 aa  252  7e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0164  YibE/F family protein  46.38 
 
 		 416 aa  248  2e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00530836 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15190  predicted multitransmembrane protein  38.8 
 
 		 397 aa  224  3e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0772315 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0616  YibE/F family protein  35.93 
 
 		 436 aa  223  4.9999999999999996e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1706  YibE/F family protein  36.52 
 
 		 513 aa  223  4.9999999999999996e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2203  YibE/F family protein  39.8 
 
 		 599 aa  220  3.9999999999999997e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0151  YibE/F family protein  40.74 
 
 		 438 aa  217  2.9999999999999998e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0309546 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4623  YibE/F family protein  43.06 
 
 		 427 aa  211  2e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0949625  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4407  YibE/F family protein  36.32 
 
 		 447 aa  201  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.689016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0617  YibE/F family protein  34.72 
 
 		 411 aa  195  1e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225708  normal  0.665044 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0292  YibE/F family protein  35.45 
 
 		 404 aa  192  8e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.502683  normal  0.0969675 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0460  YibE/F family protein  41.9 
 
 		 563 aa  191  2e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0281  YibE/F family protein  40.62 
 
 		 413 aa  187  2e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.715715  normal  0.837418 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0532  YibE/F family protein  35.43 
 
 		 449 aa  185  1.0000000000000001e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.155623  normal  0.0605973 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1586  YibE/F family protein  42.04 
 
 		 480 aa  185  1.0000000000000001e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.728201  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0444  YibE/F family protein  35.44 
 
 		 448 aa  183  4.0000000000000006e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.701723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0427  YibE/F family protein  34.77 
 
 		 410 aa  158  2e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.550828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0450  YibE/F family protein  35.03 
 
 		 424 aa  157  3e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0441383 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0440  YibE/F-like protein  35.03 
 
 		 424 aa  157  3e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.270973  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5754  YibE/F family protein  34.25 
 
 		 404 aa  150  3e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1474  YibE/F family protein  32.98 
 
 		 345 aa  137  4e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.649458  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2084  YibE/F family protein  34.04 
 
 		 446 aa  131  2.0000000000000002e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0158953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2717  YibE/F family protein  30.69 
 
 		 393 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00980244  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2256  hypothetical protein  28.02 
 
 		 393 aa  116  6e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000922663  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2866  YibE/F family protein  30.8 
 
 		 451 aa  113  6e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.405695  hitchhiker  0.000000000000397965 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1552  YibE/F family protein  30.1 
 
 		 392 aa  110  3e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.0000166872  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18650  predicted multitransmembrane protein  28.83 
 
 		 404 aa  109  1e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.221349  normal  0.497385 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1717  YibE/F family protein  28.99 
 
 		 373 aa  107  3e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000872311  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01199  hypothetical protein  22.44 
 
 		 396 aa  105  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2300  YibE/F family protein  33.47 
 
 		 376 aa  102  9e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000681983  normal  0.658547 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0869  hypothetical protein  24.23 
 
 		 370 aa  101  2e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0893767  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2695  hypothetical protein  24.29 
 
 		 434 aa  94.7  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4236  YibE/F family protein  26.69 
 
 		 409 aa  94  5e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1617  YbiE/YbiF family membrane protein  24.43 
 
 		 382 aa  93.6  5e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0997624  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1156  YibE/F family protein  25.96 
 
 		 385 aa  89.7  8e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0625  YibE/F family protein  25 
 
 		 416 aa  83.6  0.000000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0617008  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0513  YibE/F family protein  24.48 
 
 		 386 aa  81.6  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1217  multitransmembrane protein-like  27.54 
 
 		 395 aa  78.2  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0923  YibE/F family protein  26.69 
 
 		 381 aa  77.4  0.0000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0732684  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0490  hypothetical protein  26.98 
 
 		 260 aa  76.6  0.0000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.45051  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0503  hypothetical protein  26.98 
 
 		 260 aa  76.6  0.0000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.84165  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2291  YibE/F family protein  25.71 
 
 		 396 aa  76.6  0.0000000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0106  hypothetical protein  28.16 
 
 		 370 aa  75.1  0.000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0491  hypothetical protein  25.85 
 
 		 370 aa  74.3  0.000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.696499  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0504  hypothetical protein  25.85 
 
 		 370 aa  74.3  0.000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.36708  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0105  hypothetical protein  26.63 
 
 		 261 aa  73.6  0.000000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0458  YibE/F family protein  23.65 
 
 		 371 aa  51.2  0.00003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000650445  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0111  multitransmembrane protein  24 
 
 		 253 aa  46.6  0.0008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000423826 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0110  multitransmembrane protein  21.81 
 
 		 360 aa  43.1  0.008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000156468 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>