31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1567 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_1567  hypothetical protein  100 
 
 
522 aa  1044    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2222  hypothetical protein  37.44 
 
 
499 aa  278  2e-73  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17220  hypothetical protein  35.1 
 
 
477 aa  266  5e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.96015  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2029  hypothetical protein  36.26 
 
 
490 aa  255  2.0000000000000002e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0271  hypothetical protein  33.01 
 
 
507 aa  227  5.0000000000000005e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.272774  decreased coverage  0.00169568 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22890  Methyl-accepting chemotaxis protein  26.04 
 
 
487 aa  80.5  0.00000000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26590  hypothetical protein  23.92 
 
 
515 aa  78.6  0.0000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0065  hypothetical protein  23.49 
 
 
492 aa  74.7  0.000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.950662  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3740  hypothetical protein  20.63 
 
 
485 aa  71.6  0.00000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4005  hypothetical protein  23.03 
 
 
489 aa  69.7  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0110668 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2066  hypothetical protein  26.35 
 
 
502 aa  69.3  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0285936  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3942  hypothetical protein  20.62 
 
 
482 aa  67  0.0000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03250  hypothetical protein  24.36 
 
 
538 aa  65.1  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000127047  unclonable  2.10051e-21 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03537  hypothetical protein  23.19 
 
 
490 aa  64.7  0.000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.206866  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3698  hypothetical protein  25.16 
 
 
499 aa  61.2  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.268851  decreased coverage  0.000278839 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49830  hypothetical protein  24.36 
 
 
450 aa  59.7  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0737  hypothetical protein  22.88 
 
 
482 aa  59.7  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.509556  normal  0.0133056 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0870  hypothetical protein  23.73 
 
 
490 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.282403  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2296  hypothetical protein  23.51 
 
 
478 aa  58.5  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.357562  normal  0.109764 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1811  hypothetical protein  22.73 
 
 
481 aa  57  0.0000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0222  hypothetical protein  24.23 
 
 
488 aa  56.6  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00993068 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0422  hypothetical protein  20.78 
 
 
543 aa  55.1  0.000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0372784  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1446  hypothetical protein  23.67 
 
 
482 aa  53.5  0.000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0780  hypothetical protein  23.67 
 
 
481 aa  53.5  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0838  hypothetical protein  23.67 
 
 
480 aa  52  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2185  hypothetical protein  21.13 
 
 
510 aa  48.1  0.0003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2278  hypothetical protein  22.07 
 
 
494 aa  47.8  0.0005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0901  hypothetical protein  22.86 
 
 
483 aa  46.2  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0797032  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0518  hypothetical protein  20.08 
 
 
482 aa  46.6  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.566512  normal  0.42131 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0048  hypothetical protein  23.42 
 
 
484 aa  46.2  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0017  hypothetical protein  21.03 
 
 
484 aa  45.8  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>