17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_1168 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_1168  hypothetical protein  100 
 
 
342 aa  692    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3898  hypothetical protein  82.16 
 
 
341 aa  573  1.0000000000000001e-162  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00564411  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1005  hypothetical protein  47.49 
 
 
338 aa  296  5e-79  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0092  lipolytic protein G-D-S-L family  46.27 
 
 
338 aa  275  6e-73  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2781  hypothetical protein  43.93 
 
 
341 aa  239  6.999999999999999e-62  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0173  lipolytic protein G-D-S-L family  32.62 
 
 
340 aa  77.8  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0370  hypothetical protein  27.04 
 
 
393 aa  68.2  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6240  GDSL family lipase  27.89 
 
 
329 aa  58.9  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1504  hypothetical protein  25.63 
 
 
362 aa  57  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.232931  normal  0.12901 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3064  hypothetical protein  24.87 
 
 
386 aa  54.7  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0823748  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3572  hypothetical protein  25.73 
 
 
368 aa  51.6  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0629416  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6201  hypothetical protein  25.79 
 
 
384 aa  50.8  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.196409  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3977  lipolytic protein G-D-S-L family  22.09 
 
 
593 aa  48.9  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.410599  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1387  hypothetical protein  21.47 
 
 
358 aa  47.8  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.585721  normal  0.143708 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2366  lipase/acylhydrolase domain-containing protein  25.29 
 
 
376 aa  47.8  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00890776  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8161  lipolytic protein G-D-S-L family  25.97 
 
 
358 aa  46.6  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2682  lipolytic protein G-D-S-L family  21.21 
 
 
593 aa  43.9  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.825886 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>