More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_20940 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011899  Hore_20940  PP-loop domain protein  100 
 
 		 260 aa  536  1e-151  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000433533  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2599  PP-loop domain protein  39.71 
 
 		 235 aa  181  1e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000526821  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2181  ATPase  40.68 
 
 		 237 aa  177  1e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000263465  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3405  PP-loop domain protein  39.92 
 
 		 239 aa  176  4e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2259  PP-loop domain-containing protein  45.45 
 
 		 242 aa  175  7e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000140384  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1810  PP-loop domain-containing protein  38.43 
 
 		 235 aa  174  9e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000657331  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1321  PP-loop domain-containing protein  37.25 
 
 		 252 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.32014  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0882  PP-loop domain-containing protein  36.67 
 
 		 307 aa  173  2.9999999999999996e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.175206  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1247  ExsB family protein  40.37 
 
 		 244 aa  171  7.999999999999999e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.400272  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1059  PP-loop family protein  40.37 
 
 		 244 aa  171  7.999999999999999e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2367  PP-loop domain protein  36.79 
 
 		 247 aa  160  3e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1709  PP-loop domain protein  34.69 
 
 		 244 aa  157  1e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0799  PP-loop domain protein  36.84 
 
 		 247 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0060  C32 tRNA thiolase  40.18 
 
 		 315 aa  145  7.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.867348  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1011  PP family ATPase  38.18 
 
 		 240 aa  145  7.0000000000000006e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0407194  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0068  C32 tRNA thiolase  39.73 
 
 		 315 aa  144  2e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0175  C32 tRNA thiolase  39.27 
 
 		 312 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.186206 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1043  C32 tRNA thiolase  37.61 
 
 		 310 aa  136  3.0000000000000003e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00286005  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1841  C32 tRNA thiolase  36.53 
 
 		 323 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000126519  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1573  C32 tRNA thiolase  37.04 
 
 		 307 aa  134  1.9999999999999998e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.539766  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0903  C32 tRNA thiolase  36.16 
 
 		 290 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0875  PP-loop  35.62 
 
 		 284 aa  133  3e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00139883  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0954  PP-loop domain protein  35.27 
 
 		 291 aa  132  6.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0952  PP-loop domain protein  35.27 
 
 		 291 aa  132  7.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0206  conserved hypothetical protein, putative ATPase (PP-loop superfamily)  38.04 
 
 		 253 aa  131  9e-30  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0228  C32 tRNA thiolase  35.62 
 
 		 303 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.608428 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1247  C32 tRNA thiolase  35 
 
 		 313 aa  131  1.0000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2974  PP-loop family protein  33.18 
 
 		 314 aa  130  2.0000000000000002e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0184  C32 tRNA thiolase  36.7 
 
 		 314 aa  129  3e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.478782 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0227  C32 tRNA thiolase  36.24 
 
 		 312 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.384347  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0153  PP-loop family protein  37.3 
 
 		 251 aa  129  4.0000000000000003e-29  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0100242  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1750  C32 tRNA thiolase  34.93 
 
 		 368 aa  129  4.0000000000000003e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000779647 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1802  C32 tRNA thiolase  37.28 
 
 		 313 aa  129  5.0000000000000004e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0113  PP-loop family protein  36.76 
 
 		 251 aa  129  5.0000000000000004e-29  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_10299  predicted protein  39.33 
 
 		 199 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.127345  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02065  C32 tRNA thiolase  33.94 
 
 		 317 aa  129  5.0000000000000004e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00588797  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1912  C32 tRNA thiolase  37.28 
 
 		 313 aa  129  5.0000000000000004e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2206  C32 tRNA thiolase  37.28 
 
 		 313 aa  129  5.0000000000000004e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.840796 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1793  C32 tRNA thiolase  33.93 
 
 		 302 aa  129  5.0000000000000004e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0516  C32 tRNA thiolase  33.94 
 
 		 314 aa  129  6e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.366068  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0127  C32 tRNA thiolase  35.91 
 
 		 282 aa  128  7.000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2544  PP-loop domain protein  32.62 
 
 		 292 aa  128  7.000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.203919  normal  0.870169 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4143  C32 tRNA thiolase  34.74 
 
 		 287 aa  128  8.000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2316  C32 tRNA thiolase  36.2 
 
 		 311 aa  128  9.000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.415676  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33230  C32 tRNA thiolase  35.32 
 
 		 274 aa  128  9.000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.259091  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2598  C32 tRNA thiolase  36.2 
 
 		 311 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4232  C32 tRNA thiolase  34.7 
 
 		 274 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.636295  normal  0.524031 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2224  C32 tRNA thiolase  35.71 
 
 		 311 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00242897  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1777  C32 tRNA thiolase  36.53 
 
 		 311 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.101816 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1995  C32 tRNA thiolase  36.16 
 
 		 317 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0619881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0671  C32 tRNA thiolase  35.84 
 
 		 259 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.51504e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3336  C32 tRNA thiolase  35.07 
 
 		 264 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.167025  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1499  C32 tRNA thiolase  36.53 
 
 		 311 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3479  C32 tRNA thiolase  34.68 
 
 		 258 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.101099  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2415  C32 tRNA thiolase  33.94 
 
 		 319 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.170221  decreased coverage  0.000000170238 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0695  C32 tRNA thiolase  34.08 
 
 		 317 aa  126  3e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.283768  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6329  C32 tRNA thiolase  34.4 
 
 		 331 aa  126  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.577363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1774  C32 tRNA thiolase  36.07 
 
 		 311 aa  127  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.075518 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1681  C32 tRNA thiolase  36.07 
 
 		 311 aa  127  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0199988  normal  0.0209698 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1773  C32 tRNA thiolase  36.49 
 
 		 313 aa  126  3e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1837  C32 tRNA thiolase  36.07 
 
 		 311 aa  127  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.555568  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0182  PP-loop domain-containing protein  31 
 
 		 288 aa  126  4.0000000000000003e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1738  C32 tRNA thiolase  36.44 
 
 		 313 aa  126  4.0000000000000003e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2962  C32 tRNA thiolase  34.4 
 
 		 274 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.828296  normal  0.0229557 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03846  C32 tRNA thiolase  34.8 
 
 		 305 aa  126  4.0000000000000003e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0494  C32 tRNA thiolase  33.33 
 
 		 317 aa  126  4.0000000000000003e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0548366 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0949  C32 tRNA thiolase  35.59 
 
 		 303 aa  125  5e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.744331 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0928  PP-loop family protein  38.04 
 
 		 252 aa  125  5e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2225  C32 tRNA thiolase  33.18 
 
 		 310 aa  125  5e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.28353 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0505  PP-loop domain protein  33.33 
 
 		 317 aa  125  5e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0974  PP-loop domain protein  32.57 
 
 		 309 aa  125  6e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.441228  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2020  C32 tRNA thiolase  35.32 
 
 		 312 aa  125  6e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1801  C32 tRNA thiolase  33.94 
 
 		 319 aa  125  7e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.313433 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3705  C32 tRNA thiolase  34.7 
 
 		 274 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.248731  hitchhiker  0.001028 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4186  C32 tRNA thiolase  34.4 
 
 		 274 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.610238  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48870  C32 tRNA thiolase  34.4 
 
 		 274 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000116894  hitchhiker  0.0000000652379 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01321  predicted C32 tRNA thiolase  36.07 
 
 		 311 aa  124  1e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2299  PP-loop domain protein  36.07 
 
 		 311 aa  124  1e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00162169  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2230  PP-loop domain-containing protein  31.47 
 
 		 279 aa  124  1e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.259403  normal  0.653141 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1733  C32 tRNA thiolase  36.95 
 
 		 299 aa  124  1e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4076  C32 tRNA thiolase  35.62 
 
 		 274 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1993  C32 tRNA thiolase  36.07 
 
 		 311 aa  124  1e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.800343 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01331  hypothetical protein  36.07 
 
 		 311 aa  124  1e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2366  C32 tRNA thiolase  33.94 
 
 		 326 aa  124  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.53458  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1461  C32 tRNA thiolase  36.07 
 
 		 311 aa  124  1e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1558  C32 tRNA thiolase  36.07 
 
 		 311 aa  124  1e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2980  C32 tRNA thiolase  33.94 
 
 		 331 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2281  C32 tRNA thiolase  36.07 
 
 		 311 aa  124  1e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.787518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2975  C32 tRNA thiolase  33.49 
 
 		 331 aa  124  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1641  C32 tRNA thiolase  35.62 
 
 		 274 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.822283  normal  0.200546 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2075  PP-loop domain protein  34.31 
 
 		 280 aa  123  2e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0753  C32 tRNA thiolase  34.86 
 
 		 283 aa  123  2e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0735  C32 tRNA thiolase  35.32 
 
 		 283 aa  124  2e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3000  C32 tRNA thiolase  33.49 
 
 		 331 aa  123  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1391  hypothetical protein  38.71 
 
 		 260 aa  124  2e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.738362  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1243  C32 tRNA thiolase  35.62 
 
 		 274 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000805224 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1167  C32 tRNA thiolase  35.71 
 
 		 256 aa  123  2e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.958339  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2142  C32 tRNA thiolase  34.86 
 
 		 311 aa  124  2e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.614557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2607  C32 tRNA thiolase  35.32 
 
 		 310 aa  124  2e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.560057 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1203  C32 tRNA thiolase  35.62 
 
 		 274 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>