28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_1187 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_1187  Sterol-binding domain protein  100 
 
 		 212 aa  422  1e-117  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.044865  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2344  hypothetical protein  30.61 
 
 		 202 aa  76.3  0.0000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0388  hypothetical protein  26.42 
 
 		 207 aa  72.4  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5803  hypothetical protein  28.43 
 
 		 208 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5151  hypothetical protein  31.96 
 
 		 207 aa  68.6  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4886  hypothetical protein  28.14 
 
 		 207 aa  68.6  0.00000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.8199 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0453  sterol-binding domain-containing protein  27.78 
 
 		 207 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.663917  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5012  hypothetical protein  27.64 
 
 		 207 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.57602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0386  hypothetical protein  26.9 
 
 		 207 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.778532  normal  0.105703 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45420  hypothetical protein  28.29 
 
 		 207 aa  65.5  0.0000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.471069  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5062  sterol-binding domain-containing protein  27.14 
 
 		 207 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0522  hypothetical protein  28.43 
 
 		 205 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.265718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0066  hypothetical protein  25.52 
 
 		 204 aa  63.2  0.000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2119  hypothetical protein  25.52 
 
 		 204 aa  63.2  0.000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.145601  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66910  hypothetical protein  27.64 
 
 		 208 aa  62.4  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2018  hypothetical protein  26.94 
 
 		 220 aa  60.5  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.987101  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2971  hypothetical protein  27.8 
 
 		 205 aa  58.2  0.00000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2819  hypothetical protein  27.8 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0322  hypothetical protein  20.81 
 
 		 210 aa  52.4  0.000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4131  hypothetical protein  32.31 
 
 		 206 aa  52  0.000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000668989 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2701  hypothetical protein  24.02 
 
 		 219 aa  50.1  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000952725 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0060  Sterol-binding domain protein  25 
 
 		 207 aa  48.5  0.00007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00563  hypothetical protein  24.77 
 
 		 211 aa  45.1  0.0007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0295  hypothetical protein  23.9 
 
 		 235 aa  45.4  0.0007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.126992  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3793  sterol-binding domain-containing protein  21.43 
 
 		 207 aa  42.4  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001926  hypothetical protein  24.52 
 
 		 211 aa  42.4  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0102  Sterol-binding domain protein  22.84 
 
 		 211 aa  41.6  0.008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3416  hypothetical protein  30.19 
 
 		 213 aa  41.6  0.01  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>