More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0078 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_2675  glycerol kinase  65.59 
 
 
498 aa  717  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.732872  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0402  glycerol kinase  62.96 
 
 
494 aa  655  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000703202 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3822  glycerol kinase  61.34 
 
 
493 aa  641  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4798  glycerol kinase  63.58 
 
 
502 aa  670  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  decreased coverage  3.11367e-05 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0399  glycerol kinase  61.94 
 
 
495 aa  647  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  2.52847e-05 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2876  glycerol kinase  60.64 
 
 
500 aa  649  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2559  glycerol kinase  60.64 
 
 
500 aa  652  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4460  glycerol kinase  62.8 
 
 
502 aa  666  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3583  glycerol kinase  62.15 
 
 
494 aa  651  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0284  glycerol kinase  64.26 
 
 
498 aa  698  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0100  glycerol kinase  64.8 
 
 
507 aa  684  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0948  glycerol kinase  60.94 
 
 
496 aa  647  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  2.69449e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4408  glycerol kinase  62.8 
 
 
502 aa  668  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4544  glycerol kinase  61.82 
 
 
495 aa  660  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0143138 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1104  glycerol kinase  61.41 
 
 
501 aa  636  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4366  glycerol kinase  62.8 
 
 
502 aa  666  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.569877 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1322  glycerol kinase  64.24 
 
 
496 aa  689  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.537601  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4092  glycerol kinase  62.8 
 
 
502 aa  666  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4113  glycerol kinase  64.8 
 
 
507 aa  684  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1020  glycerol kinase  64.52 
 
 
497 aa  711  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0373  glycerol kinase  61.94 
 
 
494 aa  649  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4157  glycerol kinase  62.8 
 
 
502 aa  666  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1364  glycerol kinase  64.72 
 
 
496 aa  692  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0682  glycerol kinase  61.41 
 
 
505 aa  641  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0476  glycerol kinase  62.35 
 
 
494 aa  649  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0341  glycerol kinase  62.63 
 
 
495 aa  641  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.424974  normal  0.511119 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4047  glycerol kinase  63.53 
 
 
502 aa  672  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2845  glycerol kinase  67.13 
 
 
501 aa  712  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107322  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3466  glycerol kinase  62.86 
 
 
498 aa  653  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0225971  normal  0.260214 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0391  glycerol kinase  62.96 
 
 
494 aa  655  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1359  glycerol kinase  59.15 
 
 
498 aa  646  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00195196  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3756  glycerol kinase  61.94 
 
 
494 aa  652  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0928777 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0617  glycerol kinase  61.3 
 
 
489 aa  637  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3815  glycerol kinase  62.04 
 
 
498 aa  641  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03313  glycerol kinase  60 
 
 
505 aa  639  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0101  glycerol kinase  64.8 
 
 
507 aa  684  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17960  glycerol kinase  63.51 
 
 
505 aa  665  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.155837  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0807  glycerol kinase  61.68 
 
 
496 aa  648  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  3.15642e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0390  glycerol kinase  63.16 
 
 
494 aa  656  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1561  glycerol kinase  63.51 
 
 
505 aa  667  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1385  glycerol kinase  59.15 
 
 
498 aa  646  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0514122  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0078  glycerol kinase  100 
 
 
507 aa  1038  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.503423  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4415  glycerol kinase  63.51 
 
 
502 aa  667  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03811  glycerol kinase  62.8 
 
 
502 aa  666  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0960  glycerol kinase  61.55 
 
 
496 aa  652  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0226948  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0947  glycerol kinase  61.76 
 
 
496 aa  654  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.37015e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0938  glycerol kinase  61.76 
 
 
496 aa  653  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  2.62863e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1491  glycerol kinase  59.68 
 
 
501 aa  635  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3905  glycerol kinase  61.29 
 
 
501 aa  644  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.969738 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0159  glycerol kinase  64.11 
 
 
503 aa  665  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0108  glycerol kinase  64.11 
 
 
503 aa  666  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.903611  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03760  hypothetical protein  62.8 
 
 
502 aa  666  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4168  glycerol kinase  60.69 
 
 
501 aa  639  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4230  glycerol kinase  62.15 
 
 
494 aa  649  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2150  glycerol kinase  64.43 
 
 
496 aa  652  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4059  glycerol kinase  62.8 
 
 
502 aa  666  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1245  glycerol kinase  61.13 
 
 
494 aa  658  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0437  glycerol kinase  61.59 
 
 
520 aa  643  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  1.12542e-06  decreased coverage  0.00471602 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1075  glycerol kinase  61.41 
 
 
499 aa  635  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1916  glycerol kinase  65.59 
 
 
496 aa  674  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0267705  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1465  glycerol kinase  73.8 
 
 
505 aa  780  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002675  glycerol kinase  60.6 
 
 
505 aa  645  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0174  glycerol kinase  63.1 
 
 
503 aa  659  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.300542  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3803  glycerol kinase  64.31 
 
 
503 aa  672  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1268  glycerol kinase  63.41 
 
 
496 aa  654  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  1.99841e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1195  glycerol kinase  61.76 
 
 
496 aa  654  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  3.55688e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4417  glycerol kinase  63.51 
 
 
502 aa  667  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1026  glycerol kinase  61.55 
 
 
496 aa  652  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  3.30334e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5381  glycerol kinase  62.8 
 
 
502 aa  666  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0385  glycerol kinase  61.4 
 
 
504 aa  644  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1803  glycerol kinase  61.57 
 
 
509 aa  645  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4485  glycerol kinase  63.51 
 
 
502 aa  667  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4332  glycerol kinase  63.51 
 
 
502 aa  667  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0533738  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4302  glycerol kinase  63.51 
 
 
502 aa  667  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0416  glycerol kinase  63.16 
 
 
494 aa  657  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  1.35699e-10 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1066  glycerol kinase  61.76 
 
 
496 aa  654  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  8.18027e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4532  glycerol kinase  61.65 
 
 
500 aa  642  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.422897  normal  0.159359 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4233  glycerol kinase  61.76 
 
 
496 aa  654  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  9.10223e-06  decreased coverage  9.61259e-09 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1106  glycerol kinase  61.76 
 
 
496 aa  654  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23662e-43 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45710  glycerol kinase  64.06 
 
 
505 aa  642  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0055  glycerol kinase  71.26 
 
 
501 aa  729  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4681  glycerol kinase  66.53 
 
 
494 aa  695  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.648243  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1116  glycerol kinase  61.01 
 
 
499 aa  632  1e-180  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.151406  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2059  glycerol kinase  59.84 
 
 
507 aa  634  1e-180  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000191654  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1531  glycerol kinase  60.76 
 
 
504 aa  634  1e-180  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.403909  normal  0.733886 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4337  glycerol kinase  61.01 
 
 
499 aa  633  1e-180  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0727  glycerol kinase  60 
 
 
513 aa  627  1e-178  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  1.5647e-05 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2371  glycerol kinase  60.4 
 
 
518 aa  627  1e-178  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.137405  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0725  glycerol kinase  60.4 
 
 
518 aa  627  1e-178  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.315112  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0739  glycerol kinase  60.4 
 
 
518 aa  627  1e-178  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2452  glycerol kinase  60.4 
 
 
518 aa  627  1e-178  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0107802  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1029  glycerol kinase  61.38 
 
 
496 aa  625  1e-178  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.21153 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0619  glycerol kinase  61.09 
 
 
500 aa  627  1e-178  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0867  glycerol kinase  57.46 
 
 
499 aa  625  1e-178  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.111674  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0240  glycerol kinase  60.4 
 
 
503 aa  627  1e-178  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.329761  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0599  glycerol kinase  60.4 
 
 
500 aa  628  1e-178  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0906  glycerol kinase  60.4 
 
 
503 aa  627  1e-178  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3168  glycerol kinase  59.6 
 
 
507 aa  626  1e-178  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.119094  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0410  glycerol kinase  60.85 
 
 
497 aa  625  1e-178  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2706  glycerol kinase  60.4 
 
 
518 aa  627  1e-178  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>