More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_4777 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_4777  rod shape-determining protein MreB  100 
 
 
353 aa  699    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000529713  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1283  rod shape-determining protein MreB  78.98 
 
 
358 aa  558  1e-158  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.852802  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1670  rod shape-determining protein MreB  78.69 
 
 
358 aa  559  1e-158  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00618582 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1191  rod shape-determining protein MreB  78.72 
 
 
359 aa  543  1e-153  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000240311  hitchhiker  0.00107444 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1629  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  72.7 
 
 
355 aa  467  9.999999999999999e-131  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1301  rod shape-determining protein MreB  60.23 
 
 
343 aa  419  1e-116  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.753188  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2548  rod shape-determining protein MreB  62.08 
 
 
343 aa  419  1e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1466  rod shape-determining protein MreB  59.76 
 
 
343 aa  415  9.999999999999999e-116  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2658  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  56.45 
 
 
350 aa  413  1e-114  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.228643 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14240  rod shape-determining protein MreB  59.76 
 
 
346 aa  411  1e-114  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000102365  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3339  rod shape-determining protein MreB  60.61 
 
 
343 aa  412  1e-114  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000677131  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0088  rod shape-determining protein MreB  58.82 
 
 
340 aa  409  1e-113  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0766  rod shape-determining protein MreB  60.47 
 
 
342 aa  408  1e-113  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0541555  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1824  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  60.53 
 
 
344 aa  408  1e-113  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2563  rod shape-determining protein MreB  58.75 
 
 
340 aa  403  1e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.684063  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0515  rod shape-determining protein MreB  58.19 
 
 
343 aa  399  9.999999999999999e-111  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0667798  hitchhiker  0.00000000455643 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4351  rod shape-determining protein MreB  59.7 
 
 
338 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00355227  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1540  rod shape-determining protein MreB  59.37 
 
 
344 aa  395  1e-109  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00158953  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2134  rod shape-determining protein MreB  58.86 
 
 
339 aa  397  1e-109  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000759245  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1539  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  58.38 
 
 
344 aa  396  1e-109  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.113087  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5269  rod shape-determining protein MreB  56.21 
 
 
343 aa  392  1e-108  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.558763  normal  0.287821 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7285  rod shape-determining protein MreB  58.72 
 
 
349 aa  394  1e-108  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3465  rod shape-determining protein MreB  54.2 
 
 
342 aa  392  1e-108  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.23353  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1211  rod shape-determining protein MreB  56.21 
 
 
343 aa  392  1e-108  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.984944 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1461  rod shape-determining protein MreB  55.79 
 
 
354 aa  392  1e-108  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.473562  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0748  rod shape-determining protein MreB  57.06 
 
 
368 aa  393  1e-108  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.508167  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2089  rod shape-determining protein MreB  56.01 
 
 
347 aa  389  1e-107  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1049  rod shape-determining protein MreB  56.89 
 
 
347 aa  388  1e-107  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000197933  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1529  rod shape-determining protein MreB  58.81 
 
 
342 aa  388  1e-107  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0844761  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2398  rod shape-determining protein MreB  57.49 
 
 
342 aa  389  1e-107  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2110  rod shape-determining protein MreB  57.78 
 
 
342 aa  391  1e-107  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7282  cell shape determining protein MreB  55 
 
 
343 aa  389  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.356683  normal  0.20928 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2509  rod shape-determining protein MreB  55.26 
 
 
347 aa  388  1e-107  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000707423  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1710  rod shape-determining protein MreB  55.26 
 
 
347 aa  388  1e-107  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.08427e-32 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2549  rod shape-determining protein MreB  58.58 
 
 
339 aa  385  1e-106  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0140838  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2866  rod shape-determining protein MreB  55.26 
 
 
347 aa  383  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000181914  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3388  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  55.09 
 
 
344 aa  382  1e-105  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.315024  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0120  rod shape-determining protein MreB  55.26 
 
 
344 aa  383  1e-105  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0117  rod shape-determining protein MreB  55.56 
 
 
344 aa  383  1e-105  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.142106  normal  0.1175 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0113  rod shape-determining protein MreB  55.56 
 
 
344 aa  383  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.308435  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1641  rod shape-determining protein MreB  54.87 
 
 
340 aa  383  1e-105  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000187033  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2468  MreB/Mrl family cell shape determining protein  54.73 
 
 
343 aa  381  1e-105  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.560216 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0131  rod shape-determining protein MreB  55.26 
 
 
344 aa  383  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1388  rod shape-determining protein MreB  55.19 
 
 
343 aa  380  1e-104  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0980  rod shape-determining protein MreB  55.92 
 
 
347 aa  379  1e-104  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000066828  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0900  rod shape-determining protein MreB  58.58 
 
 
340 aa  380  1e-104  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0918  rod shape-determining protein MreB  54.55 
 
 
347 aa  381  1e-104  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000183454  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3594  rod shape-determining protein MreB  55.79 
 
 
348 aa  379  1e-104  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000028278  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0130  rod shape-determining protein MreB  54.68 
 
 
344 aa  378  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5932  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  54.68 
 
 
344 aa  375  1e-103  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.126603  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4158  rod shape-determining protein Mbl  54.47 
 
 
345 aa  376  1e-103  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.53074  normal  0.031954 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0537  rod shape-determining protein MreB  58.38 
 
 
346 aa  375  1e-103  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.433633 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2371  rod shape-determining protein Mbl  57.1 
 
 
345 aa  375  1e-103  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000614585 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0112  rod shape-determining protein MreB  54.68 
 
 
344 aa  377  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0119  rod shape-determining protein MreB  54.39 
 
 
344 aa  377  1e-103  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1687  MreB/Mrl family cell shape determining protein  55.59 
 
 
344 aa  377  1e-103  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.869584  normal  0.143925 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2592  rod shape-determining protein MreB  56.29 
 
 
343 aa  375  1e-103  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3356  rod shape-determining protein MreB  54.49 
 
 
346 aa  372  1e-102  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0692396  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4544  rod shape-determining protein MreB  55.49 
 
 
339 aa  372  1e-102  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4598  rod shape-determining protein MreB  54.98 
 
 
336 aa  373  1e-102  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0663  rod shape-determining protein MreB  55.79 
 
 
339 aa  374  1e-102  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.435022  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4350  rod shape-determining protein MreB  55.49 
 
 
339 aa  372  1e-102  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000471132  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4186  rod shape-determining protein MreB  55.49 
 
 
339 aa  372  1e-102  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.15215  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4197  rod shape-determining protein MreB  55.49 
 
 
339 aa  372  1e-102  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000174477  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4571  rod shape-determining protein MreB  55.79 
 
 
339 aa  374  1e-102  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00556747  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4298  rod shape-determining protein MreB  55.49 
 
 
339 aa  372  1e-102  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4684  rod shape-determining protein MreB  55.49 
 
 
339 aa  372  1e-102  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3167  rod shape-determining protein MreB  56.16 
 
 
338 aa  374  1e-102  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4532  rod shape-determining protein MreB  55.49 
 
 
339 aa  372  1e-102  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4586  rod shape-determining protein MreB  55.49 
 
 
339 aa  372  1e-102  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.176997  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2133  rod shape-determining protein Mbl  55.07 
 
 
343 aa  373  1e-102  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1734  rod shape-determining protein MreB  54.36 
 
 
344 aa  369  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000550029  normal  0.180064 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1461  rod shape-determining protein MreB  54.57 
 
 
347 aa  368  1e-101  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000397491  unclonable  0.000000242005 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0996  rod shape-determining protein MreB  53.29 
 
 
346 aa  368  1e-101  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0162908  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0300  rod shape-determining protein MreB  56.85 
 
 
345 aa  371  1e-101  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0465  rod shape-determining protein MreB  55.13 
 
 
347 aa  369  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000238277  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01791  rod shape-determining protein MreB  54.89 
 
 
350 aa  369  1e-101  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0540  rod shape-determining protein MreB  53.39 
 
 
343 aa  370  1e-101  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.172145 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0398  rod shape-determining protein MreB  55.13 
 
 
347 aa  369  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0857463  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0107  rod shape-determining protein MreB  54.25 
 
 
345 aa  370  1e-101  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0670  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  55.72 
 
 
347 aa  365  1e-100  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002383  rod shape-determining protein MreB  55.43 
 
 
347 aa  367  1e-100  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000533641  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2562  rod shape-determining protein MreB  54.95 
 
 
348 aa  365  1e-100  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.497429  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0252  rod shape-determining protein MreB  54.55 
 
 
347 aa  367  1e-100  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00115776  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2192  rod shape-determining protein MreB  54.95 
 
 
347 aa  365  1e-100  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.728891  hitchhiker  0.00000188341 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4170  rod shape-determining protein MreB  56.55 
 
 
349 aa  367  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000201977  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1404  rod shape-determining protein MreB  52.06 
 
 
348 aa  365  1e-100  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000135004  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3835  rod shape-determining protein MreB  55.13 
 
 
347 aa  367  1e-100  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00197853  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03685  rod shape-determining protein MreB  55.43 
 
 
347 aa  367  1e-100  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4411  rod shape-determining protein MreB  55.13 
 
 
347 aa  367  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000473686  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3677  rod shape-determining protein MreB  54.84 
 
 
347 aa  364  1e-99  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00194737  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03110  cell wall structural complex MreBCD, actin-like component MreB  54.84 
 
 
347 aa  363  2e-99  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000155968  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0456  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  54.84 
 
 
347 aa  363  2e-99  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000227973  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0456  rod shape-determining protein MreB  54.84 
 
 
347 aa  363  2e-99  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00000507844  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1199  rod shape-determining protein MreB  53.11 
 
 
350 aa  364  2e-99  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20741  rod shape-determining protein MreB  53.11 
 
 
350 aa  364  2e-99  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.637014  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4567  rod shape-determining protein MreB  54.84 
 
 
347 aa  363  2e-99  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000238726  normal  0.33905 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3754  rod shape-determining protein MreB  54.09 
 
 
349 aa  364  2e-99  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000701456  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3687  rod shape-determining protein MreB  54.84 
 
 
347 aa  363  2e-99  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000064313  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3734  rod shape-determining protein MreB  54.84 
 
 
347 aa  363  2e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000617813  normal  0.0424676 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>