18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0543 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0543  YcaO-like protein  100 
 
 		 420 aa  867    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000210818 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0840  hypothetical cytosolic protein  26.61 
 
 		 416 aa  79.7  0.00000000000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3627  hypothetical protein  24.03 
 
 		 407 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6320  hypothetical protein  26.34 
 
 		 420 aa  60.5  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.21234  normal  0.37052 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1333  hypothetical protein  27.23 
 
 		 404 aa  58.2  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.157946  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1211  methanogenesis marker protein 1  31.58 
 
 		 403 aa  49.7  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.882639 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4752  hypothetical protein  25.79 
 
 		 384 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0130582 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3472  hypothetical protein  23.89 
 
 		 389 aa  48.1  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4504  hypothetical protein  26.64 
 
 		 745 aa  46.6  0.0009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5737  protein of unknown function DUF181  27.85 
 
 		 750 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3135  hypothetical protein  26.14 
 
 		 745 aa  45.8  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.535305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4992  hypothetical protein  26.14 
 
 		 745 aa  45.8  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.934351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6106  hypothetical protein  55.88 
 
 		 405 aa  45.1  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0977639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1156  hypothetical protein  26.57 
 
 		 204 aa  44.3  0.005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5723  hypothetical protein  26.64 
 
 		 745 aa  44.3  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.250134  normal  0.533402 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5136  hypothetical protein  26.64 
 
 		 745 aa  44.3  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00343987  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0591  NADPH-dependent FMN reductase  26.57 
 
 		 403 aa  43.1  0.01  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0069008  hitchhiker  0.000778526 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3061  hypothetical protein  27.16 
 
 		 736 aa  43.1  0.01  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.493225  normal  0.24084 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>