33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0081 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0081  putative signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 150 aa  296  5e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.273591  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4997  putative signal transduction histidine kinase  51.45 
 
 		 152 aa  124  4.0000000000000003e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1572  putative signal transduction histidine kinase  50.48 
 
 		 161 aa  96.3  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1303  hypothetical protein  44.44 
 
 		 143 aa  89  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0850702  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3463  ATP-binding region ATPase domain protein  33.33 
 
 		 188 aa  65.5  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.218355 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36370  histidine kinase  36.36 
 
 		 157 aa  63.2  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11800  histidine kinase  31.78 
 
 		 157 aa  53.9  0.0000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.243176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1263  response regulator receiver  35.04 
 
 		 282 aa  50.1  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0593741  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6631  putative signal transduction histidine kinase  31.52 
 
 		 135 aa  48.5  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0674873 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3554  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.82 
 
 		 127 aa  47.8  0.00005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3236  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  35.11 
 
 		 137 aa  47.8  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4531  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  28.87 
 
 		 135 aa  47.4  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.556785  normal  0.468222 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2108  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  38 
 
 		 151 aa  46.2  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.262944 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2480  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.87 
 
 		 159 aa  45.4  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.252056 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0743  putative PAS/PAC sensor protein  34.4 
 
 		 855 aa  45.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.565533 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0346  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  36.04 
 
 		 122 aa  45.8  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.108962  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2474  hypothetical protein  35.45 
 
 		 132 aa  45.4  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2031  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  37.93 
 
 		 121 aa  45.1  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2037  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  34.15 
 
 		 182 aa  44.7  0.0004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0429  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30.85 
 
 		 196 aa  43.9  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7320  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  35.05 
 
 		 288 aa  43.5  0.0009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000252308  decreased coverage  0.00000000279842 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1228  putative signal transduction histidine kinase  40.82 
 
 		 169 aa  42.7  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.141602 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3435  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  34.95 
 
 		 164 aa  43.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0121254  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3638  protein serine/threonine phosphatase  33.94 
 
 		 693 aa  42.7  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.718947  normal  0.379759 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0025  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  36.56 
 
 		 226 aa  42.7  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2966  protein serine/threonine phosphatase  35.23 
 
 		 716 aa  42.7  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.451872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1739  PAS/protein phosphatase 2C-like  35 
 
 		 817 aa  41.2  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0976  hypothetical protein  37.11 
 
 		 158 aa  40.8  0.007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1570  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  39.53 
 
 		 135 aa  40.4  0.008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.196284  normal  0.153025 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1327  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  35.85 
 
 		 211 aa  40.4  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2800  putative signal transduction histidine kinase  30.59 
 
 		 135 aa  40.4  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.366639  normal  0.788147 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1779  putative signal transduction histidine kinase  35.64 
 
 		 214 aa  40  0.009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.144417 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1173  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  36.96 
 
 		 180 aa  40.4  0.009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>