22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1698 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1698  Outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  100 
 
 		 206 aa  413  9.999999999999999e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.730307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3596  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  50.75 
 
 		 202 aa  222  4e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2190  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  48.91 
 
 		 203 aa  202  3e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.806503  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2112  hypothetical protein  23.58 
 
 		 214 aa  50.1  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.769057  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1988  outer-membrane lipoprotein carrier protein  27.73 
 
 		 203 aa  47  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.937867  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0106  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  24.69 
 
 		 226 aa  46.6  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0095  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  24.69 
 
 		 226 aa  46.6  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01798  outer-membrane lipoprotein carrier protein  26.67 
 
 		 208 aa  47.4  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003878  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  25.64 
 
 		 208 aa  46.2  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000605758  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1720  outer-membrane lipoprotein carrier protein  26.89 
 
 		 203 aa  45.8  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1830  outer-membrane lipoprotein carrier protein  21 
 
 		 207 aa  45.1  0.0008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0153108 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4003  outer-membrane lipoprotein carrier protein  21 
 
 		 228 aa  45.1  0.0009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0440839  hitchhiker  0.00291295 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0626  outer-membrane lipoprotein carrier protein  27.78 
 
 		 198 aa  43.9  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0165352  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0088  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  23.46 
 
 		 228 aa  43.5  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.700906  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3197  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  24.44 
 
 		 237 aa  42.7  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1574  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  26.17 
 
 		 219 aa  43.1  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.057142  normal  0.0500809 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3585  outer-membrane lipoprotein carrier protein  22.5 
 
 		 206 aa  43.1  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.151832  normal  0.744864 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3608  outer-membrane lipoprotein carrier protein  20.5 
 
 		 207 aa  42.4  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1869  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  22.58 
 
 		 210 aa  42  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1549  outer-membrane lipoprotein carrier protein  19.39 
 
 		 216 aa  41.6  0.008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.483652  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0090  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  22.02 
 
 		 207 aa  41.2  0.01  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.227988  normal  0.252414 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1518  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  23.4 
 
 		 273 aa  41.2  0.01  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>