48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3394 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_0014  hypothetical protein  49.81 
 
 		 814 aa  754    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0661545 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3394  hypothetical protein  100 
 
 		 795 aa  1647    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1404  hypothetical protein  35.86 
 
 		 990 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.549738  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0771  hypothetical protein  39.58 
 
 		 1022 aa  434  1e-120  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0660  hypothetical protein  31.82 
 
 		 815 aa  432  1e-119  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.81909 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1751  hypothetical protein  33.67 
 
 		 779 aa  421  1e-116  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1417  hypothetical protein  33.29 
 
 		 779 aa  413  1e-114  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.196003  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5512  hypothetical protein  36.22 
 
 		 771 aa  411  1e-113  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.807443  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0314  hypothetical protein  33.78 
 
 		 774 aa  402  9.999999999999999e-111  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29441  hypothetical protein  36.3 
 
 		 693 aa  383  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1630  hypothetical protein  33.29 
 
 		 754 aa  374  1e-102  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0729  phosphoenolpyruvate synthase-related protein  37.78 
 
 		 396 aa  205  3e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7106  phosphoenolpyruvate synthase-related protein  33.25 
 
 		 414 aa  177  9.999999999999999e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0728  hypothetical protein  33.05 
 
 		 389 aa  170  1e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.936074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7108  hypothetical protein  34.51 
 
 		 358 aa  169  2.9999999999999998e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3593  PEP-utilising enzyme, mobile region  26.58 
 
 		 1097 aa  59.7  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3610  PEP-utilising enzyme, mobile region  29.18 
 
 		 1240 aa  60.1  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.66232  normal  0.099174 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0751  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  23.49 
 
 		 887 aa  57.4  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0402174 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0133  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding protein  28.19 
 
 		 956 aa  55.8  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.967311  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5613  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  26.62 
 
 		 873 aa  54.7  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.650843  normal  0.554799 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4939  phosphoenolpyruvate synthase  25.25 
 
 		 865 aa  53.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0930681 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2868  phosphoenolpyruvate synthase  24.68 
 
 		 868 aa  52.8  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.424665  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3119  phosphoenolpyruvate synthase  24.45 
 
 		 869 aa  52.4  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2777  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  26.74 
 
 		 975 aa  52.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3116  phosphoenolpyruvate synthase  25.48 
 
 		 868 aa  51.2  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2899  phosphoenolpyruvate synthase  25.48 
 
 		 868 aa  51.2  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.407068  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3294  phosphoenolpyruvate synthase  25 
 
 		 837 aa  51.2  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0441  PEP-utilising enzyme, mobile region  27.68 
 
 		 963 aa  50.1  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.299176 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2960  phosphoenolpyruvate synthase  25.36 
 
 		 866 aa  49.7  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000180391 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2130  phosphoenolpyruvate synthase  24.29 
 
 		 868 aa  49.7  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0384  phosphoenolpyruvate synthase  24.23 
 
 		 907 aa  49.3  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3140  phosphoenolpyruvate synthase  24.26 
 
 		 868 aa  48.5  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.103594  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3137  phosphoenolpyruvate synthase  24.24 
 
 		 868 aa  48.1  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4777  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  28.18 
 
 		 821 aa  48.1  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4726  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  28.77 
 
 		 959 aa  48.1  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0267018  normal  0.466648 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2894  phosphoenolpyruvate synthase  23.97 
 
 		 868 aa  47.8  0.0008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.497322  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3966  phosphoenolpyruvate synthase  38.57 
 
 		 793 aa  47.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0620  phosphoenolpyruvate synthase  27.14 
 
 		 842 aa  47.4  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3108  phosphoenolpyruvate synthase  24.61 
 
 		 868 aa  47  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.721717  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2825  phosphoenolpyruvate synthase  23.93 
 
 		 869 aa  46.6  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3057  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  27.2 
 
 		 811 aa  46.2  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0118124  decreased coverage  0.000000211627 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0607  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  26.38 
 
 		 971 aa  45.8  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1607  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  43.33 
 
 		 587 aa  45.8  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0474  pyruvate, water dikinase  25 
 
 		 906 aa  45.1  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.247096  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1713  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  24.65 
 
 		 867 aa  44.7  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0623992  normal  0.0493713 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1894  Phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase-like protein  37.31 
 
 		 971 aa  45.1  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0623  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  26.34 
 
 		 971 aa  44.3  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.252366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2728  phosphoenolpyruvate synthase  23.83 
 
 		 874 aa  44.3  0.01  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.336193 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>