59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0754 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_0754  small multidrug resistance protein  100 
 
 		 126 aa  239  1e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4588  small multidrug resistance transmembrane protein  38.4 
 
 		 123 aa  73.9  0.0000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.190224  hitchhiker  0.0040913 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2476  transporter  40.35 
 
 		 117 aa  72.4  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000067585  decreased coverage  0.00107573 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2116  putative small multidrug resistance transmembrane protein  37.84 
 
 		 118 aa  70.5  0.000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.380203  normal  0.497912 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1802  putative small multidrug resistance transmembrane protein, DMT superfamily  36.75 
 
 		 123 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.647816  hitchhiker  0.00398859 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1415  small multidrug resistance protein  38.94 
 
 		 123 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.303434  normal  0.334257 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0927  hypothetical protein  40.17 
 
 		 141 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.110405  normal  0.406893 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1768  hypothetical protein  38.05 
 
 		 123 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0433646  normal  0.271127 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1389  hypothetical protein  37.72 
 
 		 123 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2400  drug/metabolite exporter (DME) family protein  37.72 
 
 		 123 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2194  hypothetical protein  37.72 
 
 		 123 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000274513  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1151  hypothetical protein  37.72 
 
 		 123 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.972837  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2274  hypothetical protein  37.72 
 
 		 123 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2236  hypothetical protein  37.72 
 
 		 123 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0018  hypothetical protein  37.72 
 
 		 123 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1879  hypothetical protein  37.72 
 
 		 123 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.659154  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1198  small multidrug resistance protein  35.2 
 
 		 123 aa  65.5  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.969405  normal  0.128153 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1796  hypothetical protein  38.05 
 
 		 123 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5159  hypothetical protein  38.05 
 
 		 123 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.486542  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1259  putative small multidrug resistance transmembrane protein  34.4 
 
 		 123 aa  64.3  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.627101  normal  0.60267 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1858  hypothetical protein  37.17 
 
 		 123 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6221  hypothetical protein  37.17 
 
 		 123 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1882  hypothetical protein  37.17 
 
 		 123 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.226664  hitchhiker  0.00000199647 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3729  transporter protein  29.91 
 
 		 118 aa  63.5  0.0000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000221526  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1132  hypothetical protein  34.71 
 
 		 145 aa  61.2  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5055  transporter  30.51 
 
 		 114 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.539508  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5060  transporter  30.51 
 
 		 114 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3972  hypothetical protein  33.88 
 
 		 125 aa  59.7  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0829336  normal  0.0274812 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0826  hypothetical protein  31.06 
 
 		 150 aa  58.5  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3978  putative small multidrug resistance transmembrane protein  38.95 
 
 		 123 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.824098  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3408  hypothetical protein  32.08 
 
 		 121 aa  56.6  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0526043  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2966  hypothetical protein  31.2 
 
 		 139 aa  56.6  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2385  small multidrug resistance transmembrane protein  38.3 
 
 		 123 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.147787 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0853  hypothetical protein  28.8 
 
 		 139 aa  55.1  0.0000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0100048  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0801  hypothetical protein  28.8 
 
 		 159 aa  54.7  0.0000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.351912  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3453  hypothetical protein  30.84 
 
 		 113 aa  54.3  0.0000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4515  transporter protein  33.04 
 
 		 123 aa  54.3  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0688727 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1356  hypothetical protein  34.45 
 
 		 130 aa  51.6  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.652272  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1323  putative small multidrug resistance transmembrane protein  36 
 
 		 123 aa  51.2  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.484105  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2922  hypothetical protein  33.33 
 
 		 130 aa  48.9  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2694  hypothetical protein  35.19 
 
 		 108 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0340055  normal  0.21056 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2226  putative small multidrug resistance transmembrane protein  33.02 
 
 		 112 aa  47.4  0.00007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.545131  hitchhiker  0.00000175504 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0955  hypothetical protein  27.72 
 
 		 115 aa  47  0.00008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00515656  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0573  hypothetical protein  27.97 
 
 		 118 aa  47  0.00008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.454488  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2232  hypothetical protein  34.38 
 
 		 138 aa  46.6  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.791357  normal  0.0104044 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3229  hypothetical protein  32.5 
 
 		 112 aa  46.2  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.995435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2416  hypothetical protein  35 
 
 		 119 aa  46.6  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.711582  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1038  hypothetical protein  29.84 
 
 		 122 aa  45.8  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.550209 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3052  hypothetical protein  28.85 
 
 		 122 aa  46.2  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0765  putative small multi-drug resistant family protein  31.71 
 
 		 113 aa  45.4  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2196  small multidrug resistance protein  32.76 
 
 		 111 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.241986 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2073  hypothetical protein  37.07 
 
 		 127 aa  45.4  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0093  conserved hypothetical protein; inner membrane protein  26.17 
 
 		 112 aa  45.1  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2846  hypothetical protein  34.25 
 
 		 114 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.367285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1892  hypothetical protein  29.41 
 
 		 116 aa  44.7  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.156341  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3364  hypothetical protein  29.81 
 
 		 122 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0304  hypothetical protein  26.67 
 
 		 120 aa  41.6  0.003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00945381  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4064  hypothetical protein  28 
 
 		 140 aa  40.8  0.007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2747  hypothetical protein  28.85 
 
 		 122 aa  40  0.01  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000323664 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>