23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4210 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4210  hypothetical protein  100 
 
 		 313 aa  613  9.999999999999999e-175  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.672369  normal  0.890959 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3435  hypothetical protein  42.19 
 
 		 281 aa  177  2e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0049  hypothetical protein  34.19 
 
 		 265 aa  145  8.000000000000001e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.732388  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2260  aminotransferase class IV  35.22 
 
 		 248 aa  144  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00278928  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0184  hypothetical protein  31.49 
 
 		 259 aa  138  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15150  branched-chain amino acid aminotransferase/4-amino-4-deoxychorismate lyase  35.31 
 
 		 273 aa  137  3.0000000000000003e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.784526  normal  0.178512 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0051  aminotransferase class IV  32.9 
 
 		 259 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5090  hypothetical protein  32.7 
 
 		 283 aa  125  8.000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.643295  normal  0.669557 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1152  hypothetical protein  32.9 
 
 		 270 aa  120  1.9999999999999998e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5272  hypothetical protein  37.88 
 
 		 271 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.161023 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3082  hypothetical protein  32.58 
 
 		 259 aa  115  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0994  hypothetical protein  37.75 
 
 		 272 aa  112  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02146  hypothetical protein  30 
 
 		 265 aa  112  1.0000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.957263  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4101  hypothetical protein  28.43 
 
 		 271 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.773916  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3563  aminotransferase class IV  35.48 
 
 		 262 aa  108  8.000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2963  hypothetical protein  28.71 
 
 		 283 aa  100  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16800  branched-chain amino acid aminotransferase/4-amino-4-deoxychorismate lyase  28.57 
 
 		 292 aa  46.6  0.0005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.039827 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0329  aminotransferase, class IV  26.4 
 
 		 315 aa  46.6  0.0006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.13706 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0629  hypothetical protein  26.23 
 
 		 271 aa  45.8  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0645  hypothetical protein  26.23 
 
 		 271 aa  45.4  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5918  aminotransferase class IV  34.42 
 
 		 261 aa  44.3  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2112  putative aminotransferase  28.1 
 
 		 280 aa  43.9  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0716  aminotransferase, class IV  20.49 
 
 		 295 aa  43.5  0.005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0327665  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>