46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0367 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_0367  FHA domain-containing protein  100 
 
 
529 aa  989    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.216513  decreased coverage  0.000756141 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4250  FHA domain-containing protein  49.84 
 
 
547 aa  361  2e-98  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.596037  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0184  FHA domain containing protein  49.25 
 
 
213 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4558  FHA domain-containing protein  49.59 
 
 
233 aa  116  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.734696  normal  0.600956 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4402  FHA domain containing protein  46.38 
 
 
236 aa  114  6e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0891871  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4947  FHA domain-containing protein  43.06 
 
 
187 aa  102  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.337015  normal  0.997084 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2460  FHA domain-containing protein  47.58 
 
 
325 aa  100  9e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0199195  normal  0.586989 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2164  Forkhead-associated protein  41.86 
 
 
303 aa  95.9  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3067  FHA domain containing protein  33.91 
 
 
272 aa  90.5  7e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000453699 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3733  FHA domain containing protein  40 
 
 
172 aa  62  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.399873  normal  0.0527204 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1462  FHA domain-containing protein  39.81 
 
 
173 aa  58.9  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.129326  normal  0.623454 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2395  FHA domain-containing protein  44.44 
 
 
505 aa  55.8  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2769  FHA domain-containing protein  44.94 
 
 
526 aa  54.3  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1632  large adhesin  29.24 
 
 
2914 aa  53.9  0.000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2161  FHA domain-containing protein  36.7 
 
 
173 aa  53.1  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000261776 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3940  RDD domain-containing protein  38.64 
 
 
349 aa  50.1  0.00009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.10018  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2822  FHA domain-containing protein  40.86 
 
 
247 aa  49.7  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000875758  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3039  FHA domain containing protein  33 
 
 
414 aa  49.7  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3276  serine/threonine kinase protein  47.44 
 
 
475 aa  48.9  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.162967  normal  0.186689 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2862  serine/threonine protein kinase with FHA domain protein  44.87 
 
 
461 aa  48.5  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0331912  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2541  FHA domain-containing protein  39.36 
 
 
247 aa  48.1  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00963691 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1844  protein kinase  46.15 
 
 
485 aa  48.1  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2114  FHA domain containing protein  48.33 
 
 
121 aa  47.4  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.508953  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0701  serine/threonine kinase protein  41.94 
 
 
500 aa  47  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000041573  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2044  FHA domain containing protein  48.33 
 
 
121 aa  47  0.0008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27030  FHA domain-containing protein  29.9 
 
 
474 aa  46.2  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3815  FHA domain containing protein  30 
 
 
255 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5037  FHA domain containing protein  23.11 
 
 
235 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.332272 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1226  FHA domain-containing protein  35.23 
 
 
177 aa  45.4  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2708  FHA domain containing protein  37.18 
 
 
263 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.042803  hitchhiker  0.0000000030829 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4044  FHA domain-containing protein  35.42 
 
 
172 aa  45.8  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14970  FHA domain-containing protein  36.17 
 
 
152 aa  45.8  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0364194  normal  0.592543 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0534  FHA domain-containing protein  36.84 
 
 
272 aa  45.1  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.895952  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07300  FHA domain-containing protein  36.71 
 
 
144 aa  44.7  0.004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4002  FHA domain-containing protein-like protein  35.23 
 
 
171 aa  44.7  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.759759  normal  0.749355 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1482  FHA domain containing protein  39.47 
 
 
237 aa  44.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.30072  normal  0.365502 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1456  FHA domain containing protein  39.47 
 
 
237 aa  44.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1816  FHA domain-containing protein  44.26 
 
 
121 aa  45.1  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4430  FHA domain-containing protein  31.25 
 
 
440 aa  44.7  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.206404 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44441  predicted protein  27.42 
 
 
4500 aa  44.3  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1426  FHA domain containing protein  46.55 
 
 
145 aa  44.3  0.006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0756  FHA domain containing protein  34.12 
 
 
514 aa  44.3  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.845167 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4645  adenylate/guanylate cyclase  33.73 
 
 
546 aa  43.5  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.98897  normal  0.0884819 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2125  FHA domain-containing protein  38.03 
 
 
282 aa  43.5  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.473494  normal  0.523626 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4098  FHA domain containing protein  40.3 
 
 
325 aa  43.5  0.01  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.124335  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1521  FHA domain-containing protein  37.18 
 
 
295 aa  43.5  0.01  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0111872  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>